说过好多次要汇总在分析单细胞数据时候用到的marker基因，因为不同组织中还是有些特异的marker基因的！

之前我们分享过单细胞自动注释包GPTtypecell的使用方法。今天我们详细介绍一下细胞类型注释的内容，并且学习手动注释是如何实现的。

今天要介绍的项目是marker，就可以很好的解决这个问题，marker是一款基于深度学习模型的将PDF转换成Markdown格式的工具。官方github地址如下...

PDF 是一种结构复杂的文件格式。FastGPT 内置的 PDF 解析器使用 pdfjs 库进行解析，这种基于逻辑的解析方式在处理简单文本时表现良好，但在遇到图...

众所周知，单细胞数据分析最磨人的环节就是确定不同的单细胞亚群的生物学名字，而且每个领域都有自己的特殊性，所以我们耗费了大量的时间做了一些亚群及其对应的marke...

轨道添加一个 Time Machine Clip，在Insperctor面板进行如下设置：

C4看起来不像中性粒细胞呀，其中RPL5、RPS12、RPL13、RPL4、RPL10和RPL23A都是核糖体相关蛋白而非中性粒细胞特异性marker，此外HL...

临床上，是否可以根据成熟与不成熟中性粒细胞的marker进行流式细胞检测，跟踪患者预后？

C4看起来不像中性粒细胞呀，其中RPL5、RPS12、RPL13、RPL4、RPL10和RPL23A都是核糖体相关蛋白而非中性粒细胞特异性marker，此外HL...

在ncount_RNA 和nFeature_RNA辅助过滤中，使用小提琴图对所有细胞中检测到的分子总数（ncount_RNA ）以及基因数量（nFeature_...

分享一下最近看到的2篇paper关于骨骼肌组织的细胞Marker，绝对的Atlas级好东西。👍

文章标题：《Single-cell transcriptome atlas of the human corpus cavernosum》

文章：Zhao, J., Wang, Y., Feng, C., Yin, M., Gao, Y., Wei, L., ... & Li, C. (2024)....

我们在进行单细胞亚群命名时，是通过Marker基因来确定细胞的身份。然而在注释过程中，Marker基因的可视化是必不可少的，以前我们做了一个投票：可视化单细胞亚...

标记基因（marker gene）的概念与差异表达（DE）基因的概念密切相关，但两个概念并不是不同义词。严格来说，标记基因选择是DE基因鉴定的一个子集，有效且有...

最近在复现一篇文章《A comprehensive single-cell map of T cell exhaustion-associated immune...

有趣的是，从VITA单细胞平台数据中发现的这些lncRNA marker与各个细胞类型的mRNA marker呈现出明显的相关性（图5），进一步为这些lncRN...

Marker 能够将 PDF、EPUB 和 MOBI 文件转换为 Markdown 格式。它比 nougat 快 10 倍，在大多数文档上更准确，并且具有较低的...