李斯特菌个体化肿瘤疫苗驱动肿瘤新抗原的免疫治疗原创

肿瘤细胞的非同一突变可诱发抗肿瘤免疫应答，但持续的抗原暴露往往导致T细胞功能耗竭，且单一检查点抑制剂的治疗效果受限。目前，准确预测新抗原的免疫源性仍是该领域面临的主要挑战。为此，研究团队以MC38小鼠肿瘤细胞系接种的6~8周龄雌性C57BL6小鼠为研究对象，建立了一个从新抗原识别到疫苗效果验证的完整研究体系。该系统整合了基因组学分析、实验动物模型构建、免疫学评估及疫苗开发等多个关建环节，可全面评估个性化新抗原疫苗的构建过程和治疗效果。研究团队首先通过全外险子组测序，结合RNA表达分析，从2870个初始非同一突变中筛选出972个表达突变，随后基于MHC结合预测确定了137个潜在新抗原。通过肽免疫和检查点抑制剂两种验证策略，最终。

在37个候选者中确认13个，在105个候选者中确认8个具有免疫源性的新抗原。在一苗构建过程中，特别关注了强免疫源性序列sin file对其他抗原免疫反应的潜在影响。结果表明，在LM20载体中包含sin fico序列并未减弱对其他抗原的T细胞反应，LM20和不含新in非口的LM20均显示出最强的肿瘤控制效果。研究还发现，李斯特菌疫苗具有诱导针对非靶向新抗原反应的固有特性。基于C fco安全性验证，研究团队开发了创新性的李斯特菌载体疫苗含20个验证新抗原的LM20载体展现出显著的治疗效果。超过70%的靶向新抗原成功诱导免疫应答，约30%的小鼠实现完全缓解，同样，LM19构建体也对超过50%的靶向新抗原产生了显著的免疫反应。相比之下，传。

动合成常态SLP疫苗在肿瘤控制方面效果欠佳。在肿瘤微环境调节方面，李斯特菌载体疫苗显著降低了免疫抑制性细胞的比例，具体表现为调节性T细胞的FOXP3表达水平明显下调，同时促进了巨噬细胞从免疫抑制性M2型像促炎症性M1型的极化转化。更为重要的是，该疫苗诱导的免疫记忆具有持久性和有效性，在肿瘤清除后100~200天仍可检测到特异性T细胞，且在肿瘤再次攻击时，这些记忆性T细胞能迅速扩增至原有水平的3倍，有效预防肿瘤复发，展现出良好的临床应用前景。在配对样本数据分析部分，研究团队使用ctn up去除重复读段，用linena对应的进行重新比对，Coca进行碱基质量校正，使用CNKCC进行体细胞变异分析ten CC是CTN开发的体细胞变异检测工具。结合了基于单倍型的变检。

测和机器学习模型，可以准确高效的检测低频变异。CTN提供全面基因组分析解决方案，具备快速、准确和高扩展性等特点，能在各种环境中运行，支持多种测序平台数据，在保证分析质量的同时显著提升处理速度，能够更快、更精确的向研究人员提供变异检测结果。