数据科学工厂

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LV4

发表了文章 14天前2025-08-13 06:11:40

Scanpy 单细胞分析：Pearson残差处理计数数据

本系列讲解使用 Scanpy 分析单细胞（scRNA-seq）数据教程[1]，持续更新，欢迎关注，转发！

数据科学工厂 14天前2025-08-13 06:11:41

教程、模型、数据、对象、函数

发表了文章 19天前2025-08-08 05:32:09

利用 Hi-C 挖掘癌症结构变异

在本文中，我们将使用 Caki2 细胞系的 Hi-C 数据来说明利用 Hi-C 数据发现 SVs 的过程。

数据科学工厂 19天前2025-08-08 05:32:09

工具、可视化、事件、数据、map

发表了文章 19天前2025-08-08 05:31:26

空间转录组学: 质控处理（1）

本系列讲解空间转录组学 (Spatial Transcriptomics) 相关基础知识与数据分析教程[1]，持续更新，欢迎关注，转发，文末有交流群！

数据科学工厂 19天前2025-08-08 05:31:27

数据、效率、异常、对象、函数

发表了文章 19天前2025-08-08 05:30:56

单细胞分析: Scanpy 核心绘图 (3)

本系列讲解使用 Scanpy 分析单细胞（scRNA-seq）数据教程[1]，持续更新，欢迎关注，转发！

数据科学工厂 19天前2025-08-08 05:30:57

rank、函数、可视化、数据、marker

发表了文章 29天前2025-07-29 02:22:18

空间转录组学: 计数矩阵定量

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数据科学工厂 29天前2025-07-29 02:22:19

数据、统计、芯片、数据分析、软件

发表了文章 29天前2025-07-29 02:21:50

利用 Hi-C 挖掘癌症结构变异 (2)

在本文中，我们将使用 Caki2 细胞系的 Hi-C 数据来说明利用 Hi-C 数据发现 SVs 的过程。

数据科学工厂 29天前2025-07-29 02:21:51

工具、工作、数据、索引、数据分析

发表了文章 2025-07-242025-07-24 02:46:46

单细胞分析: Scanpy 核心绘图 (2)

本系列讲解使用 Scanpy 分析单细胞（scRNA-seq）数据教程[1]，持续更新，欢迎关注，转发！

数据科学工厂 2025-07-242025-07-24 02:46:46

cell、教程、可视化、数据、存储

发表了文章 2025-07-212025-07-21 02:45:29

利用 Hi-C 挖掘癌症结构变异 (1)

结构变异（SVs）是大型基因组重排，由于基因组重复序列和复杂 SV 结构等各种混淆因素的存在，当前使用短读长测序技术进行识别颇具挑战。Hi-C breakfin...

数据科学工厂 2025-07-212025-07-21 02:45:30

连接、事件、数据、系统、异常

发表了文章 2025-07-212025-07-21 02:44:49

空间转录组学: 测序数据介绍

本系列讲解空间转录组学 (Spatial Transcriptomics) 相关基础知识与数据分析教程[1]，持续更新，欢迎关注，转发，文末有交流群！

数据科学工厂 2025-07-212025-07-21 02:44:50

工具、连接、数据、统计、数据分析

发表了文章 2025-07-142025-07-14 08:28:40

单细胞分析: Scanpy 核心绘图 (1)

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数据科学工厂 2025-07-142025-07-14 08:28:41

数据、存储、变量、函数、可视化

发表了文章 2025-07-122025-07-12 09:55:43

三维基因组: 结构文件格式

Loop、Domains和Compartments的文件格式主要取决于用于识别这些特征的软件工具。

数据科学工厂 2025-07-122025-07-12 09:55:43

存储、工具、开发、可视化、数据

发表了文章 2025-07-122025-07-12 09:52:15

空间转录组学: 测序平台介绍

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数据分析、布局、教程、开发、数据

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ingest和BBKNN进行单细胞整合（2）

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可视化、模型、数据、categories、ref

发表了文章 2025-07-032025-07-03 06:52:04

3D-Genome：认识接触矩阵(contact matrix)

"contact list"（又称"pairs"文件）记录了测序读段比对后筛选出的有效互作位点对，是构建基因组互作矩阵的初始数据。在后续矩阵生成或标准化步骤中，...

数据科学工厂 2025-07-032025-07-03 06:52:05

数据、索引、存储、matrix、排序

发表了文章 2025-07-022025-07-02 10:15:27

空间转录组：从R导入数据

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数据科学工厂 2025-07-022025-07-02 10:15:28

函数、数据、数据处理、matrix、对象

发表了文章 2025-06-302025-06-30 03:37:54

ingest和BBKNN进行单细胞整合（1）

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数据科学工厂 2025-06-302025-06-30 03:37:54

ref、工作流、函数、模型、数据

发表了文章 2025-06-302025-06-30 03:32:59

三维基因组|Hi-C 数据格式

为了更好地处理、存储以及可视化高分辨率的 Hi-C 数据，开发出了高效的数据格式。其中，只保存非零值的稀疏矩阵格式得到了广泛应用，成为了行业标准。此外，“zoo...

数据科学工厂 2025-06-302025-06-30 03:33:00

存储、二进制、开发、可视化、数据

发表了文章 2025-06-112025-06-11 07:36:20

空间转录组：数据格式介绍

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数据科学工厂 2025-06-112025-06-11 07:36:20

存储、表格、对象、框架、数据

发表了文章 2025-06-092025-06-09 03:54:04

Scanpy 分析 3k PBMCs：寻找 marker 基因

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数据科学工厂 2025-06-092025-06-09 03:54:05

变量、对象、可视化、数据、marker

发表了文章 2025-06-082025-06-08 07:30:13

Scanpy 分析 3k PBMCs：降维与聚类

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数据科学工厂 2025-06-082025-06-08 07:30:14

函数、教程、框架、数据、优化

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暂未填写公司和职称
聚焦「数据科学 | 生命科学 | Python | 机器学习」等前沿交叉学科，定期分享理论教程与应用实践等。
腾讯云开发者社区程序人生
暂未填写学校和专业
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北京
加入社区时间：2018-09-07

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