今天我们介绍另一个交互式web工具—TIMER，能够全面、灵活地分析TIICs并可视化。 背景介绍 同一类型肿瘤的不同患者的免疫浸润具有异质性，可能影响临床结果。...为方便研究肿瘤免疫和基因组数据，TIMER应用反褶积方法从基因表达谱中推断TIICs的丰度，重新分析了TCGA的32个癌症类型的10897个样本的基因表达数据，估计6个TIIC亚群(B细胞、CD4+T细胞...Figure 1：TIMER模块概述。...TIMER2.0要求用户指定基因的“深度缺失”或“高扩增”改变状态，以与“二倍体/正常”状态进行比较。看下边两个热图表和小提琴图，不同sCNA状态下的免疫浸润分布有很大差别。...TIMER三大功能模块的直观输入和输出，对多癌型中特定基因和免疫细胞互作分析进行简化，更便于应用，为肿瘤免疫研究提供了一个全面的分析网络工具，你get了吗？
Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要性； cBio-portal数据库做基因组学的分析（机制一）； STRING互作和GO/KEGG分析探讨可能的信号通路（机制二）； TISIDB/TIMER...分析肿瘤免疫特征（机制三）。...我们介绍过，TIMER和TISIDB数据库都是做肿瘤免疫浸润分析的神器，但是数据库之间的组合是非常有讲究的。那么，怎样用好肿瘤免疫数据库呢？这篇文章以前分享过，值得重新学习。影响因子4分+。 ?...作者把肿瘤免疫分析的两个数据库——TIMER和TISIDB结合使用，阐释AQP9差异表达与肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）的相关性。肿瘤的免疫微环境是研究热点，也与文章的脉络和主题相承，值得学习和借鉴！
分析肿瘤免疫特征（机制三）。...TIMER (Tumor Immune Estimation Resource)数据库也是用高通量测序(RNA-Seq表达谱)数据分析肿瘤组织中免疫细胞的浸润情况，主要提供B cells, CD4+ T...网址：https://cistrome.shinyapps.io/timer/。 TIMER网站分7个模块，其中前6个模块是对TCGA数据库的分析展示，第7个模块是对免疫细胞浸润比例进行评估。 ?...比较起来，其实TIMER比TISIDB更简单，因为TISIDB的数据需要判断后选择可用的数据。在进行肿瘤免疫浸润分析时，最好能多角度分析。...分析肿瘤免疫特征（机制三）。
TIMER是一款肿瘤浸润免疫细胞组分分析软件，输入肿瘤样本的基因表达谱数据，预测每个肿瘤样本中浸润的免疫细胞组成，支持以下6种免疫细胞的分析 B cell CD8+ T cell CD4+ T cell...，所有的结果整理成了一个综合性的网站，网址如下 https://cistrome.shinyapps.io/timer/ 对应的文章链接如下 http://cancerres.aacrjournals.org...SCNA 探究肿瘤免疫细胞浸润与体细胞拷贝数的相关性，通过该基因的拷贝数情况将样本分为四类，比较四类样本间浸润的免疫细胞分布情况，结果示意如下 ? 5....Estimation 上传自己的基因表达谱数据，利用TIMER算法预测样本中免疫细胞的组分，示意如下 ? 上传的表达谱文件内容如下 ? 软件的输出结果示意如下 ?...TIMER不仅仅可以预测肿瘤样本的免疫细胞浸润情况，还可以TCGA不同肿瘤中免疫细胞浸润与基因表达，体细胞突变/拷贝数变异等的关联，功能强大，其分析的思路也值得借鉴。
Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要性； cBio-portal数据库做基因组学的分析（机制一）； STRING互作和GO/KEGG分析探讨可能的信号通路（机制二）； TISIDB/TIMER...分析肿瘤免疫特征（机制三）。...从侧面反映，肿瘤的免疫浸润分析，仍然是热点，还有发表论文的机会和潜力。 ? 题目一如既往的包括预后价值和免疫浸润表型；肿瘤类型是乳腺癌，女性第一大癌。...从表达差异、到生存分析，再到相关性分析，最后是免疫浸润分析。思路和逻辑明确。 ? 首先是用oncomine+TIMER双确认形式阐释表达差异。...最后，作者用TIMER数据库探索乳腺癌（包括亚型）中，JAK1表达与肿瘤中免疫细胞浸润情况的相关性。这是TIMER数据库免疫浸润分析的显著特征，前面已经多次分享，值得借鉴和学习。
Butterfly主题v3.4.0及其以后版本基本已经实现完全去jquery化，而本帖有使用到jquery，不想再次引入js的可以考虑使用站内的原生JS计时器。
timer-util是一个极其简单的定时器辅助工具，专门用于生成定时所需的秒数。...采用enum来规避数值的校验（如秒不应大于60等），减少返回Result crate，一个简单的案例： use log::LevelFilter;use std::time::Duration;use timer_util... { custom_utils::logger::logger_default("timers", LevelFilter::Trace).unwrap(); // 定时器配置（timer
第一步、创建一个Windows窗体， 第二步、创建样式，在工具箱中找到TextBox和Labell、Button、timer。...按钮的代码 private void btnGet_Click(object sender, EventArgs e) { GetTime(); this.timer1....Start(); } 写完这些代码我们获取到不会动的时间，如果我们要获取会动的时间就用给它的样式添加上Timer控件。...private void timer1_Tick(object sender, EventArgs e) { GetTime(); } 我们就调用...，那么我们就要用 Button控件来写一个停下来的代码 private void btnStop_Click(object sender, EventArgs e) { this.timer1
文章目录 一、Timer 定时器基本使用 二、Timer 定时器常用用法 三、Timer 源码分析 四、Timer 部分源码注释 五、源码及资源下载 参考文档 : Timer 定时器 API 文档 TimerTask...定时器任务 API 文档 一、Timer 定时器基本使用 ---- Timer 可用于执行延迟任务或循环任务 ; 下面是定时器最基本用法 ; 1 ....Timer 定时器基本使用 : 创建 Timer 定时器 : 调用构造函数创建定时器 Timer timer = new Timer() ; 分配 TimerTask 定时器任务 : 调用定时器的 schedule...代码示例 : private void timer(){ // Timer 可用于执行延迟任务或循环任务 Timer timer = new Timer();...Timer 定时器构造函数 : ① 创建默认定时器 : 默认以 “Timer-序列号” 作为定时器线程名称 ; public Timer() { this("Timer-" + serialNumber
魔改步骤 新建 [Blogroot]\themes\butterfly\source\js\runtime.js, 此处用到了 shield.io 生成徽标，更...
"generic code timer tool" def test(reps, func, args): # or best of N?
大家好，又见面了，我是全栈君 1. timer类实现 #pragma once #include #include class timer { public:...timer(){ _start_time = clock(); } void restart(){ _start_time = clock(); } double elapsed...，它的精度依赖操作系统或编译器，难以做到跨平台，timer也不适合大跨度时间段的测量，可提供的最大时间跨度只有几百个小时，如果需要以天、月甚至年作为时间的单位则不能使用timer,应使用date_time...扩展new_progress_timer 3.1 代码实现 template class new_progress_timer : public timer { public:...new_progress_timer(ostream &os = cout) :m_os(os) { } ~new_progress_timer()
其实就Timer来讲就是一个调度器,而TimerTask呢只是一个实现了run方法的一个类,而具体的TimerTask需要由你自己来实现,例如这样: Timer timer = new Timer();...1000); 这里直接实现一个TimerTask(当然，你可以实现多个TimerTask，多个TimerTask可以被一个Timer会被分配到多个Timer中被调度，后面会说到Timer的实现机制就是说内部的调度机制...接下来看源码 首先看Timer的构造方法有几种： 构造方法1：无参构造方法，简单通过Tiemer为前缀构造一个线程名称： public Timer() { this("Timer-" + serialNumber...public Timer(boolean isDaemon) { this("Timer-" + serialNumber(), isDaemon); } 另外两个构造方法负责传入名称和将timer...可以，任何东西是否是多线程完全看个人意愿，多个Timer自然就是多线程的，每个Timer都有自己的线程处理逻辑，当然Timer从这里来看并不是很适合很多任务在短时间内的快速调度，至少不是很适合同一个timer
lapic timer是per cpu，软件timer靠硬件驱动，感觉per cpu的好。...kvm timer host有自己的lapic timer，硬件实现，guest也有自己的lapic timer，kvm模拟。...start_hv_timer(apic)) start_sw_timer(apic); } 这儿hv_timer就是preemption timer，sw_timer是软件hrtimer...，有preemption timer就用hv_timer，没有就用sw_timer。...，但如果设置了hrtimer，hrtimer的超时函数apic_timer_fn也调用apic_timer_expired，参数from_timer_fn表示是否来自超时函数，超时函数在另一个cpu执行
// 自动执行的Timer // 参数一：时间间隔，参数二：是否重复执行 Timer.scheduledTimer(withTimeInterval: 1.0, repeats: true) { (timer...) in // 定期执行的代码 print("Hello World") } // 需要手动开启的Timer let timer = Timer(timeInterval: 2.0...将 Timer 添加到 RunLoop 后会自动开始工作。...// 界面发生拖拽就会停止执行 RunLoop.current.add(timer, forMode: .default) // 界面拖拽才会执行 RunLoop.current.add(timer,...var count = 5 // 定时器 var timer: Timer!
Timer control #define rTCNTB0 (*(volatile unsigned *)0x5100000c) //Timer count buffer 0 #define rTCMPB0...) //Timer count observation 0 #define rTCNTB1 (*(volatile unsigned *)0x51000018) //Timer count buffer...) //Timer count buffer 2 #define rTCMPB2 (*(volatile unsigned *)0x51000028) //Timer compare buffer 2...unsigned *)0x51000030) //Timer count buffer 3 #define rTCMPB3 (*(volatile unsigned *)0x51000034) //Timer...(0x1<<10) #define BIT_TIMER1 (0x1<<11) #define BIT_TIMER2 (0x1<<12) #define BIT_TIMER3 (0x1<<13) #define
先来个传统的Timer的例子： package com.jerry.concurrency; import java.text.ParseException; import java.text.SimpleDateFormat... { public static void main(String[] args) throws ParseException { Timer myTimer = new... Timer(); myTimer.schedule(new Worker(), 1000);//1秒后执行 // 2012-02-28 09:58:00执行 ...+"时间是："+new SimpleDateFormat("yyyy-MM-dd HH:mm:ss").format(new Date())); } } 传统的timer的缺点...：Timer对任务的调度是基于绝对时间的；所有的TimerTask只有一个线程TimerThread来执行，因此同一时刻只有一个TimerTask在执行；任何一个TimerTask的执行异常都会导致Timer
2、创建一个Timer实例，通过Timer提供的schedule()方法，将 TimerTask加入到定时器Timer中，同时设置执行的规则即可。...当程序执行了Timer初始化代码后，Timer定时任务就会按照设置去执行。 Timer中的schedule()方法是有多种重载格式的，以适应不同的情况。...Reminder { Timer timer; public Reminder(int seconds) { timer = new Timer();...= new Timer(); timer.schedule(new RemindTask(), time); 2.终止Timer线程 默认情况下，只要一个程序的timer线程在运行，那么这个程序就会保持运行...5.一些注意的问题 每一个Timer仅对应唯一一个线程。 Timer不保证任务执行的十分精确。 Timer类的线程安全的。
Timer control #define rTCNTB0 (*(volatile unsigned *)0x5100000c) //Timer count buffer 0 #define rTCMPB0...) //Timer count observation 0 #define rTCNTB1 (*(volatile unsigned *)0x51000018) //Timer count buffer...) //Timer count buffer 2 #define rTCMPB2 (*(volatile unsigned *)0x51000028) //Timer compare buffer 2...(0x1<<10) #define BIT_TIMER1 (0x1<<11) #define BIT_TIMER2 (0x1<<12) #define BIT_TIMER3 (0x1<<13) #define...#ifdef __cplusplus } #endif #endif //__2440ADDR_H__ timer timer_overview.png
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