我计划使用TCGAbiolinks来准备表达式matrix.And在我下载了基因表达式量化数据之后，我正尝试运行PAADRnaseqSE <- GDCprepare(query_RNA_Seq)函数，但每次运行该函数时
浏览 2提问于2017-06-04得票数 1
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无法调整TCGAbiolinks
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我已经使用anaconda安装了TCGAbiolinks。当我尝试通过library(TCGAbiolinks)从Rstudio启动它时，弹出以下错误： Error: package or namespace load failed for ‘TCGAbiolinkspackage ‘blob=1.2.0’ is not available (for R version 3.6.1) (我还尝试将R降级到较旧的版本(3.6.0)，但问题仍然存在，并出现了额外的警告，即TCGAbiolinks
浏览 287提问于2019-10-12得票数 1
关于为什么在TCGABiolinks中运行规范化步骤时会出现错误，有什么建议吗？
浏览 5提问于2017-08-12得票数 0
我使用TCGAbiolinks包下载大型强子对撞机数据。这是我的密码：library(TCGAbiolinks)我希望能提供任何帮助，使之适合使用maftools和TCGAbiolinks</em
浏览 3提问于2020-02-28得票数 1
我最近开始使用TCGAbiolinks来处理TCGA数据库中的一些基因表达。我所需要做的就是把数据下载到一个R文件中，网上有很多例子。下面是我使用的代码：
queryLUAD <- GDCquery(project = "TCGA-LUAD",为了解决这个问题，我尝试重新安装TCGAbiolinks，将R更新到最新版本，甚至在一台完全不同的机器上运行它(用的是Mac而不是Windows)。
浏览 35提问于2021-08-03得票数 0
TCGAbiolinks::GDCprepare(query = queryDownSd, save = FALSE) 12. tibble:::`[.tbl_df`(y, , 2:4) 2. | \-
浏览 501提问于2022-04-28
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用跟踪编辑R中的函数？
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我注意到一个函数中有一个bug来自我想要使用的包。已经在GitHub上出现了一个问题，但是创建者还没有解决这个问题，我需要尽快完成这个功能。我已经发现我能做到我要编辑的行位于函数的第二个步骤中。functionx
浏览 2提问于2018-03-29得票数 4
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我想要集成两个GSE文件(geo表达式数据集)。我正在使用MetaIntegrator包..。此软件包的版本可在其他地方获得，请参阅 2: In install.packages(updateinstlib == l，" package "，l，repos = repos，：utf8‘utf8’的安装有非零退出状态3: In install.pack
浏览 3提问于2021-03-19得票数 0
我正在尝试从tidyverse包中使用R中的read_csv，但我总是收到这样的消息：Error in date_names_lang(date_names) : 文件和目录确实存在：[1
浏览 15提问于2017-06-15得票数 2
Error in crul::curl_fetch_memory(url, handle=handle):应该怎么处理，请教大神?
浏览 1087提问于2020-03-15
Error in crul::crul_fetch_memory(url, handle=handle): 请教大神，应该怎么处理?
浏览 608提问于2020-03-15
1回答
我有一个来自TCGAbiolinks的数据框架，需要将其缩小到只是非规范化的数据。我尝试编写某种for循环，它将返回subset.gbmexp中的标记变量包含“未规范化”的行，但似乎无法正确处理代码。
浏览 0提问于2020-07-30得票数 0
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