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编写一个高效的算法来搜索整数矩阵target中的值。其中:每行中的整数按从左到右的升序排序,每列中的整数按从上到下的升序排序。 示例: 输入:矩阵 = [[...
给定一个 n × n 的二维矩阵 matrix 表示一个图像。请你将图像顺时针旋转 90 度。
直观上判断,药物 1 的疗效要好(20:10 vs 10:20),但与药物 2 的疗效相比,是否达到了显著性的差异了呢?
这些信息有助于理解肿瘤和正常组织中基因表达调控的差异,以及这些差异如何影响细胞功能和疾病状态。
无独有偶,之前我们也分析过一个组内相关性超高的数据集,高到看起来像是造假的数据,一起来看看吧。
此次给绘制的图来自文献《Triple DMARD treatment in early rheumatoid arthritis modulates synov...
2、没有生物学重复的时候 还有算法可以做差异分析吗?进而得到一个统计学显著性Pvalue值。
这个超级正常的,我们首先让人工智能大模型解释一下手动计算两分组的count矩阵中基因表达量的变化倍数(fold change)的过程:
众所周知,limma可以做基因表达芯片和转录组数据的差异分析,可以方便的得处两组之间有表达量差别的基因。多分组差异分析其实也是两两差异分析的批量做法。
习惯了在做生物信息学数据分析或者相关知识点整理之前,都下意识的问一下人工智能大模型,比如关于热图的绘制,大模型其实是会优先推荐ggplot2,但是对绝大部分小伙...
**Long Non-Coding RNA (长链非编码RNA, lncRNA)**:
很容易批量读取它们,详见我在前面的笔记:微生物真难搞啊,单个物种居然有几千个参考基因组 ,有意思的是文章给出来了的两分组的差异分析非常完美,如下所示:
这些文件名字,不方便使用r编程语言里面的Seurat包批量读取,是需要按照规则改名的,如下所示的目标文件夹架构
哪怕是一个生命科学领域的博士生,没有上过临床,对科研的想象也是有限度的,比如大家都知道可以做癌症研究,普通人能想到的实验设计是可以探索癌症的生物学特性、机制、治...
就会发现,matrix.mtx文件里面的33694、2049、1878957数值,分别是细胞数量,基因数量,以及有表达量的值的数量(全部的值应该是33694X2...
比如,差异分析后一般来说有成百上千个上下调基因,如果对一个具体的基因是否有表达量差异这件事,而分析者都没办法确定,我们会让他做一个表达量箱线图。理论上肉眼看到的...
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在许多数学和计算应用中,要求矩阵 W 的对角线元素 w_{ii} = 0 是出于特定的数学性质和算法需求。以下是一些常见的原因:
2、如何判断 向量 b或向量组 B是否可由向量组A 线性表示?如果能,写出表达式。 解法:以向量组A以及向量b或向量组B:为列向量构成矩...
官方安装文档:Installation – Synapse (matrix-org.github.io)