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社区首页 >专栏 >我怀疑他们根本就不想公开单细胞测序数据

我怀疑他们根本就不想公开单细胞测序数据

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生信技能树
发布2025-07-24 10:59:43
发布2025-07-24 10:59:43
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文章被收录于专栏:生信技能树生信技能树

凡是做了单细胞转录组但是不给出来表达量矩阵文件的研究成果的可信度都大打折扣,基本上可以当做是一个笑话看看就行了!

当然了,也有好多人因为淋过雨所以也不希望其他人过的太顺利,哪怕是被审稿人或者杂志要求公开测序数据,也是装模作样的搞一个fastq文件,增加大家使用数据的门槛。更无语的是,上传到数据库后就无限期保密。比如这个文章:《Single-cell sequencing of ascites fluid illustrates heterogeneity and therapy-induced evolution during gastric cancer peritoneal metastasis》,可以看到从2022-12-12发布数据后的3年多,陆陆续续有40个课题组申请了,但是他们就批准了一次:

  • https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa-human/browse/request/HRA002712/detail

陆陆续续有40个课题组申请了

这个并不是 ngdc.cncb.ac.cn 数据库方面的问题,因为可以看到数据库管理员基本上一个月内都会审批的,符合申请条件的都批准了。但是到了作者那边就无限期忽视。。。

  • 国家基因组数据中心(National Genomics Data Center,简称NGDC)是中国国家生物信息中心(China National Center for Bioinformation,简称CNCB)的一部分,致力于通过提供大规模的生物信息资源来推动生命科学和健康科学的快速发展。NGDC提供了一个数据存档、管理和分析的平台,以支持全球生命科学和健康科学的研究。

我还是蛮好奇的作者怎么样搞出了一个丑爆了的降维聚类分群图:

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原始发表:2025-07-23,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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