spyder-用Rstudio的姿势使用python

众所周知，小洁老师乃是一只资深的R语言讲师，为了后面更丰富的单细胞分析需求(是的，可以期待出课程，一帮学员催我现学然后教他们)，准备把python搞起！ python的IDE很丰富，可能别人会推荐使用jupyter lab，jupyter notebook，vscode，sublime等，但是在众多的IDE中我注意到一句话：Spyder是目前最接近Rstudio的IDE，所以我就选了它！ 其实还有一个Positron，是Rstudio的公司出品的，可以无缝切换Python和R，目前还不是特别完善，但它可能是未来的主流！

就先看看设置之后的Spyder软件界面，没有一个R语言使用者可以拒绝：

整个一个R里R气！我很喜欢。 下面分享一下要怎么搞它，虽然在各位读者眼里我是个带路的，但是这对我来说也是新知识，一家之言，不保证是最正确最好的，如果后面有改变，那我会在评论区补充。也欢迎各位资深python用户来分享自己的看法。

1.安装miniconda

装miniconda会自带python，它可以用于安装其他软件，是个应用商店。 下载地址： 清华大学开源软件镜像站 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/

右侧<获取下载链接>-应用软件-conda-最前面的，按照自己的系统选择win和mac对应的版本。win要exe，mac要pkg即可，装起来比较简单。(sh是脚本，不要它)

下载下来后和普通软件一样的安装方式，就一路点点点。装好之后和其他软件一样可以在开始菜单里找到

后面的命令行代码都是在这个anaconda prompt窗口里运行的。

2.配置清华的conda镜像

https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/help/anaconda/

conda config --set show_channel_urls yes

然后找到.condarc文件(可以用everything软件搜索)，把官网上面的内容(如下)复制粘贴进去

channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch-lts: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  deepmodeling: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/

3.安装spyder软件

从官方文档上面查找发现支持用conda安装，如果使用默认的安装包来安装，那么我们要用到的重要插件notebook就不能用。

conda create -c conda-forge -n spyder-env spyder numpy scipy pandas matplotlib sympy cython
conda activate spyder-env
conda config --env --add channels conda-forge
conda config --env --set channel_priority strict

4.启动spyder

两种方式，一种是从开始菜单找（spyder-env）

一种是命令行启动（在anaconda promt窗口运行） 需要先用conda activate激活环境(一些尘封的linux知识点，不会也影响用)，然后运行spyder就打开了界面

conda activate spyder-env
spyder

5.安装notebook插件

.py和.ipynb都是常用的文件，很像.R和.Rmd，所以两个都要用。直接用spyder打开很奇怪，看着就不像python代码。

搜索发现，spyder可以打开ipynb文件，是需要安装插件。

插曲:超级搞笑，查到一些答案说去工具栏找插件管理器，结果没找到，一看就是时效性过了

可是没有插件管理器啊。

继续搜索，还是官方文档香，用conda装就是了。官方说了，这个插件只支持conda装的spyder软件，不支持自己下载安装的spyder软件。👇

安装的方法仍然是命令行，在anaconda promt窗口里运行：

conda install spyder-notebook -c conda-forge

6.使用spyder打开jupyternotebook

要先显示notebook窗口

然后点一下下图中的notebook

再从右上角打开！（不支持文件窗格双击打开或者左上角打开）

7.布局和外观

支持rstudio同款布局！

自己调了调字体字号颜色啥的，把字体都调的和Rstudio一样就很顺眼了。

我已经开启了对着R语言学python模式。