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#plot

多性状或者多个模型的QQ和曼哈顿重叠图

邓飞

之前介绍了好几篇QQ图和曼哈顿图的绘制GWAS的曼哈顿图和QQ图diamante,GWAS分析QQ图挺好,曼哈顿图没有显著性,如何调整阈值,今天介绍一下多个性状...

5900

单细胞分析 | 基因组区域的可视化 (2)

数据科学工厂

"heights" 和 "widths" 参数用于调整各个轨迹图的相对高度和宽度,调整的顺序依据它们在 plotlist 中的排列。CombineTracks(...

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单细胞 | 转录因子足迹分析

数据科学工厂

要执行足迹分析,必须首先向对象中添加Motif 信息,这包括每个Motif 的精确位置。这一过程可以通过使用“motif”和“packages”这两个包中的函数...

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R语言非线性混合效应 NLME模型(固定效应&随机效应)对抗哮喘药物茶碱动力学研究

拓端

此处,时间是从抽取样品时开始给药的时间(h),浓度是测得的茶碱浓度(mg/L),体重是受试者的体重(kg)。

11010

转录组可视化的全年度爱用包:TOmicsVis

生信技能树

前面给大家介绍过一款单细胞数据可视化大全年度爱用包:《终于有人对Seurat包丑到哭的可视化出手了:年度爱用包!》

22210

一个批量做LDblock的脚本

邓飞

今天,有小伙伴在星球询问GWAS分析的显著性位点,如何批量绘制LDblock,之前写过LDblock的安装和使用说明:(LDblock绘制连锁不平衡和单体型图)

13010

不看KM-plot,不做cox回归,怎么量化哪个组的预后好

用户11414625

讲课讲到批量的logrank test可以告诉我们两个组之间的生存率差别是否显著,收到提问说:

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R用户要整点python--pandas画图

用户11414625

因为pandas的.plot方法时以matplotlib为基础的,所以每次画图之前要先import matplotlib.pyplot as plt,画图之后又...

6300

听说你的KM-plot p值>0.05

用户11414625

KM-plot是生存分析最常用的图表,没有之一。它接受的分组依据必须是离散型的数据,就是固定分成有限的几类,不能是数值这样的连续型数据。

5100

带有侧边密度图的相关性点图(自力更生版)

用户11414625

原来是ggstatplot可以直接画的,但这个包的最新版本画图直接报错,旧版本可以但是装包时各种套娃,依赖包各种过时各种限制版本,搞起来真的麻烦。所以换个思路,...

4510

matlab 函数,matlab 语法2

zhangjiqun

2800

终于有人对Seurat包丑到哭的可视化出手了:年度爱用包!

生信技能树

质量控制(QC)措施可以通过plot_qc()函数进行绘制。生成的图表可以进一步使用ggplot语法进行定制(例如轴标题、主题等)。

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间接法加窗分析信号的功率谱

不去幼儿园

维纳辛钦定理指出,随机信号的相关函数与它的功率谱是一对傅里叶变换对。BT法就是基于这个原理。先由观测数据估计出自相关函数,然后求自相关函数的傅立...

12210

脉冲幅度调制信号的功率谱计算

不去幼儿园

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R tips:使用shiny和plotly获得umap图的点坐标

生信菜鸟团

在shiny页面,使用套索工具圈选感兴趣的区域,程序会自动将选区边界坐标导出到家目录中的lassso_boundary.rds文件中。

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趋势(二)利用python绘制面积图

HsuHeinrich

matplotlib主要利用plot绘制面积图,可以通过matplotlib.pyplot.plot[1]了解更多用法

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【深度学习】 Python 和 NumPy 系列教程(廿七):Matplotlib详解:3、多子图和布局:散点矩阵图(Scatter Matrix Plot)

Qomolangma

Python本身是一种伟大的通用编程语言,在一些流行的库(numpy,scipy,matplotlib)的帮助下,成为了科学计算的强大环境。本系...

11510

【深度学习】 Python 和 NumPy 系列教程(廿四):Matplotlib详解:2、3d绘图类型(10)3D箱线图(3D Box Plot)

Qomolangma

Python本身是一种伟大的通用编程语言,在一些流行的库(numpy,scipy,matplotlib)的帮助下,成为了科学计算的强大环境。本系...

11110

【深度学习】 Python 和 NumPy 系列教程(廿三):Matplotlib详解:2、3d绘图类型(9)3D等高线投影图(3D Contour Projection Plot)

Qomolangma

Python本身是一种伟大的通用编程语言,在一些流行的库(numpy,scipy,matplotlib)的帮助下,成为了科学计算的强大环境。本系...

10710

【深度学习】 Python 和 NumPy 系列教程(二十):Matplotlib详解:2、3d绘图类型(6)3D向量场图(3D Vector Field Plot)

Qomolangma

Python本身是一种伟大的通用编程语言,在一些流行的库(numpy,scipy,matplotlib)的帮助下,成为了科学计算的强大环境。本系...

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