我将举一个例子来问我的问题。我有两个档案:
File1-
TR100013|c0_g1
TR100013|c0_g2
TR10009|c0_g1
TR10009|c0_g2
File2-
TR100013|c0_g1 AT1G01360.1 78.79 165 35 0 301 795 19 183 2E-089 272
TR100013|c0_g2 AT1G01360.1 78.79 165 35 0 301 795 19 183 2E-089 272
TR10009|c0_g1 AT1G16240.3 77.42 62 14 0 261 76 113 174 4E-025 95.9
TR10009|c0_g2 AT1G16240.2 69.17 120 37 0 1007 648 113 232 2E-050 171
TR29295|c0_g1 AT1G22540.1 69.19 172 53 2 6 521 34 200 2E-053 180
TR49005|c5_g1 AT5G24530.1 69.21 302 90 1 909 13 39 340 5E-157 446
预期输出:
TR100013|c0_g1 AT1G01360.1 78.79 165 35 0 301 795 19 183 2E-089 272
TR100013|c0_g2 AT1G01360.1 78.79 165 35 0 301 795 19 183 2E-089 272
TR10009|c0_g1 AT1G16240.3 77.42 62 14 0 261 76 113 174 4E-025 95.9
TR10009|c0_g2 AT1G16240.2 69.17 120 37 0 1007 648 113 232 2E-050 171
我想比较两个文件。如果第一列在两个文件中是相同的,那么打印第二个文件的整个行,这在两个文件中都是常见的。
发布于 2015-07-15 01:17:09
使用awk
awk 'NR==FNR{a[$1]++;next};a[$1]' file1 file2
grep
也可以这样做:
grep -wf file1 file2
-w
只匹配整个单词。
-f
使用模式指定文件。
https://stackoverflow.com/questions/31426071
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