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首页标签bioinformatics

#bioinformatics

TCGA 联合 GTEX 分析流程

叶子Tenney

在我们使用 TCGA 数据进行差异分析的时候,可能会遇到肿瘤和正常数据之间的不平衡的问题。为了得到更科学的结果,结合 GTEx 项目提供的正常样本数据是一种较为...

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FeaturePlot_scCustom作图

JJJJack

Seurat object里面有12个samples, 我想呈现A gene在12个samples里面的表达情况。FeaturePlot()是首选,然后12个s...

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Bioinformatics|Hi-GeoMVP:用于药物反应预测的分层几何增强深度学习模型

智药邦

2024年4月13日,新加坡国立大学Yurui Chen等人在Bioinformatics上发表文章Hi-GeoMVP: a hierarchical geom...

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受试者工作特性曲线 (ROC) 的原理及绘制方式

叶子Tenney

受试者工作特性曲线 (Receiver Operating Characteristic, ROC) 曲线是生信分析中一种常用的性能评估方法,那么他背后的原理是...

2.1K20

Bioinformatics|MoleMCL:分子预训练的多层次对比学习框架

智药邦

2024年3月26日,厦门大学刘向荣教授团队在Bioinformatics上发表文章MoleMCL: a multi-level contrastive lea...

20710

Bioinformatics|MARS:基于模体的自回归模型用于逆合成预测

智药邦

2024年2月29日,深圳大学欧阳乐老师、腾讯人工智能实验室赵沛霖研究员团队在Bioinformatics上发表文章MARS: a motif-based au...

13610

Bioinformatics|MolFeSCue:基于小样本对比学习增强有限和不平衡数据下的分子性质预测

智药邦

2024年2月29日,吉林大学周丰丰教授团队在Bioinformatics上发表文章MolFeSCue: enhancing molecular propert...

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fqkit: 一个处理fastq序列的小工具

生信小驿站

一个用于处理fastq测序文件的命令行小工具,功能还在不断更新中,子命令也不多,支持gzip压缩文件的输入和输出(结果文件名以.gz结尾,结果会自动压缩)。

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Briefings in Bioinformatics:具有不同杂合性水平基因组的实用组装指南

尐尐呅

长读长测序技术有利于基因组组装,但其序列错误率较高。虽然已开发了具有不同视角的各种组装程序,但尚未对具有不同杂合性的二倍体基因组的长读长组装程序进行系统评估。2...

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生信星球161期Day1_lily

用户8149829

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德睿论文Bioinformatics | 生物数据挖掘领域的AI大语言模型Benchmark研究

DrugAI

近日,「德睿智药」与广州生物岛科学家团队的合作论文“An Extensive Benchmark Study on Biomedical Text Genera...

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R-note

肥颖

This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for autho...

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day3

无端

数据类型:向量(vector);数据框(Data Frame);矩阵(Matrix);数组(Array);List。

14920

DAY2

无端

12300

生物信息学权威期刊Bioinformatics发文量最大的是谁

生信技能树

然后又看到了目前位于德国的顾祖光公众号发布的蛮有意思的探索,使用了pubmedR这个包,统计具体的某个杂志的文章的作者发文量情况:

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现代生物学领域的生物信息学权重高吗

生信技能树

上面的代码获取全部的书籍的大标题和小标题,接下来就是针对它们的标题内容进行一个简单的汇总整理。简单的看了看生物信息学相关非常少:

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跟着Bioinformatics学数据分析:StainedGlass可视化展示基因组水平上的tandem repeat

用户7010445

https://mrvollger.github.io/StainedGlass/

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人生第一次尝试DockerFile来安装Docker

旋转木马

Docker是一个用Go语言实现的开源项目,可以让我们方便的创建和使用容器,docker将程序以及程序所有的依赖都打包到docker container,这样你...

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生信星球-生信自学小组 DAY7 测序基本知识

用户10402030

Sanger法是基于DNA合成反应的测序技术,又称为SBS法、末端终止法。1975年由Sanger提出,并于1977发表第一个完整的生物体基因组序列。

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