利用患者衍生异种移植模型MET 14号外显子跳跃肺癌耐药性进行基因组综合分析原创

非小细胞肺癌NSCLC占肺癌诊断的85%，常见的致癌基因改变包括m mettege fri LK和ROS等。其中Mett外显子14跳跃突变的发生概率为3%~4%，且与不良预后相关。虽然Mett选择性抑制剂为mett外弦子14跳跃突变患者提供了治疗选择，但最终会产生耐药性。为此，研究团队选取了一位携带mett外弦子14跳跃突变的女性NSCLC患者，通过活检获取了在诊断时的原发肿瘤标本和科唑替尼治疗后的耐药标本，将这些标本移植到6~8周龄的雌性nod SCID小鼠体内，在特定病原体免疫环境中传带3~5次，建立了两个患者原心，一种移植模型PDX模型进行比对。在数据分析过程中，研究团队使用CTN将读书比对到HG19，并进行去重复重排。

据碱基质量分数虫校正和体细胞变异检测，研究结果显示，患者初始对科唑替尼治疗反应良好，肿瘤缩小35.5%，在治疗7个月后出现疾病进展，原发肿瘤不仅增大，还出现了肝转移。在评估PDX模型对治疗物的反应中，特唑替尼和特博替尼在治疗前PDX模型中显示出高度的有效性，P gii分别为115.25%和112.31%。然而，耐药PDX模型对这两种药物的敏感性明显降低，PGI分别降至65.32%和50.40%，药物的抑制效果明显下降，产生了耐药性。通过VSS和r Mac分析比较治疗前后的活检标本及PDX模型显示，PDX模型成功保留了原始肿瘤的关键遗传特征，在耐药机制研究中发现患者耐药标本出现新的met。

PG因D一两二八N突变和PC基因D396N突变，但这些改变在PDX模型中未被保留，可能由于建立过程中的克隆选择。最显著的耐药特征是EGFR信号通路的激活，表现为患者样本中EGFR基因显著扩增以及PDX模型中EGFR RNA表达水平的明显上升。RNA进一步揭示多个RTK家族成员表达上调提示旁路信号通路激活可能是关键的耐药机制。研究通过建立PDX模型，成功验证了mett抑制剂的耐药机制，为深入探索克服耐药性的新策略提供了重要的实验依据。一说科技提供从序列比对到变异检测的一站式定制化基因组数据分析服务。C天N通过对开源工具算法的重新实现，在保持结果高度一致性的同时，显著提升了运行效率，分析速度提升数倍，缩短了项目分析周期。能更快更精准的。

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