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张锋团队:一种新型可编辑的蛋白质递送系统

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一只羊
发布2023-09-01 11:22:45
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发布2023-09-01 11:22:45
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文章被收录于专栏:生信了生信了

和大家分享一篇张锋团队最近发表在Nature上的研究“Programmable protein delivery with a bacterial contractile injection system”,一种可编辑的蛋白质递送系统,有望将任何蛋白精准地递送到目标细胞,与CRISPR/Cas9技术一样,这也是从细菌中获得启发和改造的一项技术。自然界内存在这样一些内共生菌,它们寄生在宿主体内,当宿主攻击有机体时,它会分泌一些因子杀伤有机体为宿主提供营养,与宿主互利共生;上述运输因子到有机体内的系统称作收缩注射系统(Contractile injection systems , CIS)。

发光杆菌是昆虫病原菌线虫的共生菌,体内CIS被称作PVC (Photorhabdus virulence cassette )。PVC由约20kb操纵子的编码翻译而成,上游的19.6kb 包含PVC的结构和辅助基因(pvc1-16),下游4.2kb包含编码发光杆菌的天然毒素pdp1、pnf和相关的调节基因。

研究团队通过基因工程实现了PVC的重构:构建两个质粒pPVC和pPayload分别携带pvc1-16与 payload and regulatory基因,将这两个质粒同时转化到大肠杆菌中,扩大培养后进行蛋白纯化,最后成功获得了载有天然载物的PVC混悬液。基因工程获得的PVC在结构和功能上与天然PVC一致。

若要将PVC运用于蛋白递送,要解决两个主要问题:(1)PVC如何招募天然的荷载物;(2)PVC如何靶向目的细胞。根据清华大学高宁团队的研究,荷载物的N末端信号肽序列参与招募。张锋团队构建了融合有NTD的GFP/CRE/ZFN的pPayload质粒,可成功被PVC运输到昆虫细胞发挥作用。这再次证明了高宁团队的研究成果。

关于PVC的靶向性,在结构上,PVC的尾纤维结构类似于T4噬菌体的尾纤维,且Pvc13蛋白(即尾纤维结构)具有一段与T4噬菌体尾纤维相似的结构域,通过AlphaFold预测Pvc13尾纤维的尖端结构(与靶细胞进行初接触的结构域),确定pvc13的C末端形成的球状尖端螺旋管结构域是尾纤维的结合结构域。PVC尾纤维与噬菌体尾纤维不同的是,PVC尾纤维基因pvc13还含有来自五型腺病毒的受体结合蛋白的区域,为PVC尾纤维参与真核生物体的识别提供了理论基础。

那么对Pvc13尾纤维蛋白进行修饰是否可以改变PVC的靶向性呢?研究团队构建了两个针对人类细胞特异性结构域的pPayload质粒:一个是针对五型腺病毒的三聚体结构域(Ad5),另一个是针对EGFR设计的特异性锚蛋白重复序列 (DARPin) E01,将上述两序列插入到pvc13的C末端,产生pvc13-Ad5-knob或pvc13-E01-DARPin的pPayload质粒,将获得的PVC悬液处理A549细胞(高表达EGFR并对五型腺病毒敏感),改造过的PVC可有效结合到细胞上并杀死细胞。

那么PVC是否也可以在体内发挥传递作用呢?研究团队构建了靶向小鼠细胞的PVC变体,颅内注射成功将CRE重组酶运载到小鼠颅内并发挥功能。

值得关注的是,PVC在小鼠体内未激活任何免疫细胞、未产生炎症因子,也没有细胞毒性,体内代谢快。

综上,PVC作为一个可编辑的蛋白传递系统,具有较大的发展潜力,预计将在生物医药领域得到广泛关注和应用。

参考

[1] Kreitz, J., Friedrich, M.J., Guru, A. et al. Programmable protein delivery with a bacterial contractile injection system. Nature 616, 357–364 (2023). https://doi.org/10.1038/s41586-023-05870-7

[2] Feng Jiang et al., N-terminal signal peptides facilitate the engineering of PVC complex as a potent protein delivery system.Sci. Adv.8,eabm2343(2022). DOI:10.1126/sciadv.abm2343

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原始发表:2023-05-07,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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