天意生信云

文章/答案/技术大牛

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发表了文章 12天前2025-09-30 14:53:26

三代测序100问（17）：纳米孔测序平台自适应采样技术的应用

在上一期《三代测序100问》中，我们揭示了纳米孔测序平台自适应采样（Adaptive Sampling）技术的革命性原理——它将靶向富集从繁琐的湿实验台，巧妙...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:53:26

原理、软件、设计、算法、效率

发表了文章 12天前2025-09-30 14:53:14

宏基因组进阶：从初级 MAGs 到发表级基因组的精细化质控

经过了 De Novo 组装和自动化分箱，我们已经成功从复杂的宏基因组数据中重建出了一批微生物基因组草图 (MAGs)。但是，这些 MAGs 准备好用于下游...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:53:14

服务器、工具、教程、软件、数据库

发表了文章 12天前2025-09-30 14:52:07

宏基因组进阶：从 Contigs 到高质量基因组草图 (MAGs) 的分箱实战

在上一篇教程中宏基因组组装实战教程 (MEGAHIT + BBMap + BWA)，我们成功将测序 reads 组装成了 contigs，并计算了它们的覆盖深度...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:52:07

工具、教程、配置、软件、服务器

发表了文章 12天前2025-09-30 14:51:47

三代测序100问（16）：纳米孔测序平台自适应采样技术的原理

随着三代测序技术的深入发展，研究者的目光已不再仅仅满足于获取基因组的序列信息。一个日益增长的需求是，如何在对特定基因组区域进行测序的同时，完整地保留其天然的碱基...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:51:48

硬件、原理、设计、算法、系统

发表了文章 12天前2025-09-30 14:50:20

宏基因组组装实战教程 (MEGAHIT + BBMap + BWA)

在前面的文章我们用Claude code辅助完成了宏基因组测序数据的质控和去宿主Claude code做宏基因组数据质控、手把手教你指挥KneadData精准“...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:50:20

服务器、教程、排序、软件、数据

发表了文章 12天前2025-09-30 14:50:05

宏基因组分析的黄金搭档：通用工具链与高性能服务器

从原始序列到功能图谱，以下是宏基因组分析链中涉及的各个工具和数据库的详细介绍。每个工具都有其独特的功能和应用场景，帮助完成从数据质量控制、分类分析、功能注释到最...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:50:05

数据库、服务器、高性能、工具、数据

发表了文章 12天前2025-09-30 14:49:39

三代测序100问（15）：三代纳米孔测序平台的DRS测序适合什么研究？

在转录组学的研究版图中，基于cDNA的测序方法无疑是应用最广泛的技术。然而，随着研究的深入，科学家们不再仅仅满足于知晓哪些基因被表达，更渴望探究RNA分子在细胞...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:49:40

效率、翻译、算法

发表了文章 12天前2025-09-30 14:48:20

三代测序100问（14）：三代纳米孔测序是否适用于短片段DNA？

当我们谈及三代纳米孔测序，脑海中浮现的第一印象往往是其无与伦比的长读长能力，从数万碱基（kb）到数兆碱基（Mb），它为基因组学研究带来了革命性的突破。然而，生命...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:48:20

模型、算法、芯片、优化、连接

发表了文章 12天前2025-09-30 14:47:57

三代测序100问（13）：三代纳米孔测序到底能测多长？

在三代测序技术的璀璨星空中，纳米孔测序以其独特的“实时、长读长”特性而备受瞩目。一个常常萦绕在研究者，特别是初学者心头的问题便是：“纳米孔测序到底能测多长？在时...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:47:57

芯片、优化、原理、工作、数据

发表了文章 12天前2025-09-30 14:47:25

手把手教你指挥KneadData精准“斩断”宏基因组宿主干扰

在上一期推文中Claude code做宏基因组数据质控，我们展示了如何利用Claude code辅助完成宏基因组数据的质量控制。高质量的“Clean Reads...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:47:25

软件、数据、索引、自动化、工具

发表了文章 12天前2025-09-30 14:46:03

三代测序100问（12）：三代测序细菌完成图值得做吗？

在微生物学研究的广阔天地里，基因组测序已成为解析细菌遗传密码、探索其生命奥秘的基础性工具。然而，当研究者们准备启动一个细菌基因组项目时，常常会面临一个关键的十字...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:46:03

数据库、对象、基础、框架、数据

发表了文章 12天前2025-09-30 14:45:54

三代测序100问（11）| 有一键进行三代全长转本的组装和定量的分析工具吗？

在上一期《三代测序100问》中，我们详细探讨了经典工具StringTie如何在三代全长转录组分析中大展身手，特别是结合Minimap2进行比对后的组装和定量。然...

天意生信云 12天前2025-09-30 14:45:54

工具、软件、设计、性能、重构

发表了文章 2025-08-132025-08-13 14:38:41

CPU、内存、存储：生信分析任务的服务器配置精要

生物信息学分析通常涉及大规模数据处理和计算密集型任务，因此需要高性能的服务器支持。根据不同的分析任务和数据量，服务器配置的要求也有所不同。今天就汇总一下不同分析...

天意生信云 2025-08-132025-08-13 14:38:41

内存、存储、cpu、服务器、服务器配置

发表了文章 2025-08-072025-08-07 08:58:34

时隔5年，OpenAI 再次开源2款推理模型！笔记本、手机可运行

OpenAI 终于不再“Close”！继 Claude 推出 Opus 4.1 后，OpenAI 也不甘示弱，一下子发布了两款开源模型：gpt-oss-120b...

天意生信云 2025-08-072025-08-07 08:58:34

openai、工具、模型、手机、开源

发表了文章 2025-08-072025-08-07 08:58:09

Claude Opus 4.1 模型发布！编程实力遥遥领先！

目前，国内一站式AI工具平台——天意科研云，已上线 Claude Opus 4.1 模型，无需魔法即可使用。

天意生信云 2025-08-072025-08-07 08:58:09

工具、模型、编程、测试、服务

发表了文章 2025-08-062025-08-06 10:29:33

Claude Code也能做单细胞+空转分析：专打高端局

最近，我使用Claude Code（AIcoder)成功复现了《Integrating spatial transcriptomics and single-c...

天意生信云 2025-08-062025-08-06 10:29:33

code、函数、可视化、数据、算法

发表了文章 2025-08-012025-08-01 13:47:56

三代测序100问（10）| Stringtie能用于三代全长转本的组装和定量吗？

在二代RNA-seq分析领域，StringTie无疑是转录本组装和定量的“老牌劲旅”，其高效与精准深受广大研究者的信赖。然而，随着三代长读长测序技术的兴起，一个...

天意生信云 2025-08-012025-08-01 13:47:57

工具、开发、数据、性能、优化

发表了文章 2025-07-172025-07-17 16:45:42

不要花钱买课了！让AI直接完成单细胞分析！

我们直接举例，复现2025年5月发表在Nature上的有关单细胞测序分析的内容。《Immune checkpoint TIM-3 regulates micro...

天意生信云 2025-07-172025-07-17 16:45:43

统计、编码、工作、脚本、模型

发表了文章 2025-07-082025-07-08 15:46:09

文献解读 | 滤泡淋巴瘤中的神秘护卫军：三类新型T细胞决定癌症命运

7月5日，顶级期刊《Cancer Cell》刊登了一项由日本、加拿大等多国团队合作完成的突破性研究。研究利用尖端单细胞多组学与空间分析技术，在滤泡性淋巴瘤（FL...

天意生信云 2025-07-082025-07-08 15:46:09

系统、队列、工作、数据、网络

发表了文章 2025-07-082025-07-08 15:44:59

自学攻略 | R包的三大来源与典型应用

R语言之所以能在生物信息学领域占据举足轻重的地位，除了其强大的统计计算能力外，更得益于其海量的R包（R Package）生态系统。这些R包就像一个个功能模块，...

天意生信云 2025-07-082025-07-08 15:44:59

函数、排序、数据、工具、管理

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