暂无搜索历史
ChIP-seq是一种结合位点分析法,用于研究体内蛋白质与DNA相互作用。通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)与第二代测序技术相结合,在全基因组范围内检测与组蛋...
操纵小鼠基因组的能力,加上丰富的疾病模型、近交系和基因组资源,使小鼠成为哺乳动物生物学遗传方法的首要模式生物。一个多世纪以来,小鼠遗传学已经提供了大量的近交系,...
单细胞RNA测序分析是转录组学研究前沿的一个快速发展领域,用于高通量的发育研究和稀有转录本研究,以检查细胞群体内的细胞异质性。细胞分辨率和全基因组范围的分析使我...
当序列与参考基因组进行比对时,我们便可以看到它与哪个基因位点对齐,并据此定性地断言,结合上述两条信息,该序列描绘了来自特定细胞的特定基因的转录本。
从今天开始,用 21 天精通单细胞数据分析。我们将理论联系实际,边学边练,本文先从理论开始。
一头雌性赫里福德奶牛的基因组于2009年发表。[1][2] 它是由牛基因组测序和分析联盟(Bovine Genome Sequencing and Analys...
本文介绍全转录组数据分析方法,我们将以拟南芥测序数据为例,在 UseGalaxy.cn 云平台进行数据分析实践。
当我们进行单细胞数据分析时,应该始终从质量控制步骤开始,首先清理数据,以确保数据足以回答研究的问题。在此步骤之后,通常会继续进行定位(比对)或基因组组装步骤,具...
在GATK最佳实践检测变异过程当中,当我们在调用 HaplotypeCaller 时,可以选择输出 GVCF 文件,或者 VCF 文件,这两者有什么区别呢?
Galaxy 平台(UseGalaxy.cn)也整合了awk 工具,可以方便地对表格数据进行报表生成。
Extract element identifiers of a list collection (Galaxy Version 0.0.2)
工具:Flatten collection (Galaxy Version 1.0.0)
肿瘤生信科研经常会画突变的景观图,或者叫瀑布图,用 maftools 包可以实现简单的 Landscape 图,但是当图形比较复杂时,maftools 就不能胜...
Awk 是一个强大的文本分析工具,它每次读入一条记录,并把每条记录切分成字段后进行分析。Awk 官方文档是非常好的学习材料,通过man awk查看。
我们需要将Python对象序列化为字节流,这样就可以将其保存到文件中、存储到数据库中或者通过网络连接进行传输。
这个问题可以通过 open() 函数中鲜为人知的 x 模式替代常见的 w 模式来解决。例如:
可以利用字典推导式(dictionary compehension)轻松解决。例如:
程序优化的第一准则是“不要优化”,第二准则是“不要优化那些不重要的部分”。基于这两个原则,如果你的程序运行得很慢,你得先找出影响性能的问题所在。