利用sklearn库的PCA函数对数据集做PCA，进行PCA之前，对数据集做scale处理。
"MLK，即Machine Learning Knowledge，本专栏在于对机器学习的重点知识做一次梳理，便于日后温习，内容主要来自于《百面机器学习》一书，结合自己的经验与思考做的一些总结与归纳，本
数据降维可以降低模型的计算量并减少模型运行时间、降低噪音变量信息对于模型结果的影响、便于通过可视化方式展示归约后的维度信息并减少数据存储空间。因此，大多数情况下，当我们面临高维数据时，都需要对数据做降维处理。
主成分分析（Principal Component Analysis，PCA）是最常用的一种降维方法，通常用于高维数据集的探索与可视化，还可以用作数据压缩和预处理等。矩阵的主成分就是其协方差矩阵对应的特征向量，按照对应的特征值大小进行排序，最大的特征值就是第一主成分，其次是第二主成分，以此类推。
【导读】专知成员Hui上一次为大家介绍讲解图像的缩放、图像均匀操作和直方图均衡化，这一次为大家详细讲解主成分分析（PCA）、以及其在图像上的应用。 【干货】计算机视觉实战系列01——用Python做图像处理（基本的图像操作和处理） 【干货】计算机视觉实战系列02——用Python做图像处理（Matplotlib基本的图像操作和处理） 【干货】计算机视觉实战系列03——用Python做图像处理（Numpy基本操作和图像灰度变换） 【干货】计算机视觉实战系列04——用Python做图像处理（图像的缩放、均匀操作
公众号后台有读者留言问这个图的实现办法，这个图相比于普通的PCA散点图是多了一个垂直和水平的误差线，这个如何实现之前还没有尝试过，所以查了查资料，找到了一个参考链接
这个图来自链接 http://www.sthda.com/english/articles/31-principal-component-methods-in-r-practical-guide/112-pca-principal-component-analysis-essentials/
大样本的数据集固然提供了丰富的信息，但也在一定程度上增加了问题的复杂性。如果我们分别对每个指标进行分析，往往得到的结论是孤立的，并不能完全利用数据蕴含的信息。但是盲目的去减少我们分析的指标，又会损失很多有用的信息。所以我们需要找到一种合适的方法，一方面可以减少分析指标，另一方面尽量减少原指标信息的损失。
好久不见，我们的直播又开始啦！今天，我们主要讲的是人群分布，先用简单的PCA来分析一下千人基因组的人群分布吧！ PCA分析，就是主成分分析，我博客有讲过(点击最底部的阅读原文或复制链接http://www.bio-info-trainee.com/1232.html进行查看)。 PCA的原本目的是因为变量太多，想把它们合并成两三个变量，从而简化分析步骤。变量的多少代表维度的多少，一千维的数据已经无法想象了，但是二维和三维还是比较符合认知的。假设用PCA给千人基因组所有个体一个二维坐标，画在图上，就可以清清楚
在前面一篇分享(脑电分析系列[MNE-Python-10]| 信号空间投影SSP数学原理)中提到，投影矩阵将根据您试图投射出的噪声种类而变化。信号空间投影（SSP）是一种通过比较有无感兴趣信号的测量值来估算投影矩阵应该是什么的方法。例如，您可以进行其他“空房间”测量，以记录没有对象存在时传感器上的活动。通过查看空房间测量中各MEG传感器的活动空间模式，可以创建一个或多个N维向量，以给出传感器空间中环境噪声的“方向”（类似于上面示例中“触发器的影响”的向量）。SSP通常也用于消除心跳和眼睛运动伪影，在用于消除心跳和眼睛运动伪影的案例中，就不是通过空房间录制，而是通过检测伪影，提取伪影周围的时间段(epochs)并求平均值来估计噪声的方向。有关示例，请参见使用SSP修复工件。
关键字全网搜索最新排名 【机器学习算法】：排名第一 【机器学习】：排名第二 【Python】：排名第三 【算法】：排名第四 我们会再接再厉 成为全网优质的技术类公众号 数据准备 2.1.1 停用词 具体请看Python做文本挖掘的情感极性分析（基于情感词典的方法）（同1.1.4） 2.1.2 正负向语料库 来源于有关中文情感挖掘的酒店评论语料， http://www.datatang.com/data/11936 其中正向7000条，负向3000条，当然也可以参考情感分析资源使用其他语料作为训练集。 2.1
在这篇文章中，我要谈的东西是相对简单，但却是对任何业务都很重要的：客户细分。客户细分的核心是能够识别不同类型的客户，然后知道如何找到更多这样的人，这样你就可以…你猜对了，获得更多的客户！在这篇文章中，我将详细介绍您如何可以使用K-均值聚类来完成一些客户细分方面的探索。
为什么要进行数据降维？直观地好处是维度降低了，便于计算和可视化，其深层次的意义在于有效信息的提取综合及无用信息的摈弃，并且数据降维保留了原始数据的信息，我们就可以用降维的数据进行机器学习模型的训练和预测，但将有效提高训练和预测的时间与效率。
本篇文章主要记录对之前用神经网络做文本识别的初步优化，进一步将准确率由原来的65%提高到80%，这里优化的几个方面包括： ● 随机打乱训练数据 ● 增加隐层，和验证集 ● 正则化 ● 对原数据进行PCA预处理 ● 调节训练参数（迭代次数，batch大小等） 随机化训练数据 观察训练数据集，发现训练集是按类别存储，读进内存后在仍然是按类别顺序存放。这样顺序取一部分作为验证集，很大程度上会减少一个类别的训练样本数，对该类别的预测准确率会有所下降。所以首先考虑打乱训练数据。 在已经向量化的训练数据的基础上打乱
人工智能研究的负责人Yan Lecun说，非监督式的学习——教机器自己学习，而不用被明确告知他们做的每一件事是对还是错——是实现“真”AI的关键。
Author: shizhixin Blog: http://blog.csdn.net/shizhixin Weibo：http://weibo.com/zhixinshi Email: zstarstone@163.com Date: 2016-04-19 Note: 本笔记是机器学习算法笔记系列之深入理解主成分分析PCA的实现篇，有自己写的Python实现版本的PCA，同时有调用scikit-learn接口进行实现PCA。
PPT 和 R语言实战参考书 的pdf版本以及 示例代码 可以在公众号后台回复 20210609获得
PCA 算法也叫主成分分析（principal components analysis），主要是用于数据降维的。 为什么要进行数据降维？因为实际情况中我们的训练数据会存在特征过多或者是特征累赘的问题，比如： 一个关于汽车的样本数据，一个特征是”km/h的最大速度特征“，另一个是”英里每小时“的最大速度特征，很显然这两个特征具有很强的相关性 拿到一个样本，特征非常多，样本缺很少，这样的数据用回归去你和将非常困难，很容易导致过度拟合 PCA算法就是用来解决这种问题的，其核心思想就是将 n 维特征映射到 k 维上
https://github.com/Tom-Jenkins/utility_scripts
Now that we've used Pipelines and data transformation techniques, we'll walk through a more complicated example that combines several of the previous recipes into a pipeline.
首先给大家介绍一下主成分分析（PCA）的定义，PCA是一种通过正交变换将一组可能存在相关性的变量转换为不相关的变量的统计方法，这些转换后的变量就被称为主成分（来自维基百科）。而PCA的主要作用包括但不限于：方便数据可视化、数据降维等等。
特征选择与降维技术是机器学习和数据分析中常用的方法，它可以帮助我们减少数据集的维度并提取最相关的特征，从而提高模型的性能和效率。在本文中，我们将使用Python来实现一些常见的特征选择与降维技术，并介绍其原理和实现过程。
关键字全网搜索最新排名 【机器学习算法】：排名第一 【机器学习】：排名第一 【Python】：排名第三 【算法】：排名第四 前言 主成分分析（Principal components analysis，以下简称PCA）是最重要的降维方法之一。在数据压缩消除冗余和数据噪音消除等领域都有广泛的应用。一般我们提到降维最容易想到的算法就是PCA，下面我们就对PCA的原理做一个总结。 PCA基本思想 PCA顾名思义，就是找出数据里最主要的方面，用数据里最主要的方面来代替原始数据。具体的，假如我们的数据集是n维的，共有
教程地址：http://www.showmeai.tech/tutorials/34
我个人的理解：PCA本质上就是寻找数据的主成分。我们可以简单的打个比方，假设有一组高维数据。他的主成分方向就是用一个线性回归拟合这些高维数据的方向。用最小二乘的逻辑拟合的。其他的主成分都是与最大主成分正交的。
如果想从事数据挖掘或者机器学习的工作，掌握常用的机器学习算法是非常有必要的，在这简单的先捋一捋， 常见的机器学习算法：
数据归约是在保证数据信息量的基础上，尽可能精简数据量。筛选和降维是数据归约的重要手段，尤其在数据量大且维度高的情况下，可以有效地节约存储空间和计算时间。反之，当数据量不多，或者现有存储和计算资源能满足分析和预测时不一定需要降维，因为任何的归约都会造成数据损失。
大数据文摘出品 编译：汪小七、张馨月、云舟 主成分分析（PCA：Principal Component Analysis）非常有助于我们理解高维数据，我利用Stack Overflow的每日访问数据对主成分分析进行了实践和探索，你可以在rstudio :: conf 2018上找到其中一篇演讲的录音。演讲的重点主要是我对于PCA的理解，而这篇文章中，我将主要介绍我是如何实现PCA的，以及我是如何制作演讲中使用到的图表的。 rstudio :: conf 2018 https://www.rstudio.co
Principal Component Analysis (PCA) with Python
关键字全网搜索最新排名 【机器学习算法】：排名第一 【机器学习】：排名第一 【Python】：排名第三 【算法】：排名第四 前言 奇异值分解(Singular Value Decomposition，简称SVD)是在机器学习领域广泛应用的算法，它不光可以用于降维算法中的特征分解，还可以用于推荐系统，以及自然语言处理等领域，是很多机器学习算法的基石。本文就对SVD的原理做一个总结，并讨论在在PCA降维算法中是如何运用运用SVD的。 特征值与特征向量 首先回顾下特征值和特征向量的定义如下： Ax=λx 其中A是
在之前的文章中，我们已经详细介绍了主成分分析的原理，并用Python基于主成分分析的客户信贷评级进行实战。
Data is the fuel of big data era, and we can get insightful information from data. However, tons of data in a high number of dimensions may cover valuable knowledge. Therefore, data mining and feature engineering become essential skills to uncover valuable information underneath the data.
主成分分析（principal component analysis,简称PCA）是一种经典且简单的机器学习算法，其主要目的是用较少的变量去解释原来资料中的大部分变异，期望能将现有的众多相关性很高的变量转化为彼此互相独立的变量，并从中选取少于原始变量数目且能解释大部分资料变异情况的若干新变量，达到降维的目的，下面我们先对PCA算法的思想和原理进行推导： 主成分即为我们通过原始变量的线性组合得到的新变量，这里假设xi(i=1,2,...,p)为原始变量，yi(i=1,2,...,p)为主成分，他们之间的关系
“管道工作流”这个概念可能有点陌生，其实可以理解为一个容器，然后把我们需要进行的操作都封装在这个管道里面进行操作，比如数据标准化、特征降维、主成分分析、模型预测等等，下面还是以一个实例来讲解。
在PCA中，要做的是找到一个方向向量（Vector direction），当把所有的数据都投射到该向量上时，PCA的关键点就是找到一个投影平面使得投影误差最小化。
最近看文献，发现越来越多的单细胞测序使用scanpy进行轨迹推断，可能因为scanpy可以在整体umap或者Tsne基础上绘制细胞发育路径，图片也更加美观，但是Scanpy是基于python开发的，下面整理下Scanpy官网给出的流程，按照官网流程跑一遍PBMC的数据。
專 欄 ❈ 王勇，Python中文社区专栏作者，目前感兴趣项目为商业分析、Python、机器学习、Kaggle。17年项目管理，通信业干了11年项目经理管合同交付，制造业干了6年项目管理：PMO,变革，生产转移，清算和资产处理。MBA, PMI-PBA, PMP。 ❈ 本文目标是通过比较，引入传统的统计方法（上古魔法），打开数据集的黑盒子。探讨如下方法： 1、检验训练集和测试集是否相同分布。相同分布，是统计方法和机器学习的共同前提。 这可以帮助预判后面的机器学习的训练，调参和stackin
專 欄 ❈楼宇，Python中文社区专栏作者。一位正在海外苦苦求学的本科生。初中时自学编程，后来又在几位良师的帮助下走上了计算机科学的道路。曾经的 OIer，现暂时弃坑。兴趣不定，从机器学习、文本挖掘到文字识别以及各种杂七杂八的知识都有一点点涉猎。同时也对物理学有相当大的兴趣。 知乎：https://www.zhihu.com/people/lou-yu-54-62/posts GitHub：https://github.com/LouYu2015❈ 用 Python 分析《红楼梦》（1） 用 Pyth
大数据文摘作品，转载要求见文末 编译团队|李小帅，姚佳灵 有太多不如没有！如果一个数据集有太多变量，会怎么样？这里有些可能的情况你也许会碰上—— 1.你发现大部分变量是相关的。2.你失去耐心，决定在整个数据集上建模。这个模型返回很差的精度，于是你的感觉很糟糕。3.你变得优柔寡断，不知道该做什么。4.你开始思考一些策略方法来找出几个重要变量。 相信我，处理这样的情形不是像听上去那样难。统计技术，比如，因子分析，主成分分析有助于解决这样的困难。在本文中，我详细地解释了主成分分析的概念。我一直保持说明简要而详实。
作者：Adrian Tam, Ray Hong, Jinghan Yu, Brendan Artley 翻译：汪桉旭校对：吴振东 本文约3300字，建议阅读5分钟本文教你了解了如何使用主成分分析来可视化数据。 标签：主成分分析 主成分分析是一种无监督的机器学习技术。可能它最常见的用处就是数据的降维。主成分分析除了用于数据预处理，也可以用来可视化数据。一图胜万言。一旦数据可视化，在我们的机器学习模型中就可以更容易得到一些洞见并且决定下一步做什么。 在这篇教程中，你将发现如何使用PCA可视化数据，并且使用可视化
PCA介绍： 主成分分析（Principal Component Analysis），是一种用于探索高维数据的技术。PCA通常用于高维数据集的探索与可视化。还可以用于数据压缩，数据预处理等。PCA可以把可能具有线性相关性的高维变量合成为线性无关的低维变量，称为主成分（principal components），新的低维数据集会尽可能的保留原始数据的变量，可以将高维数据集映射到低维空间的同时，尽可能的保留更多变量。 注意：降维就意味着信息的丢失，这一点一定要明确，如果用原始数据在模型上没有效果，期望通过降维来进行改善这是不现实的，不过鉴于实际数据本身常常存在的相关性，我们可以想办法在降维的同时将信息的损失尽量降低。当你在原数据上跑了一个比较好的结果，又嫌它太慢模型太复杂时候才可以采取PCA降维。
首先，节日快乐！在这个众人狂欢的节日里，我冷静了冷静，听说知识量储备差太多的人做不了朋友，于是默默的搬起了板凳专心学习。 昨天我们看了看千人基因组计划的公共数据的PCA分群。 【直播】我的基因组55：
数据挖掘是从大量数据中发现有用信息和模式的过程。在当今数字化时代，数据不断产生和积累，数据挖掘成为了获取有价值洞察力的重要手段之一。Python作为一种功能强大的编程语言，在数据挖掘领域拥有广泛的应用。本文将介绍Python数据分析中的高级技术点，帮助您更深入地了解数据挖掘的过程和方法。
第 11-20题是使用3大R包从细胞的降维和分群到每个群细胞的功能注释，最后到公共数据库的注释，生存分析看不同细胞亚群的临床意义。
Benchmarking principal component analysis for large-scale single-cell RNA-sequencing大规模单细胞RNA测序的基准主成分分析
当机器学习工具 Scikit-Learn 遇上了可视化工具 Matplotlib，就衍生出 Scikit-Plot。
网上关于各种降维算法的资料参差不齐，同时大部分不提供源代码。这里有个 GitHub 项目整理了使用 Python 实现了 11 种经典的数据抽取(数据降维)算法，包括：PCA、LDA、MDS、LLE、TSNE 等，并附有相关资料、展示效果;非常适合机器学习初学者和刚刚入坑数据挖掘的小伙伴。
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