我安装完VASP之后对其进行测试，参考的是VASP最简单的安装方法（含全程视频演示） - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)中的VASP测试时，mpirun -np 4 vasp时出现一下问题，百度了也没解决
浏览 8提问于2024-09-28
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我正试图在VirtualBox上的ubuntu19.10中编译vasp 6.2.1。我安装了英特尔openApi (有ifortran编译器)和fftw3。我正在尝试使用ifort编译串行版本。但它给了我一个错误，如下。
if [ ! -d build ] ; then mkdir build ; fi
if [ ! -d build/std ] ; then mkdir build/std ; fi
cp src/makefile src/.objects src/makedeps.awk makefile.include build/std
make -C build/std VE
浏览 46提问于2021-10-24得票数 0
我的项目中有一个名为tmpInfo.txt的作业信息文件。tmpInfo.txt的内容如下： 875675 mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NP /opt/software/vasp/vasp-intel/vasp5.4/vasp5.4.1/vasp_std>o.$PBS_JOBID.out
875676 mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NP /opt/software/vasp/vasp-intel/vasp5.4/vasp5.4.1/vasp_std>o.$PBS_JOBID.out
浏览 46提问于2019-06-06得票数 0
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使用pyiron运行Vasp计算，通过访问ElectronicStructure和Dos对象，我可以轻松地绘制状态的总密度，例如 from pyiron.project import Project
pr = Project('tmp')
pr.remove_jobs(recursive=True)
vasp = pr.create_job(pr.job_type.Vasp, 'vasp')
vasp.structure = pr.create_ase_bulk('Al')
vasp.run()
dos = vasp.get_electron
浏览 15提问于2020-01-14得票数 3
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我想用创建文件的步骤命名我的文件。步长以小数为单位，据我所知，用bash处理小数是很困难的。这是代码：
for i in $(seq 0.05 0.05 0.45)
do
.
.
.
mv POSCAR slipped_112_111_$(( i*2 )).vasp
done
我得到的错误如下：
./slip_loop.sh: line 3: 0.05: syntax error: invalid arithmetic operator (error token is ".05")
预期文件名：
slipped_112_111_0.10.vasp
slipped_112_11
浏览 0提问于2020-05-12得票数 0
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我正在尝试创建一个脚本来创建脚本(并做其他事情)。我的问题是，创建的这些脚本包含环境变量，当实际运行我的脚本时，它们不会出现在脚本中。
#!/bin/bash
for i in {001..116}
do
rm job
cat > job <<!
#PBS -S /bin/bash
#PBS -N $i-Fe63S
#PBS -j oe
#PBS -q default
#PBS -l nodes=1:ppn=24
#PBS -l walltime=48:00:00
#PBS -V
cd $PBS_O_WORKDIR
/opt/openmpi/bin/mpiru
浏览 2提问于2017-08-04得票数 0
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我添加了一个函数getAttendance，只有在单击表行时才应该触发该函数。如果我定义
<tr onclick={this.getAttendance} key={key}>运行良好，但如果我将其更改为将函数调用为<tr onclick={this.getAttendance} key={key}>或<tr onclick={()=>{this.getAttendance}} key={key}>，则会抛出上述错误。
import React, { Component } from 'react';
import &#
浏览 1提问于2019-02-14得票数 0
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无法绘制p4vasp中的带结构。
运行时错误是：
vivek@vivek-Lenovo-Flex-2-14:~/apps$ p4v
(p4v.py:5002): libglade-WARNING **: Could not load support for `gnome': libgnome.so: cannot open shared object file: No such file or directory
(p4v.py:5002): libglade-WARNING **: Could not load support for `gnome': libgnome.
浏览 0提问于2017-07-31得票数 0
4回答
我正在使用一个只能在bash中运行的科学软件(名为vasp)，并使用Python创建一个脚本，该脚本将为我多次运行。当我正常地使用subprocess.check_call调用函数时，它工作得很好，但当我添加'| tee tee_output‘时，它就不工作了。
subprocess.check_call('vasp') #this works
subprocess.check_call('vasp | tee tee_output') #this doesn't
我是python和编程的新手。
浏览 2提问于2012-03-08得票数 4
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#!/bin/bash
totT=0
for a in `seq -w 3.5 0.1 4.5`
do
echo "a= $a"
cat >POSCAR <<!
Al FCC
1.0
$a 0.00 0.00
0.00 $a 0.00
0.00 0.00 $a
4
Direct
0.0 0.0 0.0
0.5 0.0 0.5
0.5 0.5 0.0
0.0 0.5 0.5
!
###I want to write a command to submit vasp.sh to PBS queue within the loop. How can I d
浏览 3提问于2021-03-05得票数 0
我想在Cray XC MPP机器上编译VASP 5 (5.4.1)的最新版本。有人有我可以使用的设置吗？VASP发行版没有为Cray提供示例。
构建系统已经从5.3.5版本改变了。
浏览 6提问于2015-07-16得票数 1
在我的HPC上通过pysqa适配器运行pyiron作业时，我遇到了一些问题。我不小心擦除了包含pyiron、projects和resources文件夹的pyiron主目录。我已经从另一个集群中复制了所有三个。我认为唯一会引起问题的是resources文件夹中的sqlite.db文件。以前，我通过适配器运行交互式VASP作业没有任何问题。我猜在删除事件之后发生了什么。 我使用的pyiron版本是: 0.2.17 下面是一个使用Interactive vasp作业的最小示例，我已经尝试过了： from pyiron import Project
pr = Project('Al-test
浏览 41提问于2020-11-23得票数 1
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因此，我们试图在Ubuntu14.04LTS上编译VASP 5.4.1。下面是这里描述的类似的安装步骤：。但是，当测试vasp可执行文件(vasp_std等)时，程序终止时会出现分段错误--无效内存引用错误。
我们目前拥有的makefile.include是：
# Precompiler options
CPP_OPTIONS= -DMPI -DHOST=\"IFC91_ompi\" -DIFC \
-DCACHE_SIZE=4000 \
-DMPI_BLOCK=8000 -DscaLAPACK -Duse_collective \
浏览 7提问于2016-06-22得票数 0
下面的文件名为ABCD.vasp
# A B C D
1.000000
13.85640621 0.00000000 0.00000000
4.61880236 13.06394496 0.00000000
0.00000000 0.00000000 45.25483322
A B C D
32 32 32 32
Selective dynamics
Direct
0.00000000 0.00000000
浏览 2提问于2020-06-24得票数 1
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我有一个新的和编译版本的VASP，它执行磁力约束的局部时刻方向在飞行，这是我想测试和使用的比铁。
请您提供指南和步骤，以便将此版本的VASP添加到pyiron作为多一个可执行文件？
谢谢你，爱德华多
浏览 3提问于2022-09-05得票数 0
下面的文件名为ABCD.vasp
# A B C D
1.000000
13.85640621 0.00000000 0.00000000
4.61880236 13.06394496 0.00000000
0.00000000 0.00000000 45.25483322
A B C D
32 32 32 32
Selective dynamics
Direct
0.00000000 0.00000000
浏览 4提问于2020-06-24得票数 1
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2回答
我有一个python脚本，它调用一个shell脚本，然后调用一个名为.exe的iv4_console。为了调试目的，我需要打印iv4_console的标准输出。我使用了这个: Python：
import sys
import subprocess
var="rW015005000000"
proc = subprocess.Popen(["c.sh", var], shell=True, stdout=subprocess.PIPE)
output = ''
for line in iter(proc.stdout.readline, &#
浏览 5提问于2017-03-25得票数 0
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我已经编写了一个批处理脚本，用于打开bash终端并执行以下操作：
@echo off
SETLOCAL
set BASHPATH="C:\Program Files (x86)\Git\bin\"
set START_DIR=%CD%
set release=%1
echo Release outside cyg: %release%
set PATH=%BASHPATH%;%PATH%
%BASHPATH%\bash -l -c "echo Release inside cyg: $release \ && echo Directory: $ST
浏览 1提问于2017-03-23得票数 1
如何使用argparse和变量nargs进行条件循环？因此，基本上，它应该运行或不带参数。我正在尝试：
parser = argparse.ArgumentParser(description="output parser")
group = parser.add_mutually_exclusive_group()
group.add_argument("--dos", help="get DOSCAR for plot",
nargs="?", metavar=("int"
浏览 14提问于2016-06-30得票数 4
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服务器是centos系统，公司的网站安装在docker里，目录是映射的，ssl证书申请下来了，但是不会安装，有人能给菜鸟科普一下吗？
浏览 818提问于2019-10-25
7回答
在配置文件中拆分文本
、、、、
我试图编写一个配置文件的简单解析器，例如，可能有一个名为INCAR的文件。
NSW = 1000
POTIM = 1
TEBEG = 300
如果我想提取POTIM的值，我可以采用awk在空白之间提取文本，并使用以下脚本：
#!/bin/bash
vaspT ()
{
if [ -f INCAR ]; then
local potim=$(grep POTIM INCAR | awk '{print $3}');
else
local potim=1;
fi;
echo "# Time st
浏览 20提问于2022-03-26得票数 2
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我需要在Cray XC MPP机器上编译VASP 5.3.5。系统提供Gnu、Intel和Cray编译环境。还可以选择用于BLAS、LAPACK、ScaLAPCK的英特尔MKL或克雷LibSci。
哪一个是最好的编译器，最好的数值库和Makefile选项？
浏览 21提问于2015-06-25得票数 0
1回答
后端springboot前端vue开发的网页，利用websocket实现操作数据库前端网页实时刷新的功能
我在本地调试了，测试了几个浏览器都可以正常接收消息
1.jpg
部署到服务器上以后再测试，火狐浏览器可以正常接收，在谷歌内核的浏览器，edge，微信网页这些连接成功就马上断开，报错误码1006，原因是空，后台没有断开的日志输出
2.jpg
3.jpg
小白一个调了几天试了很多也没有找到具体原因，有没有遇见过的类似情况的大佬(°ー°〃)
浏览 339提问于2022-05-12
1回答
我有这样的文件：
ls CONFIG2
DOS DOSCAR KPOINTS PCDAT WAVECAR submit_vasp_beskow.sh
CHG EIGENVAL OSZICAR POSCAR XDATCAR vasprun.xml
CHGCAR IBZKPT OUT POTCAR error_file.e
CONTCAR INCAR OUTCAR PROCAR output_file.o
ls CONFIG2/DOS/
CHG EIGENVAL OSZICAR P
浏览 0提问于2019-03-26得票数 0
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2回答
我想在目录中搜索一个名为file.txt的文件，并将这些文件中的整行替换为字符串aprun，替换为另一行vasprun = "mpirun -np 64 vasp"如何使用awk、sed或任何其他bash实用程序来完成此操作？
浏览 2提问于2016-05-22得票数 1
请问腾讯云2017年12月23日16:00之后是否有出现故障呢？我们的合作伙伴说因为云的故障导致我们合作的功能受到影响。
浏览 480提问于2017-12-24
标题：年底大酬宾-腾讯云
地址：https://cloud.tencent.com/act/bargin
浏览器信息
Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; WOW64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/43.0.2357.130 Safari/537.36
浏览 339提问于2017-12-09
1回答
在本地测试是可以正常的，但是放到服务器上面测试会报错。返回的签名是Http开头的，但是服务器要求是https，这个怎么解决呢？
浏览 601提问于2018-09-07
安装后 完全没生效呀 重启服务器也没报错 不知道什么原因
[图片]
我把 SSlcertificateKetFile 不 填写 或者填错 回报empty 所以这文件应该解析了 http 域名可以打开 https 域名找不到 是证书的错误 还是哪里的
浏览 1159提问于2017-12-14
我在 window 云助手 系统里 用 助手 创建了 ftp账号 在服务器里可以用filezilla 可以登入 '在外网就不行 怎么回事
浏览 237提问于2016-05-25
1回答
idcardCompareImage = CommonFileUtils.getFileContent("D:\\doc\\images\\lyj.jpg") 返回回来的idcardCompareImage 是乱码
浏览 315提问于2017-12-21
当向上或向下滑动左侧或右侧的图片时，图片会按照滑动方向滑动固定像素，如果点击该图片，该图片会直接动画滑动到最中间位置，且如图片列表全部滑动完，且图片效果为循环滑动，图片列表全部滑完时，最后一个图片会变成第一张图片，在不依赖插件下完成，求大神指路，
现在我的思路是每向上滑动或者向下滑动时，向该方向transistion，中间是一个标志位，但这里有一个拐弯的地方，不能重复的移动，该怎么解决这个拐弯的问题
浏览 1023提问于2017-11-27
2回答
下面是VASP的代码框架。我的工作是在一个新的平台上移植它。当我使用那个平台的编译器时，我得到了错误。如果我注释掉了use m，并且我还得到了“，它必须有一个指定的显式接口。”，我只想做一个最小的修改，以避免在程序的其他部分产生错误。
module m
interface
subroutine a
end subroutine
end interface
interface
subroutine b
end subroutine
end interface
end module
subroutine a
use m
call b
end subroutine
浏览 6提问于2015-01-28得票数 1
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请描述您的问题
标题：应用场景 - 互动直播 - 产品文档 - 帮助与文档 - 腾讯云
地址：https://cloud.tencent.com/document/product/268/3160
浏览 117提问于2018-01-23
域名已经接入腾讯云，一级域名依旧无法访问，但是二级域名可以，怎么解决？（服务器配置没问题）
原来域名是阿里购买的，后来在腾讯云这边购买了服务，又给介入到腾讯云了，目前在阿里解析到腾讯云服务器，可是只有二级的才能访问，一级的还是不行。
目前确定的是，已经接入成功，目前是完全腾讯云备案成功，备案成功差不多10天了，如果配置也早已经完成。目前不知道怎么破，求高手指点。
浏览 998提问于2018-10-26
1回答
提示：ERROR: certificate common name ‘www.qqweiye.com’ doesn't match requested host name ‘127.0.0.1’.
To connect to 127.0.0.1 insecurely, use `--no-check-certificate'.
问题是我有证书呀
浏览 328提问于2018-01-19
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