在scikit learn中,GridSearchCV()支持'roc_auc‘作为评分函数。它在n折交叉验证中工作得很好,但是如果我使用LeaveOneOut,它就不能工作并生成错误消息。
ValueError: Only one class present in Y. ROC AUC score is not defined in that case.
虽然使用AUC绘制只有一个样本似乎是不可能的,但其他语言,如R,支持LeaveOneOut的roc_auc。
如何使用python和scikit-learn进行计算?如果这是不可能的,使用大折叠交叉验证结果会喜欢吗?
我搜索了谷歌,并看到了几个关于这个错误的StackOverflow帖子。这不是我的案子。
我使用keras训练一个简单的神经网络,并对分裂的测试数据集进行一些预测。但是,当使用roc_auc_score计算AUC时,我得到了以下错误:
"ValueError: Only one class present in y_true. ROC AUC score is not defined in that case."。
我检查目标标签的分布,它们是高度不平衡的。一些标签(总共29个标签)只有一个实例。因此,它们很可能在测试标签中没有正标签实例。因此,sklearn的roc_auc_
我已经使用下面的代码来绘制Tensorboard中的2幅标量图,这些标量图是从自定义ROC-AUC评分回调中获取的。
for epoch in range(len(history.history['roc_train'])):
with train_summary_writer.as_default():
tf.summary.scalar('roc_auc_train', history.history['roc_train'][epoch], step=epoch)
tf.summary.scalar(
如果我们有4种不同的笔记本,针对不同的ML模型结果。我们必须绘制一个ROC曲线,它显示了所有4种模型的ROc。我们怎么能做到这一点
这是我在每本笔记本上写的代码
import sklearn.metrics as metrics
# calculate the fpr and tpr for all thresholds of the classification
fpr, tpr, threshold = metrics.roc_curve(y_true1, y_pred1)
roc_auc = metrics.auc(fpr, tpr)
# method I: plt
import
我在这方面是新手,但我想为活性化合物与诱饵的一个小数据集绘制一条ROC曲线。我基于这个链接:ROC curve for binary classification in python在这种情况下,这个小数据集是一个虚拟筛选的结果,它从实验数据(IC50)中对具有已知活性或不活性的化合物进行排名和评分。 我不确定图和AUC是否正确。我注意到,即使测试(真)预测值之间只有一个值的差异,AUC也只有0.5。对于我在下面插入的代码中的真实值和预测值,它只有0.49左右。也许模型没有正确地识别这些化合物。然而,我注意到,除了一些其他位置的化合物外,它还正确地识别了排名中的前十个化合物。也许它比消极的更
从下面的代码看,使用keras和scikit评估roc实际上是有区别的。有谁知道怎么解释吗?
import tensorflow as tf
from keras.layers import Dense, Input, Dropout
from keras import Sequential
import keras
from keras.constraints import maxnorm
from sklearn.metrics import roc_auc_score
# training data: X_train, y_train
# validation data: X_vali
我不知道如何印刷中华民国的曲线,如果我能得到如何绘制它的解释,我将非常感激。
# Get prediction probability of the positive outcomes for each model
pred_bayes_prob = bayes_model.predict_proba(feature_test)
pred_dtc_prob = dtc_model.predict_proba(feature_test)
pred_knn_prob = knn_model.predict_proba(feature_test)
from sklearn.metrics i