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大环类药物在调控蛋白–蛋白相互作用等困难靶点方面具有独特优势，但其细胞膜通透性通常较差且难以预测，严重制约了口服成药性评估。实验测定成本高昂，而基于三维构象的计...

核糖开关是一类能够在配体结合后发生构象变化、从而调控基因表达的结构化 RNA 分子。研究人员提出一种基于受限玻尔兹曼机（Restricted Boltzmann...

大语言模型(LLM)的出现正在通过加速假设生成和数据分析深刻影响学术研究。LLM能够帮助研究者从海量数据中识别模式和洞见，从而促进创新性科学发现。然而，在高度复...

蛋白稳定性变化预测对疾病机制解析与蛋白工程至关重要，但受限于数据偏倚与模型泛化能力，长期难以规模化应用。研究人员提出 SPURS，一种通过模型重构（rewiri...

药物发现和开发是一个复杂的多阶段过程，涉及靶点识别和验证、先导化合物发现、作用机理阐明、疗效和毒性评估，以及随后的临床试验和监管审批。得益于冷冻电镜、质谱方法、...

今年最受关注的新闻，充分展现了生物技术的创造力，也值得被铭记与庆祝：从在极短时间内治愈罕见遗传病患儿“baby KJ”的基因编辑突破，到诱导 HIV“现身”并被...

单细胞测序为重建生物系统的动态过程提供了关键线索，但细胞命运决定同时受到确定性调控与随机波动的共同影响。现有方法多聚焦于确定性动力学，对随机性建模不足。研究人员...

英矽智能（Insilico Medicine）是一家处于临床阶段、由生成式人工智能（AI）驱动的生物科技公司。12 月 10 日，公司举办了第四期 Pharma...

在结构生物学与药物发现的交叉领域，AlphaFold3（AF3）的问世不仅颠覆了蛋白质结构预测范式，更将其能力拓展至蛋白质-配体复合物建模，为结构基虚拟筛选（S...

与此同时，大语言模型在医学文本理解和临床推理任务中展现出强大能力，能够从电子病历中提取复杂语义信息。然而，仅依赖语言模型也存在忽略客观生理信号的风险。如何将结构...

研究人员首先构建了一个统一的高密度筛选流程，在每一对药物之间生成完整且可重复的剂量响应矩阵。该流程在数据质量、归一化和协同量化方面均表现出良好稳定性，为后续建模...

单细胞扰动技术为系统性解析基因功能和调控网络提供了重要工具，但大规模、组合式扰动实验在实践中面临高昂成本与复杂度。为此，大量计算方法被提出用于预测单细胞层面的扰...

Digital Discovery 是英国皇家化学会 2021 年推出的新刊，开领域之先河，乘自动化与数字化科研技术之东风，致力于成为数据驱动型科研成果的高质量...

课题组的研究成果近年持续发表在国际顶级期刊如Nature Methods、Nature Biotechnology、Nature Metabolism、Natu...

本文介绍由浙江大学侯廷军教授和谢昌谕教授团队发表的一篇关于加速炼金术自由能计算的最新研究工作。在该研究中，作者提出了一个全新的炼金术路径感知的图神经网络框架La...

靶向 RNA 的小分子药物被视为调控细胞通路与治疗复杂疾病的重要新策略，为非蛋白靶向药物开发提供广阔空间。然而，现有方法在小分子配体的发现能力与适用性上仍存在显...