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我需要在Python中实现一个项目，通过FFT，交叉相关，3D谐波和SVM (机器学习)工具在Cryo EM电子密度扫描(MAP格式)中处理氨基酸检测。有几十个可用的Python包，但我没有找到足够全面的对照表。为了避免尝试现有的每个函数，请告诉我是谁应用过这些函数，让我使用最佳拟合软件包来专注于算法问题，而不是重新发明经典函数的轮子。
浏览 1提问于2016-04-28得票数 0
目前，我正在用MATLAB绘制一个生物图，然后从该生物图中提取坐标信息，然后再与gplot一起使用，但是它的绘图功能要比neato运行得慢得多，图形布局的质量也要好得多。
有人有什么有用的想法吗？
浏览 5提问于2015-09-24得票数 0
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这是因为它们在百分比上有很大差距(对于生物测定中的单模双模)。我想知道GAR和FAR是如何计算的？它是如何绘制在ROC曲线上的呢？
作为参考，我附上了一张图。
浏览 1提问于2012-06-25得票数 0
我希望在PDB文件中分离属于特定生物程序集的链I。作为一个例子，PDB ID 1 1BRS有3个生物组装:生物组装1：-链A和D生物组装2：-链B和E生物组装3：-链C和F
是否有一种方法(python脚本)可以将属于每个生物程序集的链ID分离，如1BRS_A
浏览 7提问于2019-11-11得票数 0
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Matlab是生物医学工程师所必需的。但这不是免费的。有没有像Matlab这样擅长信号和图像处理、数值和统计方法、优化、生物学建模(3D)的自由软件。有人能推荐最好的免费软件吗？
浏览 0提问于2015-12-25得票数 2
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这给了我一个包含63个观察值(样本点)和56个变量(1个样本ID，50个植被指数，4个生物量和1个LAI)的表格。表的最后5列是生物量和LAI，第一列是样本ID。我想生成一个曲线图，显示单个植被指数与其中一个生物量参数之间的关系。我可以使用plot函数来做到这一点，一次只有一个观察值和变量。plot(data$Dry10, data$X8047EVImea)有没有办法循环或嵌套循环这个绘图函数，这样我就可以一次生成200张图？此外，我将在每个地块
浏览 2提问于2015-09-02得票数 0
我目前正在努力能够在python脚本中导入Bio模块，该脚本位于不同的目录中。我根据pypi.python.org站点的说明构建了Biopython：python setup.py test对于Python和BioPython的工作原理，我仍然是个新手。
浏览 2提问于2016-06-14得票数 0
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到目前为止，我找到的绘制价格数据图表的唯一方法是在Python中(而且根本不容易实时更新)。有谁知道一个好的C++/Qt图表库，我可以在这里使用？
浏览 1提问于2014-01-20得票数 2
在Ubuntu 18.04上，使用Python 3.9 venv：UnsatisfiedError我在Windows和Linux上用不同版本的Anaconda和Python进行了尝试，但没有成功。Windows 10：
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for
浏览 0提问于2021-04-03得票数 0
我有一个界面(GUI)，包含一个按钮(绘图)和一个轴。我有生物图的对象：bg = biograph(gr);view(bg)
它打开新表单以显示图形，我尝试使用以下方法将其显示在轴上
浏览 2提问于2013-09-11得票数 2
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我正在尝试将生物数据集从R中的海量包加载到python中。但我的代码是让我http 404没有找到错误，在现实中有一个生物数据集在R下的批量包。有人知道怎么熬过去吗？HTTPError: HTTP错误404:未找到ValueError回溯(最近一次调用)在1->2 biospy=sm.datasets.get_rdataset(“生物”，“质量”) ValueError:数据集生物in没有发现。
浏览 0提问于2019-02-14得票数 0
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因此，在使用pip3安装了一些东西之后，我得到了以下错误：You should consider upgrading via the 'pip install --upgrade pip' command.pip3 install --upgrade pip现在，当我运行pip或pip3时，我会得到以下错误：
Traceback (most recent cal
浏览 0提问于2019-04-08得票数 1
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我需要将地上和地下的生物量与3个因素进行对比。对于每个生物量，我可以使用网格中的条形图来绘制它，但是，我不知道如何绘制其中的两个，即地上生物量在Y轴的正方向上，而地下在Y轴的负向部分。我对网格绘图系统是个新手，所以，任何想法都非常受欢迎。马可
浏览 3提问于2011-04-15得票数 3
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以下python代码：import bioformats给出此错误javabridge.start_vm(class_path=bioformats.JARS) AttributeError中的文件"C:\Users\Joshua\Documents\test.py"，第3行:模块‘生物格式我相信我安装的生物格式是正确的。
浏览 0提问于2019-07-08得票数 2
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我有一堆生物样本的图片。每个生物样本都保存在自己的目录中: Sample_1，Sample_2.Z-堆栈的每个图像单独保存:样本_1/位置_1，样本_1/位置_2，样本_1/位置_3。如何用opencv (或任何其他python库)绘制每个生物样本的最大强度投影？
我在这里()找到了一个接近的答案，但我的原始图像不是堆栈，而是分开的图像。
浏览 2提问于2021-06-29得票数 0
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