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#cell

【CodeForces】701B - Cells Not Under Attack（思维）

FishWang 2025-08-262025-08-26 20:39:10

The cell of the field is under rook's attack, if there is at least one rook loca...

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【POJ】2031 - Building a Space Station（克鲁斯塔尔）

FishWang 2025-08-262025-08-26 19:42:03

You are a member of the space station engineering team, and are assigned a ta...

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【POJ】3620 - Avoid The Lakes（dfs，水）

FishWang 2025-08-262025-08-26 19:35:06

Farmer John's farm was flooded in the most recent storm, a fact only aggravated ...

13610

【LightOJ】1008 - Fibsieve`s Fantabulous Birthday（规律）

FishWang 2025-08-262025-08-26 15:50:44

In the first second the light at cell (1, 1) would be on. And in the 5th second ...

14010

【CodeForces】675B - Restoring Painting（数学推导）

FishWang 2025-08-262025-08-26 15:47:41

Two squares are considered to be different, if there exists a cell that contains...

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【CodeForces】699A - One Bomb（思维）

FishWang 2025-08-262025-08-26 15:31:52

The next n lines contain m symbols "." and "*" each — the description of the fie...

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NC高分杂志cellchat细胞通讯结果个性化绘制之弦图

生信技能树 2025-08-122025-08-12 10:37:03

今天就开干！学习的弦图个性化图来自文献《Microglia coordinate cellular interactions during spinal cor...

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读《Single-cell best practices》2025实践版

生信菜鸟团 2025-08-112025-08-11 10:29:43

《Single-cell best practices》是咱们生信书房推荐的第66本书。最近在生信技能树上，看再次到这本书(https://www.sc-bes...

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小鼠细胞图谱

生信菜鸟团 2025-08-092025-08-09 16:03:53

上期推荐了一个数据库：人类细胞图谱 - 单细胞数据和 Marker 信息，那这次我们来看一个小鼠细胞图谱数据库。

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稳健和准确top1的空转反卷积算法RCTD实战：GSE242249

生信技能树 2025-08-032025-08-03 14:23:48

前面我们分享了两篇空转反卷积的方法测评，其中RCTD位于推荐榜首，今天就用这篇文献《Integrating spatial transcriptomics an...

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单细胞分析: Scanpy 核心绘图 (2)

数据科学工厂 2025-07-242025-07-24 10:46:46

使用这张图，我们可以看到 cluster 4 对应于 B-cells，cluster 2 是 T-cells 等等。这些信息可以用来按如下方式手动注释细胞：

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单细胞空间多组学揭示肿瘤相关成纤维细胞的保守空间亚型和细胞邻域-空间细胞亚群细分代码实现

生信大杂烩 2025-07-202025-07-20 10:57:05

CAF 是肿瘤微环境中的关键成分，能够通过细胞间相互作用影响免疫逃逸、药物耐受和转移。然而，CAF 的空间异质性与其生物功能尚未完全理解。癌症相关成纤维...

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具有不同肿瘤阶段的胃癌单细胞与空转联合分析（2025年2月发表）

生信技能树 2025-07-202025-07-20 10:00:26

本文通过对32例处于不同恶性阶段的人类胃黏膜组织进行空间和单细胞RNA测序，揭示了肿瘤上皮的表型可塑性以及从成熟的胃主细胞到CSC状态的转录轨迹，这一过程与表皮...

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[python]gdspy安装后测试代码

云未归来 2025-07-192025-07-19 14:47:11

GitHub - heitzmann/gdspy: Python module for creating GDSII stream files, usually...

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细胞程序性死亡相关基因都一两千个了啊

生信技能树 2025-07-082025-07-08 19:11:46

上次看公众号总结的《The molecular machinery of regulated cell death》综述提到的细胞程序性死亡相关通路是12个，每...

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马丽佳团队开发亚细胞分辨率RNA结构动态检测新工具助力RNA结构动力学研究 | Cell Press对话科学家

DrugOne 2025-07-042025-07-04 14:59:43

2025年6月25日，西湖大学马丽佳团队在Cell Press细胞出版社期刊Cell Reports Methods发表了题为“TAS-seq enables ...

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Cell Research | 培养 AI 虚拟细胞：三大数据支柱和闭环学习

生信菜鸟团 2025-06-202025-06-20 08:49:15

【优质期刊】文献【泛读，精读】笔记。关注癌症，生信，多组学，数据库，科研工具，精准医学，临床研究，生物技术，计算机技能，大语言模型的应用。

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区区7个肿瘤病人单细胞样品就近20万细胞吗

生信技能树 2025-06-132025-06-13 12:37:03

可以看到，仅仅是7个病人，但是文章写到：We constructed a single-cell atlas for 184,426 high-quality...

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空间转录组细胞类型注释--SCimilarity

生信大杂烩 2025-06-102025-06-10 18:42:32

前面我们使用10x visium HD结直肠癌样本数据介绍了基于H&E图像进行细胞分割，得到了单细胞精度的空间数据，然后和单细胞分析一样，进行降维聚...

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Cell杂志同款：单细胞亚群组间差异基因排序气泡图

生信技能树 2025-06-092025-06-09 21:19:08

该部分展示了结肠炎相关细胞簇（5-8cluster）与非结肠炎相关细胞簇（1-4cluster）之间显著差异表达基因的排名。研究者对这些基因进行了筛选，标注了前...