R Dplyr:按两个变量分组，并计算外部组的行数 - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

R语言︱数据集分组大型数据集通常是高度结构化的，结构使得我们可以按不同的方式分组，有时候我们需要关注单个组的数据片断，有时需要聚合不同组内的信息，并相互比较。...## #dplyr中基本函数 select——子集选取（筛选变量，列） select(Hdma_dat,pclass,survived) ##选择pclass变量 ?...1 2 [6,] 1 2 [7,] 1 2 [8,] 1 2 [9,] 1 2 [10,] 1 2 ##后续处理 ##计算组的长度和组内均值...可以看到，计算结果中的第一列实际上是“SELLERID.CLIENT”，我们需要把它拆分成两列并调换顺序才行。...5、which定位函数功能：返回服从条件的观测所在位置（行数），有一定的排序功能在其中。

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R语言数据处理：飞机航行距离与到达延误时间有什么关系??

数据分析有一半以上的时间会花在对原始数据的整理及变换上，包括选取特定的分析变量、汇总并筛选满足条件的数据、排序、加工处理原始变量并生成新的变量、以及分组汇总数据等等。...而本文介绍的dplyr包简直就是Hadley Wickham （ggplot2包的作者，被称作“一个改变R的人”）大神为我们提供的“数据再加工”神器啊。...3.数据计算数据处理之后，就进入计算分析步骤啦。在这个环节，主要历经三个过程：数据分组（Split）：可以指定目标变量，将数据进行分组。...) by_dest 由图可知，经分组后，一共有104组数据，即本次分析的目的地有104个。...3.2 应用函数及组合结果我们使用dplyr包中的summarize()函数，进行数据统计指标的获取及组合。计算出不同目的地的平行航行距离以及平均延误时间。

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数据处理|R-dplyr

dplyr包实现数据的清洗处理，包括数据整合、关联、排序、筛选、汇总、分组等。...arrange(iris,Sepal.Length) # 将数据按照Sepal.Length升序排序 5）变量变换/重构 mulate()函数可以数据拓展，也可以在保留原变量的基础上增加变量，进行数据处理...Width) #计算一个或多个新列并删除原列 6）数据汇总 summarize()函数实现数据集聚合操作，将多个值汇总成一个值 summarise(iris,avg = mean(Sepal.Length...Q：按品种分组，分别计算花萼宽度的均方差 summarise(group_by(iris,Species),sd=sd(Petal.Width)) 8）连接操作符 dplyr包里还新引进了一个操作符,%...注意：bind_rows()函数需要两个合并对象有相同的列数，而bind_cols()函数则需要两个合并对象有相同的行数。

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Day6 呦呦鹿鸣—学习R包

)以dplyr包为例官方包的文档dplyr示例数据test R自带的iris数据第1，2，51，52，101，103行?...(2)按列名筛选select(test, Petal.Length, Petal.Width)iris %>% select(Species, Sepal.Length)3.filter()筛选行/返回具有匹配条件的行可以按照某分类变量的值进行数据筛选...summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)) # 先按照Species分组，计算每组Sepal.Length...(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))R中的管道操作符2：count统计某列的unique值count(test,Species)分类变量每个变量值的频数dplyr处理关系数据将...= 'x')6.简单合并bind_rows(test1,test2)函数需要两个表格列数相同bind_cols(test1,test2)函数则需要两个数据框有相同的行数思维导图生信星球打卡任务，菜鸟一枚

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【R语言】dplyr对数据分组取各组前几行

所以在画图的时候，也需要区分这三类。下面这张表就是GO富集分析得到的结果，我们可以根据ONTOLOGY这一列来分组，就可以得到BP，CC和MF三个组。...然后取每一个组的前10个条目或者前5个条目来绘制柱形图或者气泡图。那么问题来了，如何分组取前几行。今天小编就跟大家分享一个专业处理数据框的函数dplyr。...top_n这个函数来输出每个组的前五行，wt是排序的依据，根据校正之后的p值来排序，n=-5是按从小到大排序。...filter(row_number() <= 5) r6 通过filter来控制行数<=5 最后我们来看看这六种方法得到的结果究竟是不是一样的，dplyr这个包里面有函数叫all_equal专门用来判断两个数据框是不是一样的...如果GO富集结果默认没有按p.adjust排过序，那么就需要选择带有排序的方法，如top_n和slice_min。

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快速掌握R语言中类SQL数据库操作技巧

例如：合并来源不同，结构相似的两个表格 3.1 向量合并 #一维向量合并直接将要合并的变量以","分割放到c()中即可。...此处仅讲述aggregate数据分组计算内容，更多分组计算内容参考→《R语言分组计算，不止group_by》 dplyr包中的group_by联合summarize group_by和summarise...单变量分组计算 group_by和summarise多变量分组计算 ddply分组计算示例 5.1 aggregate语法 aggregate(x, by, FUN) #x为数据集 #by为分组变量列表...可以重点了解一下 aggregate(formula, data, FUN) #Formulas, one ~ one, one ~ many, many ~ one, and many ~ many: #一组对一计算变量函数型分组计算...，函数型分组计算：cbind（计算变量1，计算变量2）~分组变量1+分组变量2…… > aggregate(cbind(ncases, ncontrols) ~ alcgp + tobgp, data

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手把手教你R语言方差分析ANOVA

在R语言中，实现方差分析主要涉及到以下步骤：数据导入数据清洗ANOVA计算结果解析ANOVA评估首先，你需要一个数据集，其中包含至少一个分类变量（通常是因子类型）和一个或多个数值型变量。...如果你的数据已经存储在一个外部文件中（如CSV、Excel或RData），你需要使用适当的R函数（如read.csv(), readxl::read_excel(), load()等）将其加载到R环境中...，X是分组变量)；再使用summary函数获取单因素方差分析的结果。...F值越大，自变量引起的变化越有可能是真实的，而不是偶然的； Pr(>F)列是F统计量的p值。这表明，如果组均值之间没有差异的原假设成立，那么从检验中计算出的F值发生的概率大小。...= 77)t.test(RR ~ D, data = data_ttest)step6: 后置检验ANOVA结果仅仅揭示多个组间的差异结果，具体到哪两个组内部差异还需要做后置检验后置检验通常采用TukeyHD

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从头学R语言——DAY 3

学习资源来自生信星球R包R包直接在Rstudio页面下载的3大来源：官网CRAN、Biocductor、github设置镜像CRAN的镜像网站可以直接在tools-global options（或快捷键...)dplyr包dplyr作为tidyverse中的核心包之一，主要用于数据转换。...此处先掌握dplyr的5个基本函数：mutate()，select()，filter()，arrange()，summaries()；1个重要的管道工具%>%#用dplyr包进行数据转换#5个核心函数test...Sepal.Length的平均值和标准差# 先按照Species分组，计算每组Sepal.Length的平均值和标准差group_by(test, Species)summarise(group_by(...chr：字符串dttm：日期+时间型变量lgl：逻辑型变量fct：因子，R中具有固定数目的值的分类变量date：日期型变量深刻感受不同连接的区别存疑问题☆尚有疑问：count(test,Species)

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R︱高效数据操作——data.table包（实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并）

R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table) 同时，data.table与data.frame数据呈现方面，还有有所不同的。...data.table包提供了一个非常简洁的通用格式：DT[i,j,by]，可以理解为：对于数据集DT，选取子集行i,通过by分组计算j。...2、按条件行筛选从前用subset的方式进行筛选比较多， new=14,select=a:f) （1）单变量现在data.table与dplyr from_dplyr =...DT数据集按照x分组，然后计算v变量的和、最小值、最大值。（2）dplyr函数利用%>%（链式操作）来改进：链式操作是啥意思呢？...3、第三种方式：key-merge setkey(DT,x) setkey(X,V1) merge(DT, X) 预先设置两个数据集的key后，也可以用比较常见的merge函数来进行数据合并。

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Day6-橙子

R包本文内容均来自花花老师生信星球学习小组R包是多个函数的集合，具有详细的说明和示例。...("stringr")#安装来自cran的stringr包BiocManager::install("limma")#安装来自Biocductor的limma包加载加载R包的两个函数library和require...")#安装library(dplyr)#加载dplyr示例数据使用内置数据集iris的简化版赋值给变量testtest dplyr五个基础函数...Sepal.Length的平均值和标准差# 先按照Species分组，计算每组Sepal.Length的平均值和标准差group_by(test, Species)summarise(group_by(...cbind()函数和rbind()函数;注意，bind_rows()函数需要两个表格列数相同，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数test1 <- data.frame(x = c(

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GEO数据挖掘-基于芯片

ids R包里的注释表格变成数据框# 方法2 下载并读取GPL网页的表格文件，按列取子集#⭐要操作的地方library(tinyarray...annotation_col = annotation_col：添加列注释，即样本的分组信息。scale = "row"：按行标准化，使每行数据的均值为0，标准差为1。...在差异基因表达分析中，设计矩阵是一个非常重要的步骤。设计矩阵描述了实验设计和样本分组信息，为后续的线性模型拟合提供基础。注：因子变量 GroupGroup 是一个因子变量，表示实验分组。...它有两个水平："Normal" 和 "Disease"。前10个样本属于 "Disease" 组，后10个样本属于 "Normal" 组。...5.2.4 ids = distinct(ids,symbol,.keep_all = T)使用 dplyr 包中的 distinct 函数，从数据框 ids 中移除重复的行，并保留每个 symbol

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DAY6-学习R包

install.packages(“包”)或BiocManager::install(“包”)install.packages("dplyr") 加载 library和require 使用一个R包需先安装再加载...library(dplyr）dplyr五个基础函数mutate(),新增列——mutate(test, new = Sepal.Length*Sepal.Width)要修改的数据框的名称将创建的新变量的名称将分配给新变量的值...sd（）计算标准差group_by(test, Species)#按照Species分组并汇总summarise(group_by(test,Species),mean(Sepal.Length),sd...(Sepal.Length))#按照Species分组，计算每组Sepal.Length的平均值和标准差并汇总dplyr两个实用技能管道操作 %>% —— 相当于将左边的作为右边函数的第一个参数，快捷键..., y = test1, by = 'x')简单合并bind_rows()函数需要两个表格列数相同bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行图片

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R语言之数值型描述分析

epiDisplay 包的函数 summ( )作用于数据框可以得到另一种格式的汇总输出，它将变量按行排列，把最小值和最大值放在最后两列以方便查看数据的全距。...cont.vars dplyr::select(birthwt, age, lwt, bwt) 接下来，先计算这 3 个变量的描述性统计量，然后按照母亲吸烟情况（smoke）分组考查描述性统计量。...除了上面提到的函数 summary( )，R 中还有很多用于计算特定统计量的函数（见第二章）。...$race), mean) 这里的分类变量有 2 个，其中 smoke 有 2 个类别，race 有 3 个类别，上面的命令按照这两个变量各类别的所有组合（共 6 组）计算均值。...实际上，在第 3 章介绍的 dplyr 包里的函数 group_by( )和 summarise( )就能非常灵活地计算分组统计量。

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生信星球——生信入门DAY6:学习R包

(package)将加载名为package的命名空间，并添加到包的搜索列表中。...source() : source使R直接接受来自命名文件、URL或表达式的输入，比如source(“Functions.R”)。...从该文件读取和分析输入，直到到达文件的结尾，然后在选定的环境中按顺序解析表达式。简单来讲，library更像装载，require不会报错，source装载的方式则不太一样。...分组，再计算均值和标准差同时，对于这样一组简单的数据，用管道操作也可以达成相同的目的，但是更有趣test %>% group_by(Species) %>% summarise(mean(Sepal.Length...bind_rows()#函数需要两个表格列数相同bind_cols()#函数则需要两个数据框有相同的行数

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Day6-梦琪

Day6-2023.12.02学习R包-dplyr是R中用来进行数据操作的一个包,提供了一些功能强大，易于使用的函数，这些函数对于数据探索分析和数据操作而言非常实用，dplyr主要用于数据清理，包括重命名...")或者 BiocManager::install(“包”)安装包library(dplyr) 加载包 library函数是加载和使用R语言中的函数库和扩展包二、dplyr的五个基础函数mutate(...Sepal.Length的平均值和标准差group_by(test, Species) 按照Species分组summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length...), sd(Sepal.Length))计算每组Sepal.Length的平均值和标准差三、dpylr的两个实用技能管道操作符：管道符 %>% ，符号左侧表示数据的输入，右侧表示下游数据处理环节count...y = test1, by = 'x')6.简单合并bind_rows()函数需要两个表格列数相同，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数感觉今天的学习内容是要背下来的那种，生日快乐小焦加油努力向前冲

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R||R语言基础（三）_R包

今天继续学习R语言基础的R包使用，以R包：dplyr为例数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”)...() 按列筛选 1)按列号筛选 select(test,1) select(test,c(1,5)) #提取第一列和第五列由上图可以看出直接提取也是可以的 2)按列名筛选 select(test...Sepal.Length的平均值和标准差 group_by(test, Species) #按照Species分组 # 先按照Species分组，计算每组Sepal.Length的平均值和标准差...summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)) dplyr的两个实用技能 1.count统计某列各元素出现的次数...，需要两个表格的行数相同。

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Day6-蓝色柠檬

今天的任务是学习R包。以dplyr包的安装加载和使用为例进行学习，因为R包之间的使用是相通的，掌握了一个，后面的可以通过具体代码的学习进行使用。...dplyr这个包我以前没有接触过，从这个入手，又能学习到新东西真不错。一、软件的安装镜像设置就是为了加快R包的安装下载速度，节约时间。...(Sepal.Length)) #计算每组Sepal.Length的平均值和标准差三、dplyr两个实用技能3.1管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)加载tidyverse包后才可用...3.2count统计某列的unique值count(test,Species)四、dplyr处理关系数据首先先手动输入两个test的表格test1 的就不同了bind_rows(test1, test2) #需要两个表格列数相同bind_cols(test1, test3) #需要两个数据框有相同的行数写在最后，今天成功手动安装了RStutio

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常用R包-dplyr

dplyr是一个在R语言中非常流行的数据处理包，它提供了许多功能强大且易于使用的函数，包括 select、 filter、mutate、arrange和summarize 等。...一、安装和加载R包镜像设置（清华源和中科大源）options——安装install——加载library/ require CRAN网站R包安装命令 install.packages("dplyr")...(dplyr) 二、首先创建示例数据框仍直接使用内置数据集iris，并简化 test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),] 三、dplyr基础函数 1、filter()筛选行...Sepal.Length的平均值和标准差 # 先按照Species分组，计算每组Sepal.Length的平均值和标准差 group_by(test, Species) summarise(group_by...()函数则需要两个数据框有相同的行数 test1 <- data.frame(x = c(1,2,3,4), y = c(10,20,30,40)) test1 test2 <- data.frame(

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学习R包

R包是多个函数的集合，具有详细的说明和示例。...R的内置数据，test dplyr包不仅可以对单个表格进行操作，也可以对双表格进行操作。...dplyr包有很多函数，为了防止dplyr包中的函数名与其他函数产生冲突，使用时前面加上“包名::”dplyr五个基础函数mutate(),新增列select(),按列筛选按列号筛选注意筛选内容与表格内容的统一...Sepal.Length的平均值和标准差eg:先按照Species分组，计算每组Sepal.Length的平均值和标准差group_by(test, Species)summarise(group_by...，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数函数和R包的学习方式快速查看函数帮助文档?

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Day6——R包

one_of函数R语言中使用vars参数指定数据框中需要分析的字段索引范围在R语言中，我们经常需要对数据框进行分析和处理。...数据框是一种二维的表格结构，其中包含了多个变量(字段)和观测值(行)。在进行数据分析时，有时我们只对数据框中的特定字段感兴趣，而不需要使用所有的字段。...), sd(Sepal.Length))#计算每组Sepal.Length的平均值和标准差dplyr两个实用技能管道操作 %>%加载任意一个tidyverse包即可用管道符号#%>% （向右操作符，forward-pipe...值计数函数计算数据集中列唯一值的数量count(test,Species)## Species n##1 setosa 2##2 versicolor 2##3 virginica 2dplyr...(x = test2, y = test1, by = 'x')#返回无法与y表匹配的x表的所记录简单合并bind_rows()函数需要两个表格列数相同，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数示例数据

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