spaa: 计算生态位宽度

前文FEMS：细菌和微真核生物在西藏盐湖的分布与组装机制 中使用spaa计算生态位宽度。本文介绍一下。这个包2016年被提交到CRAN上。现在被引了13次。 前文： indicspecies:计算物种与样本之间关系的强度与生态位宽度 介绍过通过资源使用情况来计算生态位宽度的方法。 library(spaa) #用于分析物种关联和生态位重叠。 ? spaa #### Niche width and niche overlap data(datasample) #niche.width计算生态位宽度 niche.width(mat, method Schima.superba Rhododendron.ovatum 1 2.003976 1.94466 1.776253 #每两个物种之间生态位的重叠 计算生态位的方法竟然没有写每个方法具体怎么算的。 机智的我发现了函数说明中的Reference写的是张金屯的数量生态学，于是找到书查了一下，果然计算方法都在书里。

MicroNiche: 生态位概念及计算

redirectedFrom=fulltext 之前已经介绍过生态位计算： spaa: 计算生态位宽度 indicspecies:计算物种与样本之间关系的强度与生态位宽度 最近又出了一个R包MicroNiche MicroNiche已经被提交到CRAN，直接下载使用即可~ 本文主要介绍一下生态位的概念和在微生物中使用时的条件。 生态位是一个在生态学中有着悠久历史的基本概念。 随着时间的推移，生态位被正式定义为一个物种与两个(或更多)环境属性之间的关系在多维空间中形成的面积(或体积)。由于生态位在本质上依赖于环境，竞争相同资源的两个物种的生态位不可能在空间上完全重叠。 在微生物学中，术语“生态位”通常用来解释环境属性和物种相互作用如何决定微生物的丰度和/或活性。 如果一个物种平等地利用所有资源，BN为1，该物种被认为是具有广泛的、非歧视性生态位的通才（generalist）。

跟着Nature学习空转细胞生态位分析（一）

2022年8月10号发表在Nature杂志上的一篇文献，标题为《Spatial multi-omic map of human myocardial infarction》，是一篇非常经典的空间转录组的细胞生态位和分子生态位学习的文章 的反卷积结果： 空转： 读取单细胞数据： 使用了我前面刚刚获得的新技能： rm(list=ls()) library(schard) library(Seurat) ## 1.读取单细胞数据 # load h5ad as Seurat file <- "data/All-snRNA-Spatial_multi-omic/179b3914-7e79-49f2-9f4b-31a536757ee5.h5ad" scRNA = schard::h5ad2seurat(file) scRNA # An object of class Seurat # 28975 features across 191795 samples 数据都准备好了就万事具备，下次分享生态位分析结果~ 又是完美的一天~

精进3：找到你的潜在生态位

这种“小环境”有一个专门的名称叫“生态位 找到你的生态位甚至潜在生态位，就是一个非常必要的功课 01 优化专注力 我们为何越来越无法聚焦 更专注的方法 排除无谓的信息干扰和注意转移 你在一件明显重要的事情上还不够专注 建立自己的网状知识系统 根据复杂性科学的理论，人头脑中的知识系统，具有一种“规模效应”，也就是说，网络的规模越大（所含的联结点和联结越多），则继续扩大该网络的边际收益也越大，投入产出比会变得更高 图5- 你会感到按以前的方式来学已经有点吃不饱了，或者好像触到了天花板一样 从横向扩展开去，找寻一些新的知识，这些知识不属于原来的领域，但是可能又有一些关联，你就这样学啊学，不知不觉中，你的知识体系就会从树形结构慢慢地变成网状结构 图5- ，批量化处理，这样总体上做这几件事的效率就都提高了 快速两分 把握行动大方向，知道什么不必做 在我们向别人提建议之前，最好先确认这个建议是否具有可执行性，如果没有可执行性，最好先酝酿酝酿，再说也不迟 生态位法则 而这个局部小环境就是『生态位』 找到属于自己的生态位是“反内卷”的最好策略 在新旧职业更替过程中，一个人能否快速学习掌握新技能，就成了他能否适应新环境的关键 原子化的好处 优化事件实施的流程，以起到提高效率

5行位运算，map靠边站——位操作进阶

，这道题主要想教给大家的就是位运算。这里只介绍某一个题解的实现，其他神犇代码就不一一介绍了。 第一个，异或，指两个数的二进制位相同则为改0（为假），不同则改为1（为真），比如1100^1010=0110，即12^10=6.故一个数异或它本身，肯定各个二进制位都是一样的，结果就都是0了。 还是那样，每个位的运算和其他位是没什么关系的，给出的数列是多少无非决定了这个位会出现多少次1而已。 而1的个数又一定是3k或者3k+1.3k的情况自然都消掉了，3k+1自然到后面会剩出一个1.在理解时关键就是不要把某个数（我称之为行向量）硬生生地不肯拆开，而是以某一位（列向量）的角度去看待。

Golang md5 1632位MD5加密

Golang学习日记 package main import ( "crypto/md5" "encoding/hex" "fmt" ) func main() { //返回一个 32位md5加密后的字符串 h := md5.New() h.Write([]byte("12345678")) fmt.Print(hex.EncodeToString(h.Sum

ISME：近缘海洋细菌季节性生态位分化

探究了高分类水平上生态位的保守性。 6825个ASV中的297个呈现循环的季节性模式，占总相对丰度的一半（47%）。 对某些特定的属，生态位相似性随着16S基因差异增加而降低。 评估了一个属内部ASV时间时间上生态位的相似性，期望回答以下三个问题： 1.多少ASV是季节性的，以及时间上的分布； 2.不同属但紧密相关ASV的生态位的相似度，以及影响他们的环境因子； 3. 使用propr包检验一个给定属内的类群是否共变，从而可以共享时间生态位。不同分类群之间变化的比率Rho（作为生态位相似性的指标）与ASV之间的核苷酸差异进行比较，研究是否存在生态位相关性的趋势。 共发生和协方差指向可能的生态位相似性或互利主义。在分析中以属内变异性为中心，测试了密切相关的分类群之间生态位重叠Rho。 图5 三类物种不同分类水平的峰值归一化统计量(季节性指标)的密度分布

5位大牛们博客

5、J神。Android界之神。我的偶像。看着帅气的博客封面。 http://jakewharton.com/ ?

生成32位MD5加密

/* * 功能：32位MD5算法 用来进行加密 * */ package com.shi.Tools; import java.security.MessageDigest; import ] args) { System.out.println(MD5("施爷")); System.out.println(MD5("abc")); } public final static String MD5(String s){ char hexDigits[]={'0','1','2','3','4','5','6','7','8','9','a','b','c','d','e mdTemp=MessageDigest.getInstance("MD5"); //进行字节加密并行进加密 转化成16位字节码的形式 mdTemp.update(strTemp); mdTemp.digest(); //j=32 int j=md.length; char str[]=new char[j*2]; int k=0; //对字符串进行重新编码成32位的形式

2023年以太坊生态5大预测

如果 Pseudo-Danksharding 的实施在 EigenDA 上取得了成功，它可能会在以太坊级协议变更的漫长过程之前，成为所有建立在以太坊生态系统之上的 Optimistic 和 ZK-Rollups 因此，部署一个完全模块化的区块链基础设施堆栈，包括一个通用的 L2 以及可定制的 L3，将标志着单体应用链生态系统时代的结束，以及去中心化应用开发新时代的开始。 将 EVM 的去中心化和安全性与可扩展的 L3 相结合，使模块化环境远优于单体应用链生态系统。仍然需要解决重要的互操作性问题，特别是对于跨 Rollup 交易。 像 Cosmos 这样的应用链生态系统将在 2023 年继续获得牵引力。然而，随着 L3 最终在 2023 年部署，我们将看到应用链叙事从单体链生态系统转变为模块化生态系统。​

R语言做生态位分化分析（2）找找参考论文

做这个分析用到的R包是 ENMtools，用到的函数是 identity.test() 之前有一篇推文记录的是学习一下背景知识 R语言里做生态位分化分析（1）背景知识查询 找找做这个分析的论文 https

科技生态5.0——5G带来生活和行业生态大变革

从1G时代技术让移动通话成为可能，2G时代数字时代到来，3G时代网络给我们带来了高清图片、视频通话，4G时代促成直播、短视频的兴起，5G时代影响下的社会生态变革是科技生态的4.0变革，这个变革是指数级的变革 随着5G技术的诞生，5G将带来科技升级（配合5G的科技生态升级，如基础、硬件、芯片、通信设备等全面升级）、场景深度融合（人与场景深度融合，线上生活成为主流，体验无感知，吃、穿、住、行、金融服务、交流、娱乐等完全贴近生活方方面面 乔布斯他不仅做出了伟大的产品，还重新定义了移动互联网，同时也促进了生态变革。 5G是一种可以全面赋能生活和工作的底层技术。5G将开启万物互联成为重大创新风口。 5G让世界链接更加紧密，它不仅连接人和人、人和计算机、人和物、机器和物，还要连接各种各样的应用场景，基本实现了生态中的互联，让人与场景深度融合。 未来5G的应用场景是高可靠、低时延应用。 智能制造借力5G技术，让海量机器连接和高可靠、低时延的应用，实现智慧制造。 5G技术对于人类来说，绝不是网速快了那么简单，改变了人类生活和行业生态。

5分钟带你了解位段

有些成员甚至只要3个比特位就够了。如果给一个整形的空间似乎有点多，这时就可以使用位段。 一、什么是位段 位段又称为位域是以位为单位来定义结构体(或联合体)中的成员变量所占的空间。 比如： struct A { int _a : 2; int _b : 5; int _c : 10; int _d : 30; }; A 就是一个位段类型。 问题一： 成员名后边有一个冒号和一个数字代表这个变量所占的二进制位。 比如：_a占2个二进制位，_b占5个比特位。 让我们来看问题二： printf("%d", sizeof(struct A)); 答案：8 //一个例子 struct S { char a:3; char b:4; char c:5; 即位段不能跨字节存储，比如在VC中int是占4个字节，那么最多只能是32位； 3)无名位段不能被访问，但是会占据空间； 4)不能对位段进行取地址操作； 5)若位段占的二进制位数为0，则这个位段必须是无名位段

PrintStream、MD5、16位流介绍

MD5加密： MD5是一种只能加密不能解密的加密算法，这个算法有一个特点：只要是两个文件的字节内容是一致的，加密出来的密匙就是一致的，但是两个文件的字节稍微有一个字节不一样，整个加密出来的密匙就会完全不一样 因为MD5的这种特性，可以用来做秒传和网盘之类的软件，秒传的原理就是判断你所上传的文件内容和服务器里的密匙加密的文件内容是否一致，一致的话就直接不需要上传了，所以就“秒传”了。 需要注意的是：使用MD5算法加密文字内容的时候需要进行嵌套加密，不然是可以被破解的，只有嵌套加密后的文字内容才无法被破解。 16位流介绍： 16位流是基于8位流之上发展出来的，又叫文字操作流，是用来处理文字上的事情的，它也就只能处理文字上的事情。 InputStreamReader 此方法可以使8位流转换成16位输入 OutputStreamWriter 此方法可以使16位流转换成8位流输出

移动端H5坑位指南

query]，笔者曾经发表过《H5与App的通讯方式》讲述URL Scheme的使用。 -- 强制QQ浏览器竖屏 --> <meta name="x<em>5</em>-orientation" content="portrait"> <! -- 强制QQ浏览器全屏 --> <meta name="x<em>5</em>-fullscreen" content="true"> <! -- 开启QQ浏览器应用模式 --> <meta name="x<em>5</em>-page-mode" content="app"> <! solid #f66; width: 200%; height: 200%; content: ""; transform: scale(.5)

CTFweb类型（二十）5位、4位可控字符下的任意命令执行

​​这次我们讲一个5个字符的，这个题目是黑客2017的一道题目。 20-1.png 网上解释得非常多，这边也讲一下代码其实比较简单跟之前的结构类似，传递的字符串小于5位就能够去执行。 最后的话就是通过文件名来构成一个文件0，然后再去sh去执行0的一些内容，但是ls -t,这里有1234567有7位,这个7位的长度已经超过了它给我们5位的限制，所以说要做的其实就是突破。 20-5.png 你会发现，好像并没有去执行我们想要的东西，它执行的其实只是一个ls这个东西。 command not found，然后你可以注意看ls -t它为什么会这样子，它其实中间是没有做分割的，就是ls-t它中间少了个东西，那么我们就往里加个空格，还是说它这个文件名是空格，还要再换行12345刚好5位 那么这个就是它的5位的一个实践，就是说其它的应该还好了，这样子生成一个就是我们这样的话就是用sh a去实现一个去执行这条命令去执行，就是ls -t >0。

VB实现的16位和32位md5加密代码分享

d5加密运算是不可逆的，就是说你不能通过那一串古古怪怪的东西算出它原始的样子。下面是完整的md5代码，不要去理解算法了，用到时拿去直接调用。 F(x, y, z)md5_F = (x And y) Or ((Not x) And z)End Function Private Function md5_G(x, y, z)md5_G = (x , &HF57C0FAFmd5_FF d, a, b, c, x(k + 5), S12, &H4787C62Amd5_FF c, d, a, b, x(k + 6), S13, &HA8304613md5 ), S23, &H265E5A51md5_GG b, c, d, a, x(k + 0), S24, &HE9B6C7AAmd5_GG a, b, c, d, x(k + 5), S21, &HD62F105Dmd5 (c))End IfEnd FunctionSub test()MsgBox MD5("a", 16) '16位加密MsgBox MD5("a", 32) '32位加密End Sub

iOS开发——32位MD5加密

我们在开发一款App过程中，对于发的请求，其中有个“sign”的字段，这个key对应的value是MD5加密的字段，旁边的安卓同事问php后台，说MD5加密是32位的还是16位的，由于以前未曾注意过，所以就搜索了下 看了好多资料，包括维基百科和一些论坛，说MD5其实进过算法产生的是固定的128bit，即128个0和1的二进制位，而在实际应用开发中，通常是以16进制输出的，所以正好就是32位的16进制，说白了也就是32 /** * 32位md5加密算法 * * @param str 传入要加密的字符串 * * @return NSString */ - (NSString *)md5:(NSString 至于人们说的16位MD5加密，其实是这样的：举例如果产生的MD5加密字符串是：01234567abcdefababcdefab76543210，则16位的MD加密字符是abcdefababcdefab， 实际上这个操作已经不是MD5加密算法所包括的，而应当是对MD5加密算法结果的二次处理。其它的64位和大小写什么的，都属于对MD5算法结果的二次处理。

最后一课准备----Xenium生态位与微环境分析

indicspecies:计算物种与样本之间关系的强度与生态位宽度

Studying the statistical relationship between species and groups of sites 评估物种发生/丰度与样本之间关系的强度和统计意义，并能够计算生态位宽度 indicators(X, cluster, group, func="IndVal", max.order=5, max.indicators=NULL, At=0, Bt=0 A B sqrtIV Pancam 0.6923077 0.8 0.7442084 Melcor+Sessp. 0.5714286 0.7 0.6324555 计算生态位宽度 0.0 0.00 sp2B 0.00 0.25 0.50 0.0 0.25 sp3B 1.00 0.00 0.00 0.0 0.00 sp4B 0.65 0.35 0.00 0.0 0.00 sp5B resourceD) B sp1B 0.13225261 sp2B 0.12781527 sp3B 0.00000000 sp4B 0.12034987 sp5B