暂无搜索历史
a,散点图显示化疗与生物标志物交互项的log2(HR)与- log10(交互项P值)的关系。蓝色和红色点分别代表PDAC辅助化疗的有利和不利蛋白质组学生物标志物...
a,PDAC的LASSO模型。左侧面板显示LASSO-Cox回归模型中14种蛋白质的回归系数。
a,WGCNA识别出32个在肿瘤样本的蛋白质组学数据中富集的功能蛋白模块(ME01–32)。
涉及4787种可分析蛋白质的主成分分析(PCA)揭示了肿瘤和TACs之间明显的分离。
前面,我们尝试了对单细胞或者空间转录组细胞通讯结果进行可视化,相关的准备的帖子有:
单细胞数据来自 Shih et al PLoS ONE 13(11): e0206785, GEO编号:https://www.ncbi.nlm.nih.gov...
此外,我们生信技能树每个月都有一期带领初学者,0基础的生信入门培训,会有各种贴心的答疑,甚至是新叶老师给你的一对一专属答疑,远程代码演示,快来:最新一期在8月4...
今天的学习内容为,后面需要使用MIA来对4张空转的切片数据进行注释,使用一个单细胞数据作为reference,处理步骤如下:
但是万万没想到大家会在可视化方面栽跟头,比如这个2022的文章:《Single-cell RNA sequencing identifies a paracri...
小丽是一位25岁的胆管癌患者。根据当时的临床指南,她开始接受标准治疗方案:顺铂 + 吉西他滨(GemCis)联合度伐利尤单抗(Durvalumab)。然而,治疗...
面对阴性结果,有一些“机智地”小伙伴就会“悄咪咪”的通过“秦桧法”和“赵高法”选择性的人造阳性结果,反正就是发个文章混个日子。这样非常的不好,因为实验细节是没办...
我们生信技能树每个月都有一期带领初学者,0基础的生信入门培训,会有各种贴心的答疑,甚至是新叶老师给你的一对一专属答疑,远程代码演示,快来:最新一期在8月4号,感...
前面我们分享了两篇空转反卷积的方法测评,其中RCTD位于推荐榜首,今天就用这篇文献《Integrating spatial transcriptomics an...
fig1给我们展示了相关的单细胞结果以及几个具有代表性的空转的cell2location的反卷积结果:
万能的网友又给我支招了,这次给我推荐了一个我试过了后觉得超棒的方法:使用 schard 包进行转换,一行代码就可!
今天的学习内容为,将空转的聚类结果与空转切片结合起来,绘制带有位置的聚类图。空转的四张片子如下:
Circos 可以用来将表格转换成图像。将枯燥的表格转换成信息丰富且视觉上引人入胜的数据图形!
当然了,也有好多人因为淋过雨所以也不希望其他人过的太顺利,哪怕是被审稿人或者杂志要求公开测序数据,也是装模作样的搞一个fastq文件,增加大家使用数据的门槛。更...
PyComplexHeatmap 是一个用于绘制复杂热图(聚类热图)的 Python 包,专为生物数据设计。这个模块的官网如下:
此外,我们生信技能树每个月都有一期带领初学者,0基础的生信入门培训,会有各种贴心的答疑,最新一期在8月4号,感兴趣的可以去看看呀:生信入门&数据挖掘线上直播课8...
暂未填写个人简介
暂未填写学校和专业
暂未填写个人网址