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看一篇发表在NC上的使用DL来预测糖类结合位点(DeepGlycanSite)的文章。
工欲善其事,必先利其器。使用LaTex写作感觉和写代码差不多,都需要一个好的IDE,Coding我喜欢用VS code,sublime。而LaTex写作,因为我...
新型抗生素药物的研发是当今的热点话题。今天介绍一篇发表在Cell Chemical Biology的抗生素研发的文章,传统抗生素多针对细菌活跃代谢时期,而作者针...
这篇文章介绍了一种利用机器学习从大量宏基因组和微生物基因组数据中识别抗菌肽(AMPs)的方法。研究团队创建了一个名为AMPSphere的数据库,包含863,49...
人类是一个精密的工具,其内部由无数的分子机器,不断的运转,提供能量,修饰,翻译,等等作用。这些机器主要由蛋白质,核酸,以及其余分子等等组成。如何预测,观察他们的...
各位观众,劳动节快乐。今天介绍一篇发表在Briefings in Bioinformatics,劳动节期间见刊的文章。
之前追过一篇AF的最新文章,官方称之为AlphaFold-latest,他可以预测蛋白质和小分子,蛋白质和核酸的复合物结构,对于传统复合物预测方法来说是降维式打...
PyMol由 Warren L. DeLano所创造,目前由薛定谔公司所维护,是结构生物学方面重要的可视化软件之一,简单易上手。大家所熟知的PyMol已经于3月...
硬纤维瘤是一种罕见的良性(非癌性)肿瘤,发生于人体内的结缔组织(Connective tissue)中。成纤维细胞(fibroblast cells)构成结缔组...
今天介绍一篇发表于23年的文章,Khan等人开发了名为AntBO的工具,这是一种利用组合贝叶斯优化来进行抗体设计的方法。AntBO可对各种抗原进行高效的体外设计...
治疗性抗体目前是生物疗法中最大的类别,因为它们的靶点特异性较好和结合亲和力较高。传统的抗体开发过程是基于主要的经验性方法,虽然成熟稳健,但繁琐且有显著的缺陷。最...
Target-based 药物发现是当前的主流范式,然而目前缺乏对其实际效率的全面评估。这里对约32000篇文章和专利进行系统回顾,追溯至150年前,展示了其明...
天然的蛋白质通常具有形状互补性来生成适合功能的体系结构,这是进化选择的结果,目前的设计方法无法实现。在本文中,作者描述了一种Top-down的强化学习方法:在整...
在进行抗体药物研发时,当冷冻电镜的数据分辨率比较低,可以通过测序信息来辅助进行序列鉴定。
在本文中研究团队提出了一种基于深度学习的可解释方法,用于发现新型抗生素结构。通过神经网络学到的抗生素活性相关的化学亚结构被用于预测抗生素的结构类别。研究团队通过...
今天介绍一些测评类文章,主要看看AF2在抗体预测方面的表现。先来简要回顾一下Alphafold的历程。在2018年的CASP(Critical Assessme...
这篇文章介绍了如何注册、使用以及充分利用GPT,一个强大的人工智能语言模型。作者分享了关于V**和虚拟手机号码的注册技巧,以及使用GPT-4进行各种任务的方法,...
相干伊辛机(Coherent Ising Machine, CIM)是一种基于实验物理学的计算机,用于解决组合优化问题,它使用相干光振荡器网络来模拟伊辛模型,实...
ChatGPT-4是由OpenAI开发的人工智能模型,相较于前一版本GPT-3.5,它具有更强大的语言理解和生成能力。GPT-4在处理复杂查询、提供更准确、更细...
在2023年,Large Language Model(LLM) 给了我们一点小小的GPT震撼,GPT在某些领域极速的提高的人类的生产效率,甚至于我觉得已经可以...
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