首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
首页
学习
活动
专区
圈层
工具
MCP广场
社区首页 >专栏 >套娃似的找了四个文献才找到的巨噬细胞 M1 和 M2 signatures,不来看一下吗?

套娃似的找了四个文献才找到的巨噬细胞 M1 和 M2 signatures,不来看一下吗?

作者头像
生信技能树
发布2025-05-27 09:20:45
发布2025-05-27 09:20:45
4560
举报
文章被收录于专栏:生信技能树生信技能树

为了绘制张泽民大佬团队的新发表文献《Distinct cellular mechanisms underlie chemotherapies and PD-L1 blockade combinations in triple-negative breast cancer》中的双向小提琴图,我找了一下文献中 M1 和 M2 signatures,发现文章中没有提到!下面这个图是对巨噬细胞的亚群使用 M1 和 M2 signatures 两个基因集做的一个打分。

然后,我搜了一篇文章,忘记怎么搜到的了,标题为《Single-cell dissection of cellular and molecular features underlying human cervical squamous cell carcinoma initiation and progression》,文献中用这两个 M1 和 M2 signatures做的 tsne 散点图的打分分布,如下:

查看文献细节发现还不是这个文献自己的!但是好歹给了一个参考文献 32,哭死!

看参考文献32,标题为《Single-Cell Map of Diverse Immune Phenotypes in the Breast Tumor Microenvironment》,人家提供了一个附件列表(可以直接下载Table S4使用,很方便)啊:

列表如下:

M1 Signature 来源

M2Suppressive Signature 来源

具体的基因列表

其他细胞的signature也有,超好啊!

英文术语

中文术语

Treg

T细胞调节

CD8 T Cell Activation

CD8 T细胞激活

Anti-inflammatory

抗炎症

Anergy

无反应性

Pro inflammatory

促炎症

Lipid mediators

脂质介质

Glycolysis

糖酵解

TCA cycle

三羧酸循环

Pentose Phosphate Pathway

戊糖磷酸途径

Glycogen Metabolism

糖原代谢

Glucose Deprivation

葡萄糖剥夺

M1 Macrophage Polarization

M1型巨噬细胞极化

M2 Macrophage Polarization

M2型巨噬细胞极化

Cytolytics effector pathway

细胞毒性效应途径

Type I Interferon response

Ⅰ型干扰素反应

Type II Interferon Response

Ⅱ型干扰素反应

Hypoxia/HIF regulated

缺氧/HIF调控

TCell Terminal Differentiation

T细胞终末分化

G1/S

G1/S期

G2/M

G2/M期

还不去下载下来吗!

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2025-05-26,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 生信技能树 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
目录
  • 列表如下:
  • M1 Signature 来源
  • M2Suppressive Signature 来源
  • 具体的基因列表
  • 其他细胞的signature也有,超好啊!
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档