如何在chisq.test()和fisher.test()中模拟p值 - 腾讯云开发者社区

文章/答案/技术大牛

发布

R语言系列第四期：③R语言表格数据率的比较

0.2408799 sample estimates: p 0.1813953 #Tips：函数prop.test()中的三个参数分别是阳性观测数，总数，以及参考概率值。...然后我们得到的P值是0.07016，这个值与0.05很近，得到的是无差异的阴性结果。...这个检验在给定行和列的边际值的情况下计算2*2表格的条件分布。...不过这里的结果同样和假设检验的结果相矛盾，原因同上。和fisher.test()一样，在chisq.test()中的标准χ2检验需要矩阵类型的数据源。...()和 fisher.test()，但是后者在每一格数字比较大而且超出两行或两列时的计算量非常大。

3.2K1 0

R语言系列第四期：③R语言表格数据率的比较

1.1K1 0

您找到你想要的搜索结果了吗？

是的

没有找到

R语言入门之独立性检验

卡方检验对于2维的频率表，我们可以使用R语言的卡方检验函数chisq.test()来进行独立性检验，用以判断行变量和列变量之间是否相关。...需要注意的是卡方检验要求列联表中每格的数值或者期望值大于5，如果该条件不满足，那么R中就会使用Yate’s矫正公式进行计算： A P值是用卡方分布计算出来的，我们也可以是用蒙特卡洛（Monte Carlo）算法来计算p值，只要加上参数simulate.p.value = FALSE，在这里就不详细介绍了，有兴趣的朋友可以自己去了解了解...fisher.test(mytable) ? 在R中输出的结果有p值、备择假设、95%置信区间、OR值，从结果来看p-value>0.05,说明吸烟和性别不相关，这个结论和卡方检验的结果一致。...从上面的结果可以看出，以alpha=0.05为检验水准时，p-value 和健康有关，同时依据OR值大于1可以说明吸烟是健康的危险因素。

2.8K2 0

【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper

接下来我们就来用R代码做卡方检验，算出P值先来对年龄做卡方检验 ################# #Age ################# table=matrix(c(51,66,66,189...(table) 这里算出来的卡方值和p值跟Table2中是一致的接下来我们来对组织病理分期来做卡方检验 ######################## #stage #############...(table) 这里算出来的卡方值跟文中是一样的，但是p值略微有些出入，并且这里有个warning，大意是算出来的p值可能不准。...解决方法是用Fisher精确检验 fisher.test(table) 你会发现这个时候就没有warning了，并且p值跟文中的是一样的，这是巧合吗？...chisq.test(table) 计算出的卡方值和p值都跟文中一样剩下的临床特征的卡方检验，就留给大家自己练习吧！

2.5K3 0

R in action读书笔记（6）-第七章：基本统计分析（中）

残差；将缺失值作为一种有效值；进行行和列标题的标注；生成SAS或SPSS风格的输出。...卡方独立性检验可以使用chisq.test()函数对二维表的行变量和列变量进行卡方独立性检验 > library(vcd) > mytablep-value = 0.001463#治疗情况和改善情况不独立 2....Fisher精确检验可以使用fisher.test()函数进行Fisher精确检验。Fisher精确检验的原假设是：边界固定的列联表中行和列是相互独立的。...Count Data data: mytable p-value = 0.001393 alternative hypothesis: two.sided 这里的fisher.test()函数可以在任意行列数大于等于

1.8K2 0

R语言各种假设检验实例整理（常用）

p是原假设落在小区间的理论概率，缺省值表示均匀分布，rescale.p是逻辑变量，选择FALSE（缺省值）时，要求输入的p满足和等于1；选择TRUE时，并不要求这一点，程序将重新计算p值。...chisq.test(Y,p=p) ?...解：最小期望值T=(11*9)/33=3 fisher.test( ) fisher.test(x, y = NULL, workspace...以上资料中有以人（即6号顾客）表示对咖啡和奶茶有同样爱好，用0表示，因此在样本容量中不加计算，所以实际上N=12.如果H0假设为真，那么符合p为1/2的二项分布，如果H1为真，那么顾客喜欢奶茶的人数小于理论值...alternative是备择假设，有单侧检验和双侧检验，mu待检参数，如中位数M0.paired是逻辑变量，说明变量x,y是否为成对数据。

4.6K4 0

小白笔记——R语言（1）

，如字符串a中’_’的位置 8、结合定位函数，对字符串如x345_xbt,进行拆分，利用函数substring(要拆分的字符串，开始的字符位置，结束的字符位置) namecol1 <- substring...rownames(R1) nam2 <- rownames(R2) nam3 <- rownames(R3) tnam 和rownames...或者取一个向量中唯一一个值的数据，合并重复数据。...(x) asin(x) acos(x) min(x) max(x) range(x) length(x) 统计检验 mean(x) sd(x) var(x) median(x) quantile(x,p)...chisq.test glm(y ~ x1+x2+x3, binomial) friedman.test ... 18、ls() 列出工作空间中的对象；rm() 删除工作空间中的对象 19、对象类型转换

9739 0

R|tableone 快速绘制文章“表一”-基线特征三线表

由于数据中的分类变量是数值形式，所以分类变量展示的也是均值（标准差）。...此处随意选择一些变量进行功能展示, 分类变量显示计数和百分比。 3 非正态分布变量由于默认连续变量呈正态分布，因此上面的连续变量均表示为均数＋标准差。...注意NA不作为分组结果可看出，对trt进行分组且对每一组均进行了汇总，且统计输出了检验的P值。...检验方法：分类变量默认使用卡方检验 chisq.test()；连续变量默认使用方差分析oneway.test()，当两组时方差分析等用于t检验。...()等效；分类变量可使用fisher.test()进行fisher精确检验，通过exact（）指定进行fisher精确检验的变量。

2.9K3 0

R学习—检验

结果意义：P值小于显著性水平时拒绝原假设，否则，接受原假设。...结果含义：P值小于显著性水平时拒绝原假设，否则，接受原假设。...具体的假设要看所选择的是双边假设还是单边假设（又分小于和大于） 6、二项分布总体假设检验 binom.test(x, n, p = 0.5, alternative = c("two.sided", "...chisq.test(x, y = NULL, correct = TRUE, p = rep(1/length(x), length(x)), rescale.p = FALSE, simulate.p.value...p-值小于某个显著性水平，则表示拒绝原假设，否则接受原假设。

9164 0

数学建模学习笔记：离散变量联列表检验

论文中的思路：（1）根据一定标准筛选变量；（2）数值变量标准化，分类变量进行哑变量；（3）主成分分析计算每个变量的权重和危害系数得分F值；（4）对F值进行K-Means。...这篇文章里筛选数据的标准：（1）删除缺失比例超过85%的变量；（2）删除确实比例超过50%的样本；（3）根据文献和主观因素，确定影响恐怖事件危害级别的主要因素是财产损失程度和伤亡人数，其他变量与这两个变量做相关性...] 20 24 80 82 [2,] 22 38 104 125 [3,] 13 28 81 113 [4,] 7 18 54 92 > chisq.test...(X) Pearson's Chi-squared test data: X X-squared = 11.989, df = 9, p-value = 0.214 P值大于0.05，接受原假设...to 1 95 percent confidence interval: 0.03974151 1.76726409 sample estimates: odds ratio 0.2791061 P值

7962 0

R语言卡方检验方法总结

这篇文章涵盖了孙振球，徐勇勇《医学统计学》第4版卡方检验章节中的所有内容。课本电子版和配套数据已上传到QQ群，需要的朋友加群下载即可。...本例符合pearson卡方，卡方值为12.85707，p和课本一致。...= 0.01913 卡方值为7.91，和课本一致。...其实非常简单，就是把多个组手动拆分为多个两个组，分别进行卡方检验，和P值比较，只不过这里的P值不再是0.05，而是和组数（比较次数）有关。使用例7-10的数据。...这时的 P' = P / (K * (K - 1) / 2 + 1)，K是组数，一般情况下P=0.05，所以P' = 0.05/(3*(3-1)/2+1) = 0.0125，上面3个卡方分析的P值和0.0125

4K3 0

如何在 SQL 中查找重复值？ GROUP BY 和 HAVING 查询示例教程

如果您想知道如何在表中查找重复值，那么您可以在 SQL 中使用 GROUP BY 和 HAVING 子句。使用 group by 您可以创建组，如果您的组有超过 1 个元素，则意味着它是重复的。...您需要编写一个查询来查找所有重复值。...----+---------+ 例如，您的查询应返回上表的以下内容： +---------+ | Email | +---------+ | a@b.com | +---------+ 用于查找列中重复值的...因此，使用 SQL 中的相关子查询和 EXISTS 子句将一封电子邮件与同一表中的其余电子邮件进行比较，如下所示： SELECT DISTINCT p1.Email FROM Person p1 WHERE...= p1.Id ) 总结这就是如何使用 GROUP BY 和 HAVING 子句在 SQL 中查找重复项的全部内容。我还向您展示了如何使用自联接和带有 EXISTS 子句的子查询来解决这个问题。

17.7K1 0

R语言统计相关函数总结

一、统计学数据的生成函数： norm 正态分布 f F分布 unif 均匀分布 cauchy 柯西分布 binom 二项分布 geom 几何分布 diag 对角阵二、基础的运算函数 abs 绝对值...log10 其他对数 sin,cos,tan 三角函数 sinh,cosh,tanh 双曲函数 poly 正交多项式 polyroot 多项式求根 max 最大元素 min 最小元素 range 最小值和最大值组成的向量...sum 和 prod 元素连乘 pmax 向量间相同下标进行比较最大者，并组成新的向量 pmin 向量间相同下标进行比较最小者，并组成新的向量 cumsum 累积求和 cumprod 连乘 cummax...最大 cummin 最小 mean 均值 weighted,mean 加权平均数 median 中位数三、基础的统计量的计算函数 cor 相关系数 sd 标准差四、基础统计分析函数 chisq.test...正态分布检验 t.test T检验，对总体均值进行区间估计 aov 方差分析 anova 一个或多个模型对象的方差分析 cor.test 相关分析 wilcox.test wilcoxon秩和检验 fisher.test

1.2K3 0

R语言_基本统计分析

as.numeric(as.character(mytable$freq)) mydata = table2flat(mytable) #独立性检验，描述类别变量独立性 #卡方独立性检验 #卡方备注： #p值表示从总体中抽取样本行变量与列变量相互独立的概率...library(vcd) mytable = xtabs(~Treatment+Improved,data=Arthritis) chisq.test(mytable) #治疗和改善不独立 p<0.01...mytable = xtabs(~Sex+Improved,data=Arthritis) chisq.test(mytable) #性别和改善独立 p>0.05 #Fisher精确检验 #原假设是...：边界固定的列联表中行和列是相互独立的 mytable = xtabs(~Treatment+Improved,data=Arthritis) fisher.test(mytable) #Cochran-Mantel-Haenszel...t检验 #假设：组件的差异呈现正态分布 #P值反映了如果实际均值相等，那么获得一个差异如此大的样本的概率小于2.2e-16 library(MASS) sapply(UScrime[c("U1","U2

1.2K2 0

「R」基本统计分析

---- 频数表和列联表本节着眼于类别型变量的频数表和列联表，以及相应的独立性检验、相关性的度量、图形化展示结果的方法。除了使用基础安装中的函数，还将使用到vcd包和gmodels包中的函数。...卡方独立性检验使用chisq.test()函数对二联表的行变量和列变量进行卡方独立性检验。...chisq.test(mytable) : Chi-squared近似算法有可能不准 # 性别和改善情况独立可以通过p-value来看两个变量是否独立。...Fisher精确检验使用fisher.test()函数进行Fisher精确检验，Fisher检验的原假设是：边界固定的列联表中行和列是相互独立的。...（看p值）。

1.9K1 0

「R」频数检验

拟合优度检验（期望频率）卡方检验想要检验假设：结果列result（忽略条件condition）中的两个值在总体中几乎相等（50%-50%）。...#　为result列创建列联表，包含0和1两个值 #　注意“０”和“１”是列名而不是实际的值 ct <- table(data$result) ct #> #> 0 1 #> 17 13 #...= 0.4652 想要检验有不同期望频率的样本（比如下面一个0.75，一个0.25）： # 概率表 —— 和必须为1 pt <- c(.75, .25) chisq.test(ct, p=pt) #...chi_res$statistic #> X-squared #> 5.377778 # 获取p值 chi_res$p.value #> [1] 0.02039484 精确二项检验精确二项检验仅能用于存在两个值的单变量数据...R中的CMH检验可以处理比2x2xK维度更高的数据，例如你处理3x3xK列联表。在接下来的例子里有三个变量：Location，Allele和Habitat。

1.5K1 0

如何在Selenium自动化Chrome浏览器中模拟用户行为和交互？

图片Selenium是一个用于自动化Web应用程序测试的工具，它可以模拟真实的用户在浏览器中进行各种操作，如点击、输入、滚动等。...本文将介绍如何在Selenium中使用Chrome浏览器，并且设置代理服务器来避免被目标网站识别。...，并根据videoInfoList中的数据，设置单元格的值为对应的视频信息 for (int i = 0; i 中创建一个Workbook对象，用于表示一个Excel文件，并创建一个Sheet对象，用于表示一个工作表在Sheet对象中创建第一行，并设置单元格的值为标题、作者、点赞数...、评论数等字段名在Sheet对象中创建后续的行，并根据List中的数据，设置单元格的值为对应的视频信息使用FileOutputStream对象，将Workbook对象写入到一个指定的文件中总结本文介绍了如何在

1.7K3 1

你需要学会100个使用R语言进行的统计检验例子吗

而且chatGPT还给我了R语言代码案例： # 两组样本的t检验 # 假设数据存储在两个向量x和y中 result <- t.test(x, y) print(result) # 多组样本的单因素方差分析...)) # 二分类变量的卡方检验 # 假设数据存储在一个数据框df中，其中变量A和B为二分类变量 result chisq.test(df$A, df$B) print(result) # 配对样本的...Wilcoxon符号秩检验 # 假设数据存储在两个向量x和y中，表示配对样本的测量值 result <- wilcox.test(x, y, paired = TRUE) print(result)...# 二分类变量的Fisher精确检验 # 假设数据存储在一个数据框df中，其中变量A和B为二分类变量 result fisher.test(df$A, df$B) print(result)...# 两个数值变量之间的相关分析 # 假设数据存储在一个数据框df中，其中变量x和y为数值变量 result <- cor.test(df$x, df$y) print(result) # 建立两个数值变量

5412 0

「Workshop」第四十期常用的差异分析方法

如果是定类和定类，此时应该使用卡方分析；如果是定类和定量，此时应该使用方差或者T检验。方差和T检验的区别在于，对于T检验的X来讲，其只能为2个类别比如男和女。...示例我们使用的是R里内置的“npk”数据集，该数据集由24行和5列数据组成，第一列代表区组（共6个），N、P和K分别代表氮、磷和钾元素的使用情况，yield代表豌豆产量，该数据集主要是用来研究不同肥料对豌豆产量的影响...img x<-matrix(c(46,18,6,8),ncol=2,nrow=2) chisq.test(x) chisq.test(x)$expected ###查看理论值 fisher.test(x...img 三种包的区别： 1.limma包做差异分析要求数据满足正态分布或近似正态分布，如基因芯片、TPM格式的高通量测序数据。...个人认为这一项相当于GLM中每个基因的beta值 #####################负二项式广义对数线性模型 fit <- glmFit(DGElist, design) results <-

2K2 1

R中的假设检验方法

在函数shapiro.test()分析中，假设数据向量为正态分布，p值大于0.05说明接受假设（否则拒绝假设），结果中W值越小越接近正态分布。...结果解释：结果中会出现统计量D值和p-value， D值越小，越接近0，表示样本数据越接近正态分布； p值，如果p-value小于显著性水平α(0.05)，则拒绝假设。...说明：ad.test()只有一个参数x，只要是数字向量即可，也可以有缺失值，但是非缺失值数量必须>7，这是R的规定结果解释：结果中会出现统计量A值和p-value： A值越小，越接近0，表示样本数据越接近正态分布...(diet, sex) #或者 fisher.test(table(diet, sex)) 检验结果p值小于0.05说明节食和性别不是独立的，节食的群体中女性的比例要显著高于男性。...：式中n为总观察个数；A为各观察值；nR和nC为与各A值相应的行和列合计的总数。

1.8K3 0

点击加载更多

R语言系列第四期：③R语言表格数据率的比较

R语言系列第四期：③R语言表格数据率的比较

R语言入门之独立性检验

【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper

R in action读书笔记（6）-第七章：基本统计分析（中）

R语言各种假设检验实例整理（常用）

小白笔记——R语言（1）

R|tableone 快速绘制文章“表一”-基线特征三线表

R学习—检验

数学建模学习笔记：离散变量联列表检验

R语言卡方检验方法总结

如何在 SQL 中查找重复值？ GROUP BY 和 HAVING 查询示例教程

R语言统计相关函数总结

R语言_基本统计分析

「R」基本统计分析

「R」频数检验

如何在Selenium自动化Chrome浏览器中模拟用户行为和交互？

你需要学会100个使用R语言进行的统计检验例子吗

「Workshop」第四十期常用的差异分析方法

R中的假设检验方法

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

社区

活动

圈层

关于

腾讯云开发者

热门产品

热门推荐

更多推荐