Dynamic-BW - 动态基因表达图谱【国家生物信息中心】

简介

Dynamic BodyMap （http://bioinfo.ibp.ac.cn/Dynamic-BM/）是一个涵盖时间序列 RNA 测序数据集中多个物种的数据库。它专门整理时间序列 RNA 测序数据，当前版本的 Dynamic-BM 包含 2203 个 RNA 测序样本（114 个数据集），涵盖 5 个物种的 20 多个组织。

搜索

在网站首页的搜索框中，先选择一个物种，然后属于一个基因的 Symbol ID，点击搜索即可得到基因的动态表达模式。

在左侧的选项卡中可以选择不同的组织类型，但是需要注意的是，这里的统计图可能并没有显示完全，更详细的展示需要在 Dynamic-Expression 板块中查看。

动态表达

在主页中，点击 Dynamic Expression 板块可以跳转到相应页面。

选择一个基因搜索后每个板块信息如下图所示：

数据集

针对单个数据集，数据库也提供了检索筛选页面。

可以根据数据集信息进行初步筛选和查看：

点击数据集 cluster，将会显示使用短时间序列表达矿工（STEM）对时间 RNA-seq 数据集进行聚类分析的结果：

Dev-lncRNAs

数据库中 Dev-lncRNAs 部分是发育相关 lncRNA 的知识库。也提供树状视图和表格视图这两种显示这些 lncRNA 的方法。个人更推荐使用表格视图，其组织方式和数据集类似。

数据下载

在网站顶部的选项卡中有数据下载选项框，可以直接下载处理后的表达信息。也有相应的数据来源信息，也可以链接到原始数据进行下载处理。