biotrainee note 5
原创
用于读取/导出文件的R包
如果需要设置行名或者不修改列明，需要用到base包，只有它有参数可以设置
反之，则用其他两个包，读取速度会比较快
rio包最好用
基础包-绘图函数
ggplot2画图
列明不带引号，函数之间写加号
属性设置
映射
映射与统一设置的区别
自行指定映射的颜色
ggplot(data = iris)+
geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length,
y = Petal.Length,
color = Species))+
scale_color_manual(values = c("blue","grey","red"))
想要什么颜色就有什么颜色
按照颜色的十六进制代码
ggplot(data = iris)+
geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length,
y = Petal.Length,
color = Species))+
scale_color_manual(values = c("#2874C5","#e6b707","#f87669"))用别人的配色风格来给自己的图配色-用paletteer来举例
ggplot(data = iris)+
geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length,
y = Petal.Length,
color = Species))+
scale_color_paletteer_d("awtools::mpalette")绘制箱线图
ggplot(data = iris,mapping = aes(x = Species,
y = Sepal.Width,
fill = Species))+
geom_boxplot()让点抖动起来
ggplot(data = iris,mapping = aes(x = Species,
y = Sepal.Width,
fill = Species))+
geom_boxplot()+
geom_jitter()图片保存
#2.ggplot系列图(包括ggpubr)通用的简便保存 ggsave
p <- ggboxplot(iris, x = "Species",
y = "Sepal.Length",
color = "Species",
shape = "Species",
add = "jitter")
ggsave(p,filename = "iris_box_ggpubr.png")还可以用通用的方法
保存为PPT格式
#eoffice包 导出为ppt,全部元素都是可编辑模式
library(eoffice)
topptx(p,"iris_box_ggpubr.pptx")拼图
现成的画图代码
画图的正确思维
1、我的数据适合用什么图展示？多看文献
2、搜画图代码
代码可复制，图片美观
提供了代码的示例数据
示例代码+示例数据√
3、仿制示例数据
数据类型、数据结构相同
组织方式、对应关系
4、套代码、调细节
小工具分享
1、浏览器插件：沉浸式翻译，推荐使用微软edge的浏览器
2、AI工具monica，要收费
原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。
如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
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