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文献解读-Chromosome-Scale Genome of Masked Palm Civet (Paguma larvata) Shows Genomic

INSVAST 2天前2025-03-04 17:09:40

花面果子狸(Paguma larvata)作为一种独特的小型食肉动物，其杂食性饮食习性和作为多种病原体载体的特征引起了广泛的关注。特别是自2003年SARS疫情...

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三代测序人物系列 | Jonathan Göke

三代测序说 2天前2025-03-04 11:21:45

Jonathan Göke是新加坡基因组研究所（Genome Institute of Singapore ，A-STAR GIS）的课题组负责人，同时也兼任...

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三代测序人物系列 | Yi Xing (邢毅)

三代测序说 7天前2025-02-27 11:45:17

美国费城儿童医院（Children’s Hospital of Philadelphia ，CHOP）计算与基因组医学中心（Center for Computa...

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文献解读-Integrative Genomic Analysis of Drug Resistance in MET Exon 14 Skipping Lun

INSVAST 8天前2025-02-26 15:52:46

非小细胞肺癌(NSCLC)作为一种异质性疾病，占肺癌诊断的85%，常见致癌基因改变包括EGFR、ALK、ROS和MET等。其中MET外显子14跳跃突变(METe...

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三代测序 - 数据质控 | LongReadSum

三代测序说 9天前2025-02-25 15:02:10

LongReadSum 是美国费城儿童医院Kai Wang教授团队（图1）开发的一款专门针对长读长测序数据设计的快速质控工具（如纳米孔测序、PacBio测序等）...

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三代测序 - 数据质控 | fastplong

三代测序说 10天前2025-02-24 13:54:27

提起二代测序数据质控软件 fastp，相信大家一定不会陌生。作为一款质量控制软件，其从查看碱基质量到过滤、修剪、去接头等全方位的预处理服务，加之高速、易用的特点...

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从Evo到Evo 2：Arc Institute推出全新升级版基因组大模型

实验盒 14天前2025-02-20 12:42:28

基因组语言模型（Genomic Language Models）逐渐成为研究热点。2024年，Arc Institute的Brian L. Hie和Patric...

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文献解读-Thiabendazole Inhibits Glioblastoma Cell Proliferation and Invasion Targeti

INSVAST 15天前2025-02-19 11:15:18

胶质母细胞瘤(Glioblastoma, GBM)是成人中最常见和最具侵袭性的原发性中枢神经系统恶性肿瘤。尽管采用手术切除联合放化疗的标准治疗方案，患者的中位生...

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生物识别技术的发展与应用：从科幻走进现实

Echo_Wish 15天前2025-02-19 08:36:34

今天我想和大家聊聊一个非常酷的技术——生物识别技术。从《黑客帝国》到《碟中谍》，我们常在科幻电影中看到人们使用指纹、虹膜等方式来进行身份验证。没错，这就是生物识...

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文献解读-Genetic Determinants of Sudden Unexpected Death in Pediatrics

INSVAST 20天前2025-02-14 15:12:37

儿童突发性死亡(SUDP)作为一个重要的公共卫生问题，在美国占儿童死亡率超过10%，其发生率超过癌症和心脏病导致的死亡。这些死亡事件通常发生在睡眠期间，临床上被...

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如何获得KEGG中某一条通路的全部基因？

sheldor没耳朵 24天前2025-02-10 14:35:00

比如说我们想看PI3K-Akt signaling pathway这条通路中包含哪些基因？首先需要访问KEGG的官网，获取其hsa编号，如PI3K-Akt si...

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文献解读-Case Report: Prenatal Diagnosis of Postaxial Polydactyly With Bi-Allelic Va

INSVAST 27天前2025-02-07 14:10:48

后轴多指(趾)症（PAP）是一种常见的先天性畸形，涉及复杂的遗传因素，而Sonic hedgehog (SHH)信号通路在肢体发育中扮演着关键角色。以往的研究主...

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GSE163558单细胞数据处理流程分享

生信医道 28天前2025-02-06 11:14:45

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE163558 ,GEO数据库搜索GEO数据号，下载并...

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nature communications 杂志同款三元图：Ternary plots

生信技能树 29天前2025-02-05 13:42:32

全称：操作分类单元（Operational Taxonomic Units，OTUs）

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文献解读-Pathogenic variants carrier screening in New Brunswick: Acadians reveal hig

INSVAST 2025-01-222025-01-22 14:34:15

阿卡迪亚人作为一个具有独特遗传背景的群体，可能面临较高的遗传疾病风险，但目前缺乏对这一群体致病变异的系统评估。为此，研究者对加拿大新不伦瑞克省的阿卡迪亚人进行了...

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科研打工人必知：曾让微生物基因注释超轻松的 Prokka

简说基因 2025-01-162025-01-16 21:48:31

这就是微生物基因组一站式注释工具、打工人的摸鱼神器：Prokka。当年有了它，微生物基因注释工作就成了很喜欢干的活，因为一条命令就完成了。极少出错，极少返工，非...

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群体基因组文献解读-Prediction of axillary lymph node metastasis in triple-negative breast

INSVAST 2025-01-142025-01-14 16:26:59

三阴性乳腺癌(TNBC)是一种侵袭性强、预后较差的乳腺癌亚型。准确预测TNBC患者的腋窝淋巴结转移(LNM)状态对于制定个体化治疗方案至关重要。尽管前哨淋巴结活...

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文献解读-Effectiveness of mRNA BNT162b2 COVID-19 vaccine up to 6 months in a large

INSVAST 2025-01-092025-01-09 17:29:21

新冠疫情爆发以来，疫苗的开发和应用成为全球应对COVID-19的关键策略。其中，BNT162b2 mRNA疫苗因其快速开发和高效性而备受关注。然而，随着时间推移...

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KEGG中的颜色映射—使用原始P值

sheldor没耳朵 2025-01-062025-01-06 17:02:46

使用clusterProfiler进行KEGG分析时，在进行可视化的时候，如barplot函数、dotplot函数默认显示的是调整后的P值，但如果调整后的P值太...

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