今天继续之前的TrendCatcher，大家做完时序上的差异基因，然后就是想知道这些基因的功能，这就要用到富集分析了。🧐

五六年前就在 Typecho 上折腾过热力图，以前用 jQuery 折腾挺方便的。 但期间有些博客主题中没有合适的地方放热力图，就放弃了。 最近博客热力图又有热...

注意力机制作为一种模拟人脑信息处理的关键工具，在深度学习领域中得到了广泛应用。本系列实验旨在通过理论分析和代码演示，深入了解注意力机制的原理、类型及其在模型中...

  在生物信息学中，PBMC3K.h5ad是一种常用的单细胞RNA测序数据集，用于研究人类外周血单个核细胞（PBMC）的基因表达。

分组和聚类是两件独立的事情，聚类是以样本为单位，而不是以分组为单位。每个样本属于那个分组的信息是已知的。

mummer2circos 是一个用于绘制细菌基因组的圈图（circos 图）的工具。它基于 BLAST 或 NUCMER/PROMER 的比对结果，生成 SV...

seaborn主要利用heatmap绘制热图，可以通过seaborn.heatmap[1]了解更多用法

前面介绍了 Grafana 入门与部署、仪表盘 DashBoard 、Dashboard 变量、Panel 面板和Time series（时间序列）、添加动态参...

言归正传，今天分享的是CCPlotR包，用于基于scRNAseq数据推断细胞间相互作用的可视化。😋

《circRNA芯片也是同样的差异分析》circRNA芯片也是同样的差异分析 (qq.com)

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tidyHeatmap基于ComplexHeatmap，遵循图形语法，最大的好处是直接使用长数据画热图，这是目前其他画热图的R包所不具备的。

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1写在前面 最近在画热图(heatmap)时，遇到一个问题，就是如果画热图时导入的基因过多，基因名就会重叠在一起，根本没法看，非常影响颜值。😭 这里提供一种基于...

此处使用「color=NULL」来取消热图边框颜色,offset设置热图与进化树直接的距离

【小提琴图】其实是【箱线图】与【核密度图】的结合，【箱线图】展示了分位数的位置，【小提琴图】则展示了任意位置的密度，通过【小提琴图】可以知道哪些位置的密度较...

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究竟是哪种策略（top-down / bottom-up），主要看接了一个什么样的head。如果接的是heatmap那就是bottom-up。和网络结构本身无关...

在使用R语言过程中，每一步中都需要关注R语言的数据结构。数据结构是R语言中最重要的内容，也是最难的一部分，学会了这部分之后，R语言就不难了。很多时...

算法：局部熵是将图分成一个个区域，分别计算再融合成信息分布图，有点类似heatmap。熵是体系的混乱的程度，越乱越大。图像熵是图像特征的一种统计形式,反映了图像...