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图出不来主要是数据问题，不怕！提前效验~~
教程
配色
数据
self
程序
一看就是数据问题，指定的列包含非数字信息，这通常是 Excel 中处理处理数据带来的问题：
生信宝典
2024-07-31
89
0
用了这个参数的箱线图看着很不一样
网站
axis
cut
工具
数据
通过用户提供的重分析链接，看到了参数X-axis variable manual cut设置为 0=A 1=B 2=C 3=D 4=E，这是引发错误的根源。
生信宝典
2024-07-30
138
0
GPB | GenBase：汇交、存储、管理与共享核酸和蛋白质序列的基因序列数据库
存储
管理
数据
系统
数据库
Genomics, Proteomics & Bioinformatics （GPB） 在线发表了中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）题为“GenBase: A Nucleotide Sequence Database”的数据库文章。我们的“要文译荐”栏目很高兴邀请到文章共同第一作者赵学彤博士为大家系统介绍基因序列数据库GenBase的构建与内容。
生信宝典
2024-07-30
237
0
Nat Med｜龙尔平/陈庆宇团队合作研发“小世界增强”落地级医学大模型SSPEC并推向临床试验
数据
研发
医疗
nat
模型
以大模型为代表的生成式人工智能，拥有强大的知识编码、文本理解、推理能力，迅速成为数字化和智能化的新型技术基座，有望推动新一轮的医学人工智能革命，对科学和社会产生深远的影响。现有医学大模型处于快速变革和更新迭代的关键时期，面对场景特异知识缺乏、生成内容安全性不足等挑战。医学大模型的前瞻性临床试验和真正落地，更是被誉为“皇冠上的明珠”，是领域内亟待攻克的重要问题。因此，如何研发关键性技术破解落地难题，对于推动医学大模型领域的发展与转化应用，具有重要科学与社会意义。
生信宝典
2024-07-17
202
0
Food Chemistry | 中国药科大学李萍/陆续团队通过8种地锦草亚属植物的质体基因组比较分析对地锦草药材进行系统鉴定
安全
基础
论文
系统
研发
中国药科大学李萍/陆续团队近期在《Food Chemistry》期刊发表了题为“Comparative plastomes of eight subgenus Chamaesyce plants and system authentication of Euphorbiae Humifusae Herba”的研究论文，通过8种地锦草亚属植物的质体基因组比较分析对地锦草药材进行了系统鉴定。
生信宝典
2024-07-05
114
0
Nature | 李家洋，邓兴旺，钱前院士等点评， 基因组所程时锋团队解码全球百年种质多样性 助力小麦精准设计育种
工作
基础
设计
数据
系统
小麦是最主要的全球性粮食作物之一，是人类获取能量和营养的重要来源。普通小麦是基因组大小约为15Gb的异源六倍体，其基因组和遗传育种研究极其复杂，被誉为作物界的“珠穆朗玛峰”。
生信宝典
2024-06-21
182
0
我国农学领域再发Nature Genetics!揭示豇豆驯化与改良的基因组选择印迹
进程
论文
性能
安全
工具
2024年4月22日，浙江省农业科学院李国景团队与浙江大学张明方团队合作在国际遗传学顶级期刊Nature Genetics发表题为“Differential selection of yield and quality traits has shaped genomic signatures of cowpea domestication and improvement” 的研究论文。
生信宝典
2024-05-25
199
0
Nat Genet | 69 个拟南芥泛基因组图谱揭示了全球物种范围内的保守基因组结构
nat
编码
基础
集合
模型
文章题目：A pan-genome of 69 Arabidopsis thaliana accessions reveals a conserved genome structure throughout the global species range
生信宝典
2024-05-20
368
0
Nat Methods | 谢晓亮课题组开发单细胞联合三维基因组和转录组测序技术解析嗅觉受体选择机制
methods
工作
开发
论文
nat
嗅觉是我们基本的感觉之一，我们能够准确地识别各种的气味分子，这依赖于表达在嗅觉神经元表面的嗅觉受体。在哺乳动物中，嗅觉受体基因构成了最庞大的基因家族，在小鼠基因组中存在超过1000个，在人类基因组中存在超过400个。这些基因以基因簇的形式分布在不同染色体上。尽管嗅觉受体库如此庞大，但每个成熟的嗅觉神经元只会随机地表达一个嗅觉受体的一个等位基因，这一现象被称为“一个神经元，一个受体”。
生信宝典
2024-04-30
163
0
Science | 程功团队与合作者发现共生菌环境干预可阻断蚊媒病毒传播流行
设计
研发
工作
基础
论文
蚊媒病毒传染病的传播流行是人类健康和生命的严重威胁之一。以登革热和寨卡热这两种最具代表性的蚊媒病毒传染病为例，登革热在全球100多个国家感染流行，每年引发多达3.9亿人感染、50-100万人入院治疗；寨卡热于2015年至2017年在太平洋岛屿和南美洲突然暴发大规模疫情，不到一年时间内出现了超过22.3万例寨卡确诊病例，数千例新生儿小头畸形病例，国际卫生组织将寨卡疫情宣布为国际关注的公共卫生紧急事件。迄今为止，多数蚊媒病毒尚无有效的药物和疫苗，灭蚊措施也无法控制蚊媒病毒的传播流行。人们迫切需要成本低廉且环境友好的防控策略来阻断蚊媒病毒的广泛传播。
生信宝典
2024-04-26
209
0
Nat Biotechnol | 叶凯团队开发基因组新生和体细胞结构变异分析算法—SVision-pro
框架
数据
算法
nat
开发
基因组结构变异与丰富多彩的生物性状进化和严重疾病表型密切相关。多种遗传病和癌症的变异研究需要在多个样本之间进行基因组变异差异比较，进而获得真正与疾病进展相关的新生（de novo）和体细胞（Somatic）结构变异。目前，领域内常用的“先检测再求差”的分步式策略要求在基因组检测后有多个计算步骤，繁杂的多步骤会导致错误累计快、假阳性高，无法精确解析新生、体细胞结构变异。
生信宝典
2024-04-18
286
0
韩斌院士团队与合作者在水稻染色体外环状DNA研究中取得重要进展
系统
生物基因
基础
连接
论文
理解基因组的动态特性是当前基因组学研究的前沿方向之一。eccDNA（染色体外环状DNA）作为真核生物基因组的重要组成部分，在人类等物种中已被证实具有丰富且重要的生物学功能，但在植物中的研究尚属空白。水稻作为单子叶模式植物和重要粮食作物，开展其eccDNA的系统研究，将有助于从新的角度认识水稻基因组的特性及其环境适应性。北京时间3月18日，国际期刊Nature Communications在线发表了上海交通大学生命科学技术学院陆婷婷研究组与中国科学院分子植物科学卓越创新中心韩斌研究组合作的最新研究成果"Dynamics of extrachromosomal circular DNA in Rice"。该研究首次系统揭示了染色体外环状DNA(eccDNA)在水稻基因组中的广泛存在，为深入理解水稻遗传多样性提供了全新视角。
生信宝典
2024-04-18
200
0
Nature|239个灵长类动物基因组的比较揭示了CRE元件的进化
数据
算法
数据库
深度学习
编码
在此研究人员构建了包含239个物种的全基因组比对，这些基因组占灵长类目中所有现存物种的将近一半。利用该资源，研究人员确立了在灵长类和其他哺乳动物中受到选择性约束的人类调控元件。例如人类中111318个DNase I酶切位点和267410个转录因子结合位点在灵长类受到选择性约束但是在其他哺乳动物中没有约束，并证明了这些元件对基因表达的cis作用。这些结果强调了作用在这些调控元件上进化力量的重要性。 原文链接：https://www.nature.com/articles/s41586-023-06798-8
生信宝典
2024-04-10
208
0
零基础用文心一言带你绘制组合图
布局
函数
基础
数据
百度
写着神经网络计算代码，对矩阵计算想整个清晰的展示方式，就想着用 Python 绘制下矩阵运算图。先偷懒一下，看看有没有人分享过代码？
生信宝典
2024-03-12
111
0
NAR | 整合药用植物组学平台 IMP中文教程（基因组更新到 466 个植物）
搜索
教程
可视化
浏览器
数据
药用植物因其潜在的抗肿瘤、抗炎和抗氧化特性，在民族医学和传统医学中引起了极大的关注。基因组测序和合成生物学的最新进展重新激发了人们对这些天然产物的兴趣。尽管有很多药用植物的基因组和转录组测序数据，但缺乏可公开访问的基因注释和表格格式的基因表达数据，这不利于它们的有效利用。为了解决这一紧迫问题，我们开发了IMP (Integrated Medicinal Plantomics)整合药用植物组学平台（https://www.bic.ac.cn/IMP 点击阅读原文直接跳转）。
生信宝典
2024-03-11
106
0
ImageGP 高颜值免费绘图工具增加工具使用记录和重分析功能
工具
管理
开发工具
error
登录
点击右上角，免费注册登录后，点击 Personal center进入个人中心，可以管理文件、管理运行过的工具的记录、管理运行过的流程的记录。
生信宝典
2024-03-02
256
0
Science | 基因组所闫建斌领衔解码紫杉醇生物合成途径中最具挑战的未知酶，重建巴卡亭III生物合成线路
工作
开发
论文
研发
重构
紫杉醇是全球销量第一的植物抗癌药物，而且随着癌症防治需求的日益增加，紫杉醇成为全球销量第一的植物抗癌药，预期其市场规模在2030年以后将达到近千亿人民币规模。自从1971年鉴定化学结构以来，紫杉醇已发展成为同青蒿素齐名的、教科书级别的经典植物天然产物的代表。半个世纪以来，紫杉醇生物合成途径依然未被完全解析，成为科学界一直关注的难点。
生信宝典
2024-01-31
355
0
一文读懂：PCR，qPCR，Real-time PCR，RT-PCR和RT-qPCR
设计
原理
双螺旋
time
互联网
然而，各种PCR技术，包括PCR、qPCR、RT-PCR、RT-qPCR、Real-Time PCR和dPCR，长得实在是太像了，好多同学看得头晕眼花也没弄明白这几种PCR有什么区别。
生信宝典
2024-01-23
2.9K
0
Hortic Res | 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所剑麻研究团队在龙舌兰亚科基因组及CAM进化机制上取得进展
编码
工作
论文
事件
数据
龙舌兰亚属（中文名“剑麻”）植物是硬质纤维的主要来源，提供了全球2/3的硬质纤维。同时龙舌兰亚属植物在食品、医药和观赏具有利用价值。龙舌兰属植物为组成型CAM植物，能耐受极端高温和干旱。龙舌兰亚属物种形成时间短，突变积累少，使得龙舌兰属植物成为研究CAM进化的模式作物。尽管利用转录数据开展了龙舌兰属植物CAM进化的研究，但缺乏基因组数据，不利于开展比较基因组分析。然而较大的基因组、高比例的重复序列和多倍化，以及难以获得纯和等因素阻碍了龙舌兰属植物基因组的研究。
生信宝典
2024-01-12
176
0
Nature发表牛津美女博士建议：我希望在读博士之初时就能知道的20件事
备份
工作
论文
数据
有些学校不光要求在某顶级期刊里发表一些论文，还需要你时刻待命为“老板”解决一些问题。
生信宝典
2023-12-30
182
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