首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

如何在R中用fread读取.pgn.bz2文件?

在R中使用fread读取.pgn.bz2文件的步骤如下:

  1. 首先,确保已经安装了data.table包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装:
  2. 首先,确保已经安装了data.table包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装:
  3. 导入data.table包:
  4. 导入data.table包:
  5. 使用fread函数读取.pgn.bz2文件。fread函数可以直接读取压缩文件,无需解压缩。示例代码如下:
  6. 使用fread函数读取.pgn.bz2文件。fread函数可以直接读取压缩文件,无需解压缩。示例代码如下:
  7. 请将"文件路径/文件名.pgn.bz2"替换为实际的文件路径和文件名。
  8. 读取完成后,数据将存储在data变量中,可以通过打印data来查看数据。

需要注意的是,fread函数是data.table包中的一个高效读取大型数据集的函数,适用于处理大型数据文件。它可以自动推断数据类型,并具有快速读取速度。

推荐的腾讯云相关产品:腾讯云对象存储(COS)。

腾讯云对象存储(COS)是一种安全、耐用、高扩展性的云存储服务,适用于存储大量非结构化数据,如图片、音视频、备份和归档数据等。它具有高可用性、高可靠性和高性能,可以满足各种存储需求。

产品介绍链接地址:腾讯云对象存储(COS)

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

R读取文件速度太慢?来试试能提速两千倍的fread

R 的 read.table 和 read.csv 读取文件速度比较慢。尤其在读取稍微大一点的数据,需要等很长时间。...在需要读取文件时,尤其读取列数特别多的文件,不妨试试 data.table 包(https://cran.r-project.org/web/packages/data.table)的 fread (...它的参数与 read.table 函数类似,但读取速度有非常大提升。 提速两千倍并不是标题党,而是在一个 489 行、1079796 列、1G 纯文本文件中的实测结果。...使用 read.table 读取文件: times.start <- Sys.time() file.readtable <- read.table('test.file', sep = ' ', header...,竟然花了 20.87 小时,我也懒得去研究是什么原因: Time difference of 20.87034 hours 使用 fread 读取文件: library("data.table")

2.1K20

何在R语言中安装plink2R用于读取plink二进制文件

plink2R的github: 10年之前的包,没有更新,但是有用。所以,安装一下。 R语言是昨天安装的R3.6版本(Linux系统安装老版本的R语言,比如R3.6?)。...1,系统中有git(如果没有,通过手动下载上传也是一样的) 通过git下载: git clone https://github.com/gabraham/plink2R.git 手动下载: 下面以手动下载的文件为演示...: 上传到系统中,解压,进入文件: $ ls data.bed data.bim data.fam plink2R plink2R.R README.md 进入R3.6: install.packages...’ * removing ‘/home/gwas/R3.6/lib/R/library/plink2R’ Warning message: In install.packages("plink2R/",.../R3.6/lib/R/library/00LOCK-plink2R/00new/plink2R/libs ** R ** byte-compile and prepare package for lazy

21310
  • 嵌入式Linux:文件IO和标准IO库

    文件 I/O 主要涉及打开文件读取文件内容、写入文件内容和关闭文件等操作。 常见的文件 I/O 操作包括使用系统调用( open()、read()、write()、close())来进行文件操作。...程序可以使用这个文件描述符执行读取操作,读取文件内容并将其输出到终端上。..."a":追加模式,用于打开一个文本文件以便写入,如果文件不存在,则创建文件文件指针被放在文件的末尾。 "r+":读写模式,用于打开一个文本文件用于读取和写入,文件必须存在。...首先我们打开文件以便写入,然后使用 fwrite() 函数将数据写入文件,最后关闭文件。 2.4、fread文件 fread() 是C语言标准库中用于从文件读取数据的函数之一。...[100]; // 缓冲区用于存储读取的数据 // 打开文件以便读取 file_ptr = fopen("example.txt", "r"); if (file_ptr ==

    10200

    流动的代码:文件流畅读写的艺术(三)

    函数对比 scanf,fscanf,sscanf scanf、fscanf 和 sscanf 是 C 语言中用于输入操作的函数,特别是用于格式化输入。...这允许从文件或其他输入流读取格式化输入。 示例:从文件读取一个整数。 FILE *fp; int n; fp = fopen("file.txt", "r"); if(fp !...如果已经达到文件末尾,返回非零值;否则,返回 0 FILE *filePointer = fopen("file.txt", "r"); // ... 文件读取操作 ......判断方式 文本文件读取是否结束,判断返回值是否为EOF( fgetc),或者NULL(fgets) 二进制文本的读取结束判断,判断返回值是否小于实际要读的个数,例如 fread判断返回值是否小于实际要求的个数...标准库提供的文件操作函数( fread、fwrite、printf、scanf 等)通常都会使用这些缓冲区 功能和使用 提高性能:缓冲区可以减少对底层 I/O(输入/输出) 系统的调用次数,因为数据是在缓冲区中累积起来

    10510

    【C文件操作1】如何写入读取?fopen的6种组合参数怎么用?

    C语言中文件操作,即文件打开,文件写入、文件读取文件关闭等。 在使用这些功能时,需要了解其基本的使用规则,文件读写前,必须先使用fopen函数打开文件。...* @brief: 打开文件 * @para: [path]:文件路径,:"E:\Test\test.txt" * [mode]:文件打开方式(r w a r+ w+...fread 函数原型: /** @func: fread * @brief: 从文件读取 * @para: [buffer]:指向数据块的指针 * [size]:每个数据的大小...1:fread(buf,sizeof(buf),1,fp);,将整个buf数据作为1个数据读取,则读取的个数是1 读取成功返回值为1 调用格式2:fread(buf,1,sizeof(buf),fp);...读(fread)或写(fwrite)文件后,要关闭(fclose)文件。 打开(fopen)文件时,要特别注意打开的参数指定。 带r参数打开文件时,该文件必须存在。

    1.8K50

    python基本文件操作(文件输入和输出

    ;     line = f.readline(); f.close(); 程序会循环独取文件work.txt中所有的行  如果程序在像这样的数据集(输入的行、数字、字符串)上进行循环 我们通常称为迭代... What Are Words 补充:     文件操作中方法:  read:从文件读取N个字符 当未给定参数时 读取所有字符  seek :移动指针  第一个参数 偏移量 第二个参数:从什么位置开始...0 开头 1当前位置 2 结尾 writelines :写入一段字符串序列      文件操作中打开文件的模式:   r: 读方式打开             w: 写方式打开 覆盖原有文件中的内容...:                      r :  只读方式打开                      r+ : 读写方式打开                     w: 指针开头位置,写入方式打开...                    a+: 指针尾部位置 读写方式打开 文件不存在则创建     fread :读取内容                 fwrite: 写内容

    1.1K10

    【C 语言】文件操作 ( fread 函数 )

    文章目录 一、fread 函数 二、缓冲区受限的情况 ( 循环读取文件 | feof 函数判定文件读取完毕 ) 三、处理乱码问题 四、记录读取的字节个数 五、读取到 0 字节的情况 六、读取完毕的情况...七、读取文本文件 "\n" 与 读取二进制文件 "\r\n" 区别 二进制文件读写两个重要的函数 , fread 和 fwrite , fread 用于读取文件 , fwrite 用于写出文件 ; fread...文本文件 ; 一、fread 函数 ---- fread 函数作用 : 从文件读取若干字节数据到内存缓冲区中 ; fread 函数原型 : size_t fread( void *buffer, size_t...0; } 执行结果 : 七、读取文本文件 “\n” 与 读取二进制文件 “\r\n” 区别 ---- 以下区别只在 Windows 系统存在 , 在 Linux / Unix 中读取文本数据与二进制数据没有区别...0xd 对应 ‘\r’ , 第 3 个值是 0xa 对应 ‘\n’ ; 注意 : 最后两个字节是空行对应的 “\r\n” ; fread : buffer = ab cd , read count

    3.6K22

    全国二级C知识点总结7-编译预处理、文件

    l 对程序中用“”括起来的字符串内的字符,即使与宏名相同,也不进行置换。...); l 使用文件方式:r”只读打开一个文本文;”w”只写打开或建立一个文本文件;”a”追加打开一个文本文件,在文件末尾添加数据。...B)只能写不能读 C)可以在原有内容后追加写 D)可以随意读和写 【解析】文件打开方式,‘w’只能向该文件写入,打开的文件不存在则以指定的文件名建立文件存在,则先删除再重建一个文件...10.知识点:fputc()函数和fgetc()函数 l fgetc()函数的调用形式:ch=fgetc(fp);从打开的文件fp中读取一个字符。...,并且每行写一个;第二次fp=fopen(“d2.dat”,”r”); 以写方式打开,然后通过循环每次读取两个数字给k和n,第三次k和n分别得到5和6 例1:(2009-04-40)有以下程序 #include

    71430
    领券