曾经是个苦哈哈的纯粹科研党,专注于遗传学研究和医学数据分析,四年又三载,积累下一些友好可食用的可爱科研小软件。下面一段时间,嗯,开一个小系列吧,专门放送些好掌握,让工作效率倍增的科研小技能。
内容:
偏向初代目进阶的数据分析,数据库食用,科研写作等,偏遗传学
更新时间:
emmm……一个月一次
适合:
新入遗传分析坑的;想花少点时间出多点数据成果的;好奇心爆棚的
备注:
我只管放送,不管解答问题啊!不明白的请自行google啊!
有需要的话可以推几个以前扒过的公众号
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以下正文
GMDR,嗯,是我接触过的学习投入产出比最高的软件,没有之一!
3分钟学会,30秒跑出IF5高逼格文章的结果配置!要表有表要图有图,这结果,够诚意
相信我,用过一次,只要一次,你会感叹,数据原来可以如此性感!
当然,看懂教程的前提,是需要有一些些遗传学基础,以及一批可以随时拖出来溜的数据。
GMDR,主要用来实现多因子降维的,软件跑出交互组合后,可以用logistic、分层等方法做进一步交互探索。
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GMDR概览
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数据文件准备
markerfile 就是SNP文件
covarfile 协变量文件
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程序运行
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结果解读
一脸懵逼?意犹未尽?复制这个地址到PC,有软件也有教程,有兴趣的去瞅瞅。
http://ibi.zju.edu.cn/bcl/software/gmdr/download.html
祝福投身科研并为此付出和坚持的所有人,你们很伟大。
也抱抱在科研路上迷茫又彷徨的小伙伴们,前路漫漫,记得带伞。
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