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发表了文章 2小时前2025-03-06 23:04:33

LAMAR：基于预训练语言模型的RNA调控解析新方法

RNA作为生命活动中的核心分子，在基因表达调控和蛋白质合成中扮演关键角色。其代谢过程，包括剪接、翻译和降解等，受到多种顺式调控元件和反式因子的协同作用，表现出高...

实验盒 2小时前2025-03-06 23:04:33

基础、模型、数据、效率、翻译

发表了文章 3小时前2025-03-06 22:02:56

MIT与微软联合发布CleaveNet：基于生成式AI的蛋白酶底物预测与从头设计

蛋白酶作为生物体内重要的催化酶，通过特异性切割肽键，参与调控多种生理和病理过程，例如伤口愈合、组织重塑及癌症转移等。设计能够被特定蛋白酶高效识别和切割的肽段底物...

实验盒 3小时前2025-03-06 22:02:56

系统、效率、工具、开发、设计

发表了文章 2天前2025-03-04 21:14:49

ProDMM：跨模态Transformer模型实现蛋白质与DNA互作预测与生成

蛋白质与非编码DNA（NCDS）的相互作用是调控基因表达和代谢通路的关键，但其复杂性长期制约着高效生物工程的发展。传统方法依赖实验试错，耗时耗力；而现有深度学习...

实验盒 2天前2025-03-04 21:14:49

编码、模型、设计、数据、系统

发表了文章 3天前2025-03-03 21:54:39

UKBioBERT：融合UK BioBank遗传变异的基因组大语言模型

对于揭示基因调控机制、理解复杂性状的遗传基础，基因表达预测具有重要意义。近年来，深度学习技术的进步推动了序列到功能（sequence-to-function）模...

实验盒 3天前2025-03-03 21:54:39

性能、架构、模型、设计、数据

发表了文章 3天前2025-03-03 21:54:34

Nature｜突破小样本瓶颈，表格基础模型革新小数据预测

表格数据是众多研究的基础，例如基因表达矩阵、药物属性表和临床记录等。这些数据通常样本量有限，特征复杂多样，且常伴随缺失值、噪声和异常值，如何从中提取可靠的预测结...

实验盒 3天前2025-03-03 21:54:34

性能、表格、基础、模型、数据

发表了文章 3天前2025-03-03 21:54:28

GPT模型如何重塑癌症药物敏感性预测？最新研究揭秘新突破

近期，Mayo Clinic 的 Chowdhury 等人在 bioRxiv 上发表了一项创新研究，题为《SensitiveCancerGPT: Leverag...

实验盒 3天前2025-03-03 21:54:28

gpt、模型、数据、性能、优化

发表了文章 6天前2025-02-28 15:34:22

Nat. Mach. Intell.｜大语言模型助力分子属性预测，驱动科学发现新范式

在药物研发和材料科学领域，分子属性预测（如溶解度、血脑屏障通透性）是决定实验成败的关键。然而，传统方法依赖人工经验或复杂神经网络，存在可解释性差、知识整合困难等...

实验盒 6天前2025-02-28 15:34:22

模型、数据、优化、自动化、nat

发表了文章 7天前2025-02-27 21:18:45

LigUnity：蛋白质-配体亲和力预测大模型，虚拟筛选与先导化合物优化双管齐下

蛋白质与配体相互作用的研究是理解药物疗效和推动分子设计的关键。蛋白质-配体亲和力，即潜在药物分子与靶点蛋白结合的强度，直接影响药物筛选和优化的效果。在药物研发的...

实验盒 7天前2025-02-27 21:18:45

机器学习、模型、数据、性能、优化

发表了文章 8天前2025-02-26 21:51:00

继Evo 2后Arc Institute带来巨无霸单细胞数据集，智能体助力虚拟细胞模型构建

近期，Arc Institute 与NVIDIA、斯坦福大学等合作推出了震撼的Evo 2——迄今为止规模最大的生物基因组大模型（从Evo到Evo 2：Arc ...

实验盒 8天前2025-02-26 21:51:00

模型、数据、数据库、工具、基础

发表了文章 9天前2025-02-25 19:59:13

蛋白质语言模型新进展：隐式结构模型如何将结构信息融入序列表示

蛋白质语言模型（Protein Language Models, pLMs）已成为研究蛋白质序列与功能之间关系的重要工具。这些模型通过自监督学习从蛋白质序列中提...

实验盒 9天前2025-02-25 19:59:13

监督学习、模型、设计、数据、性能

发表了文章 9天前2025-02-25 19:58:56

Science研究新突破，利用免疫受体测序与深度学习诊断疾病

在医学诊断领域，传统的检测手段主要包括体格检查、病史回顾、实验室检测和影像学检查。然而，这些方法往往未能充分利用人体免疫系统中B细胞和T细胞受体（BCR和TCR...

实验盒 9天前2025-02-25 19:58:56

模型、数据、机器学习、深度学习、框架

发表了文章 9天前2025-02-25 08:41:59

LLM与多智能体驱动的化学合成开发平台：从文献搜索到产品纯化的全自动化

在药物发现和工艺开发中，设计合适的合成反应和路线是核心任务之一，通常需要耗费大量时间和成本。传统的合成反应设计依赖于化学家和工程师通过反复的实验设计-执行-测试...

实验盒 9天前2025-02-25 08:41:59

搜索、LLM、自动化、产品、开发

发表了文章 9天前2025-02-25 08:41:08

Nat. Mach. Intell.｜统一交叉注意力模型预测抗原与HLA和TCR的结合特异性

免疫检查点抑制剂已在多种肿瘤类型中显示出显著的临床疗效，但其受益患者比例依然较低。肿瘤抗原（即新抗原）与人类白细胞抗原（HLA）及T细胞受体（TCR）的结合决定...

实验盒 9天前2025-02-25 08:41:09

nat、测试、模型、数据、性能

发表了文章 13天前2025-02-21 13:29:50

scLong：单细胞组学“长距离”基因上下文捕捉基础模型

在单细胞转录组学（scRNA-seq）领域，基础模型（foundation model）正逐渐成为分析海量单细胞数据的强大工具。这些模型通过自监督学习，能够捕捉...

实验盒 13天前2025-02-21 13:29:50

网络、效率、基础、模型、数据

发表了文章 14天前2025-02-20 12:42:28

从Evo到Evo 2：Arc Institute推出全新升级版基因组大模型

基因组语言模型（Genomic Language Models）逐渐成为研究热点。2024年，Arc Institute的Brian L. Hie和Patric...

实验盒 14天前2025-02-20 12:42:28

生物基因、架构、模型、设计、数据

发表了文章 15天前2025-02-19 23:00:22

sciLaMA：融合大语言模型先验知识的单细胞分析框架

单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术近年来在细胞异质性和转录组动态研究中的应用越来越广泛。然而，由于技术噪音、稀疏测量和批次效应等问题，scRNA-seq...

实验盒 15天前2025-02-19 23:00:22

框架、模型、设计、数据、数据分析

发表了文章 15天前2025-02-19 23:00:03

EpiFoundation：单细胞ATAC-seq基础模型

单细胞ATAC-seq（scATAC-seq）作为一种重要的表观遗传学技术，能够揭示单个细胞中染色质的可及性，从而识别启动子、增强子和转录因子结合位点等调控元件...

实验盒 15天前2025-02-19 23:00:03

数据分析、基础、论文、模型、数据

发表了文章 16天前2025-02-18 13:22:45

Science｜David Baker新突破，从头设计丝氨酸水解酶

酶作为生物催化剂，在温和条件下能够显著加速化学反应，其设计和优化对于生物工程、药物开发以及环境科学等领域具有深远的意义。近期，诺贝尔奖得主David Baker...

实验盒 16天前2025-02-18 13:22:45

设计、效率、优化、深度学习、工具

发表了文章 16天前2025-02-18 13:22:17

阿里联手中科大与港科大发布长上下文基因组基础模型GENERator

在基因组学领域，随着DNA测序技术的飞速发展，我们已经能够以前所未有的速度和精度解析生物的基因组序列。然而，如何准确预测和解读这些序列的功能，依然是一个巨大的挑...

实验盒 16天前2025-02-18 13:22:18

基础、模型、设计、数据、generator

发表了文章 16天前2025-02-18 13:21:46

Sci. Adv.｜自监督机器学习在蛋白质设计的优势与挑战

近年来，机器学习（ML）在计算蛋白质设计领域取得了显著进展，数据驱动的方法在实验成功率上逐渐超越了传统的基于生物物理的方法。然而，这些方法大多以案例研究的形式呈...

实验盒 16天前2025-02-18 13:21:46

数据、机器学习、框架、模型、设计

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