对于python，我是个新手，但我想将使用rpy的python脚本转换为使用rpy2的python脚本。我们确实在某个地方安装了rpy (用于python2.6.x)，但它没有很好地处理当前版本的R (3.2.0)。但是，我们已经为这些脚本中使用的python版本安装了rpy2 (python2.7.5)
据我所知，以下是需要更改的行(我已将函数简化了一点)：
from rpy import r
r.library('<libname>', quietly=True)
r("""\
func <- function(x,a={opti
浏览 3提问于2015-12-09得票数 0
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将R代码与web服务器集成
、、、、
概述:需要将R库与用python编写的web服务器集成。我已经研究了一些在不同博客和堆栈溢出线程中通常提到的选项。我遇到的线程比较了像Rpy2和pypeR这样的库，并提供了集成R和python的具体答案。我想要的是一个通用的解决方案，这样R代码就可以被多种编程语言/客户端访问(为了将来的可扩展性)。
要求：
R代码应该单独运行，以处理大量的计算，而不是嵌入到应用服务器中。
R模块应该是可伸缩的和易于维护的。ex-对应用程序服务器的任何更改(用python编写)都不应触发R代码中的更改。
R模块可以用作使用python以外的web框架进一步开发应用程序的API。
已探讨的备选
浏览 2提问于2016-02-23得票数 3
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我有一个图形对象，它是用igraph R package创建的。如果我正确理解igraph 软件 package的体系结构，则igraph R<code>E 215</code><code>E 116</code>包<code>E 217</code>是一个从R使用igraph的接口。然后，由于还有一个igraph、、、Python、、接口，所以我想知道是否可以通过Python直接访问用R创建的igraph object。或者，从Python访问和访问Python的唯一方法是在R中导出带有write.graph()的igr
浏览 1提问于2013-10-02得票数 1
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我试图通过命令promt将python命令从R(在x64 Rstudio上)传递给python。如果我直接输入cdm，但如果我使用R函数system()通过R进行输入，它就会工作。格式是(这正是我在windows cmd shell/promt中的写法)：
pyhton C:/some/path/script <C:/some/input.file> C:/some/output.file
这在cmd中工作，并使用输入文件(在<>中)运行脚本，并给出输出文件。我以为我在R区能做到：
system('pyhton C:/some/path/script <C
浏览 2提问于2015-04-29得票数 0
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我在Pandas中有一个dataframe，我想使用R函数对它做一些统计。没问题!RPy使得将数据从Pandas发送到R很容易：
import pandas as pd
df = pd.DataFrame(index=range(100000),columns=range(100))
from rpy2 import robjects as ro
ro.globalenv['df'] = df
如果我们在IPython：
%load_ext rmagic
%R -i df
由于某些原因，ro.globalenv路由比rmagic路由稍慢，但没关系。重要的是:我最终要使用的数据格
浏览 4提问于2015-05-03得票数 9
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我是深度学习的新手，正在尝试使用Keras在R中构建一个模型。我有20,000个32x32x3图像存储在一个数组中，用于我运行的模型training.When：
model = keras_model_sequential()
model %>% layer_input(shape = c(32,32,3))
我得到以下错误：
Error in py_call_impl(callable, dots$args, dots$keywords) :
TypeError: int() argument must be a string or a number, not 'Sequen
浏览 6提问于2017-06-29得票数 2
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我使用system()函数从R中触发Python脚本，python脚本将一个数据帧写入一个.csv文件中，然后需要导入到R中，我想知道是否可以将数据帧从Python直接返回到R。
R
command = "python"
path2script='"/Desktop/testing_connection.py"'
allArgs = path2script
output = system2(command, args = allArgs, stdout=TRUE)
Python
df_temp = pd.read_csv('/Deskto
浏览 6提问于2016-08-19得票数 3
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我在一个大型网络中检测到了社区，在igraph中得到了一个低模块性。我怀疑结果。所以我再试一次，在igraph中，模块性要高得多。我不知道原因。在下面，我将编写一个示例网络和我使用的代码。
图：(ncol格式)图是无向的。第三栏是重量。)
1 2 123
1 3 32
2 3 523
3 6 3
6 5 11
6 8 234
5 8 324
3 9 234
9 11 32
9 12 5534
9 13 32
11 12 322
11 13 3
12 13 32
R码：
library(igraph)
g=read.graph('graph.ncol',format='n
浏览 2提问于2014-10-27得票数 1
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1)我需要在Python 7上运行一个外部程序，并将“活动”输出(不需要STDERR)重定向到文件调用log.txt。最好是附加，而不是覆盖。
2)这个外部程序将不时地将事件记录到我的输出文件log.txt中。3)我不希望我的python脚本在#1和#2上面等待。换句话说，我想让我的python脚本做#1和#2，然后返回，这样我就可以做其他事情了。
我试着跟在后面，运气不太好，( 1) \x{##**$$}#** ~‘2 '>>’3)
使用open(fileName，'w')作为fout: subprocess.call(命令，stdout=fout)
浏览 4提问于2017-12-25得票数 0
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我终于在我的装有Python2.7.8和R3.10.1的Windows7电脑上运行了RPy2。我想要调用R函数'DEoptim‘，它不是我的R安装附带的，但是这个包已经通过R存储库下载并在R中工作。
当我这样做的时候：
import rpy2.robjects as robjects
dea = robjects.r['DEoptim']
我得到以下错误：
LookupError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-3-a882c24e8623
浏览 5提问于2014-08-26得票数 0
我们有一个大型的，交互式的R程序，我们想要与闪亮的接口。有一个小Python程序，我们也想要创建一个接口，以配合它。这两组代码之间不存在依赖关系，但是作为一个研究机构，我们希望为这两个程序提供一个公共接口，这两个程序可能被相同的用户访问。做这件事的好方法是什么？在python/Django下合并并使用rpy2更好，还是通过R的闪亮接口对python程序进行系统调用？是否有更好的选择或推荐的做法？
浏览 4提问于2015-06-16得票数 1
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当我尝试运行下面的.yml角色时，我得到了一个关于nsupdate的错误。 我使用的是centos7，机器运行的是bind。 当我使用原始DNS服务器或ansible master进行nsupdate时，我可以更新记录，只有当我使用nsupdate模块时它才不起作用，有什么帮助吗？泰！ tasks/main.yml 这是包含相关代码的部分 - name: Add or modify ansible.example.org A to 192.168.1.1"
community.general.nsupdate:
server: "10.0.0.40"
浏览 23提问于2021-06-29得票数 0
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这是我的Dockerfile：
FROM alpine:3.5
RUN apk add --no-cache python3 && \
python3 -m ensurepip && \
rm -r /usr/lib/python*/ensurepip && \
pip3 install --upgrade pip setuptools && \
rm -r /root/.cache
# Copy files
COPY ./requirements.txt /app/requirem
浏览 8提问于2017-05-22得票数 3
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有没有办法将从R以.rds格式导出的空间数据集加载到Python中？原始数据的类是一个sf data.frame。我知道使用rpy2、geopandas和shapely可以做到这一点，但这需要在本地安装R (example here)。 这里的挑战是在本地机器上没有安装R的情况下读取python中的文件。有没有办法做到这一点？ Here is file that can be used as an example。
浏览 28提问于2020-01-04得票数 0
您好，我正在学习线性代数的python和Edx课程。()。
在"02.4.2.10练习矩阵向量乘法“的第一个框中，代码是：
import generate_problems as gp
print("What is the result of the matrix vector product below?")
p = gp.Problem()
p.new_problem()
generate_problems is a module that the professor at Edx created. However, I got an error importi
浏览 3提问于2015-05-17得票数 2
我正在开发一个python2.7模块，它使用ctypes从动态库运行编译函数。它包含一个类，它从该库包装C结构，表示图像，并用于接收C代码中的数据。
动态库执行数据的深度复制，特别是针对python包装器。
模块中的进一步处理是使用numpy数组完成的，因此，我应该将从C代码检索的数据转换为numpy.ndarray。
速度和内存消耗目前还不是一个问题。
现在，我已经在该类中实现了一个方法，它使用numpy.ndarray函数创建并返回numpy.frombuffer。
我在想，是否可以更好地实现它。
下面是python类
import ctypes as ct
import numpy as
浏览 1提问于2016-11-03得票数 1
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我在Windows7 (Python 3.6，Scapy 2.4.0)上对Scapy的一个非常基本的用法有一个问题。我还在这个系统上运行Npcap 0.99r7和Wireshark 2.6.2。系统只有一个无线网络接口和Npcap环回接口。
我设置了这个非常经典的TCP服务器...：
import socket
host = '127.0.0.1'
port = 8089
s = socket.socket(socket.AF_INET, socket.SOCK_STREAM)
s.bind((host, port))
s.listen(1)
connection, addr
浏览 36提问于2018-07-29得票数 1
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在R中有一个运行二进制R服务器的RServe包。 我可以远程连接到它，执行R命令并获得结构化输出。有用的东西。我想知道在Python中是否有类似的东西可用。 我想在某个远程服务器上运行Python解释器，连接到它，执行Python命令并返回结果。有可能吗？
浏览 23提问于2019-02-06得票数 1
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我在R中使用Tensorflow包，我需要合并两个字典来创建一个feed.dict。
在python 中。在R中做这件事的最好方法是什么？由于我无法控制的原因，我不能直接使用Python。
编辑
我在这里做了以下工作。如果有人有一个更好的解决方案，请张贴一个答案。
mergeDictionaries = function(dict1, dict2){
list1 = py_to_r(dict1)
list2 = py_to_r(dict2)
r_to_py(c(list1, list2))
}
浏览 3提问于2017-07-23得票数 1
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我的discord机器人中的meme命令以前是有效的，但它突然停止工作了……以下是代码 @commands.command(name = 'meme')
@commands.cooldown(1, 2, BucketType.user)
async def meme(self,ctx):
'''get a random meme from reddit!'''
subreddits = ['dankmemes', 'memes','meme', 'whole
浏览 345提问于2021-09-19得票数 0
我正试着在windows10机器上创建一个简单的web监控应用程序，使用scapy(2.4.3)，python 2.7。我还安装了winpcap(5.0.9983.830)。 这是我试图运行的代码： def http_header(packet):
print packet
sniff(iface='eth0', prn=http_header) 下面是它抛出的错误： raise ValueError("Unknown pypcap network interface %r" % pcap_name)
ValueError: Unknown pypc
浏览 99提问于2020-01-14得票数 0
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我希望使用mapPartitions和减少火花的功能()，使用火花。
它很简单，我只需要使用一个简单的python代码。我可以简单地添加python函数作为回调函数。这么简单。
例如，在pyspark中，我可以如下所示使用这两个函数：
mapdata = self.rdd.mapPartitions(mycbfunc1(myparam1))
res = mapdata.reduce(mycbfunc2(myparam2))
然而，在R中，这似乎是不可能的，例如sparklyr库。我检查了RSpark，但它似乎是R中查询/争用数据的另一种方式，而不是其他方式。
如果有人让我知道如何在R中使用这两
浏览 4提问于2016-10-08得票数 2
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如果有人能在这里帮我，我会很高兴的。
我使用的是ubuntu13.10和Python2.7，R 3.0.1，并且我已经成功地按照rpy2安装指南进行了测试。
当使用这个命令python -m 'rpy2.tests'通过提示符运行测试时，我得到以下错误：
rpy2 version: 2.3.8
built against R version: 3-0.1--62743
............................................................................................ .............
浏览 0提问于2013-11-26得票数 1
我想要监控文件夹中的某些文件，当文件发生变化时，我想捕获这种变化，并基于这种变化，我想触发某些程序。
最初，我引用了堆栈溢出并使用了其中的一些代码。当我尝试实现时，这不能触发某个程序，但它可以单独捕获更改。
请在下面找到我的代码：
import os, sys, time
from time import gmtime, strftime
def files_to_timestamp(path):
files = [os.path.join(path, f) for f in os.listdir(path)]
return dict ([(f, os.path.getmtime(f)) f
浏览 0提问于2015-06-23得票数 2
将此用于DockerFile，在使用docker run -p 5000:5000 flask_app:1.0运行时，它会运行，但浏览器显示127.0.0.1拒绝连接。 RUN apt-get update \
&& apt-get install tesseract-ocr -y \
python3 \
#python-setuptools \
python3-pip \
&& apt-get clean \
&& apt-get autoremove
ADD . /home/App
WORK
浏览 12提问于2020-04-28得票数 0
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我正在尝试用Fortran 90重写一些Python / numpy代码。在我的Python代码中，我使用以下命令生成5000个随机对数正态分布数：
numpy.random.lognormal(mu,sigma,5000)
我正尝试在Fortran中做同样的事情。我对Fortran不是很熟悉，但我在Intel的网站上找到了这个：
status = vdrnglognormal( method, stream, n, r, a, sigma, b, beta )
我知道n,r,a,sigma,b和beta是什么，但我不知道它们的方法/流是什么意思，也不知道我应该如何传递这些值。另外，什么是状
浏览 4提问于2012-12-07得票数 2
2回答
一般来说，有没有人知道Python的拓扑数据分析库？我在R中使用了TDA包，但我对Python比较满意，我更愿意使用这种语言。此外，我尝试使用Python (无法编译它，可能是因为我使用Python 3而不是Python 2)，但没有成功。任何推荐的图书馆将不胜感激，谢谢。
浏览 0提问于2017-12-10得票数 1
我试图在python中使用子流程模块，但要开始工作有点棘手。这是我的密码
import sys
import os
import subprocess
import shlex
def install_module(dir_path, command):
c = shlex.split(command)
os.chdir(dir_path)
try:
p = subprocess.check_output(c, shell=True)
except subprocess.CalledProcessError as e:
#pri
浏览 4提问于2015-06-22得票数 2
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1回答
对不起，作为初学者，我不知道如何直接从python中显示图形。我完全可以在DB中创建一些图形，并在默认的中看到它们，但不能自动看到它们。
from py2neo import Graph, Node, Relationship, Path
graph = Graph()
bob = Node("Person", name="Bob")
#.........
graph.create(bob, ......)
graph.cypher.execute("MATCH (p:Person) - [r] - (x) RETURN p, r, x")
#
浏览 2提问于2015-04-16得票数 1
1回答
我对建模很陌生，我正试图通过python设计两个模型，这些模型是：
霍尔特·温特斯
未观测构件模型
我看到这些模型在R中是可用的，我能用rpy2将这些函数从R调用到python吗？
谢谢
浏览 3提问于2016-04-18得票数 0
1回答
我正在通过rpy2包控制R槽Python。除了我必须通过Rlist引入一些函数参数之外，一切都很好。Rlist与Python：list使用相同的关键字定义，但是它的内容非常不同。因为Python相信我正在创建Python列表，而不是Rlist，所以总是会显示错误。我正在使用rpy2控制WaveleComp R软件包。
这里我展示了一个示例，在这个示例中，我尝试编写legend_params程序
import pandas as pd
# Import R manage tools:
import rpy2.robjects.packages as rpackages
from rpy2.rob
浏览 2提问于2020-06-17得票数 0
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1回答
我在我的mac上成功构建了一个docker镜像。我通过输入docker run -p 8000:8000来运行这个镜像。Django服务器已启动并准备接受请求。但是当我通过邮递员请求给定的URL时，我得到了一个错误:套接字挂起。这是我的docker文件。 FROM python:3.6-slim-stretch
ENV PYTHONUNBUFFERED 1
WORKDIR /app
COPY requirements.txt requirements.txt
RUN apt-get -y update
RUN apt-get install -y --fix-missing \
浏览 24提问于2021-07-29得票数 0
4回答
我有一些python工具，我想要发送更新到hipchat房间。我在其他地方使用shell脚本执行此操作，因此我知道它在我们的环境中可以工作，但我似乎无法将令牌推送到hipchat API。一定要简单一点。
首先，这将正确地进行身份验证并传递一条消息：
curl -d "room_id=xxx&from=DummyFrom&message=ThisIsATest&color=green" https://api.hipchat.com/v1/rooms/message?auth_token=yyy
但是当我尝试使用python的“请求”模块时，我被卡住了。
浏览 0提问于2014-02-26得票数 2
简介：
好的，首先，我只想说，当我在Python上测试这个连接到pc上的COMPORT时，传感器确实会发送它的数据。我将包括我创建的与传感器一起工作的Python ，以便所有信息都可供各位使用。我还将提供一个链接到PJRC论坛，我已经问了同样的问题，因为我已经收到了关于这个问题的答复，但它仍然存在，我希望你们能听到他们所说的话。
(Python & PJRC链接将位于文章的最底部)
问题：
所以，我的问题是我不知道如何正确地从Teensy 3.5发送ASCII命令，然后用Teensy 3.5读取流量计的输出。我担心硬件连接错误，或者我只是在做一些错误的事情。
串行控制台将保持空白，这意
浏览 25提问于2022-03-03得票数 0
我第一次尝试用面向对象的语言编写python。它仍然觉得通过主控制器传递接口类型是不对的。我在努力遵循坚实的原则。让我给你看看密码。
TicTacToeOnConsol.py：
import os
from Controller import StartController
os.system('cls')
StartController().StartGame('consolInterface')
Controller.py：
from UserInterface import ExecuteActionOnInterface
class StartCon
浏览 3提问于2014-12-29得票数 0
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我尝试的是:我试图运行一个简单的酒瓶应用程序使用码头。使用站点作为参考。
我的伪造文件：
FROM ubuntu:latest
RUN apt-get update -y
RUN apt-get install -y python-pip python-dev build-essential
COPY ./app /app
WORKDIR /app
RUN pip install -r "requirements.txt"
ENTRYPOINT ["python"]
CMD ["app.py"]
Python文件：
from flask impo
浏览 1提问于2018-10-02得票数 9
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当我们想要运行一个裸露的Django应用程序时，我们使用术语：python manage.py runserver <ip>:<port>来启动一个具有所需IP地址的web服务器。我尝试在docker-compose文件中使用Docker和Django做类似的事情： version: '3.1'
volumes:
init-db:
data-db:
services:
mongo:
image: mongo
restart: always
environment:
浏览 27提问于2021-06-27得票数 0
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我正在尝试编译具有FileGDB支持的GDAL。运行以下两个脚本，第一个脚本获取ESRI FileGDB，第二个脚本编译设置了with-fgdb支持标志的GDAL：
mkdir -p /provisioning/filegdb && \
curl -# -o filegdb_api_${FILEGDB_VERSION}-64.tar.gz ${FGDB_SOURCE} && \
tar -zxvf filegdb_api_${FILEGDB_VERSION}-64.tar.gz && \
cp -r FileGDB_API-64/lib/* /u
浏览 9提问于2018-01-08得票数 2
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2回答
我试图在Quarto文档中从Python调用一个R对象：
---
title: "pandas"
format: html
jupyter: python3
---
```{r}
数据(“企鹅”，package =“掌纹企鹅”)
```{python}
penguins=r.penguins
企鹅
当我在RStudio中一个一个地执行块时，一切都没问题：
> data("penguins", package = "palmerpenguins")
> reticulate::repl_python() # automaticall
浏览 11提问于2022-05-01得票数 1
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1回答
我对bash比较陌生，无法在标题中解释我的问题，我做了大量的googling搜索，我想这就是我想出来的标题
我希望能够使用python并在EOF中定义一个bash变量(如果可能的话)，然后调用它。
test.txt
everything - literally the string everything
我打开这个文件，用test.sh获取内容
#!/bin/bash
CMD=$(cat <<EOF
with open('text.txt', 'r') as f:
for line in f.readlines():
p
浏览 4提问于2022-01-31得票数 0
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我尝试了带有Bing ASR服务的，以便用脚本转录
#!/usr/bin/env python3
"""Recognize speech using Microsoft Bing Voice Recognition."""
import speech_recognition as sr
from os import path
AUDIO_FILE = path.join(path.dirname(path.realpath(__file__)), "input.wav")
# use the audio file as t
浏览 0提问于2017-10-08得票数 0
2回答
限制SSL连接的带宽
、、、、
我在上讨论了如何限制python上传，这将我送到了，在那里我被告知了一个名为的小帮助库。这对于常规的HTTP和套接字的大多数普通用途来说都是很好的。但是，我正在尝试限制SSL连接，并且尝试将socket-throttle与常用的SSL库(由requests隐式使用)组合在一起会导致库内部发生异常：
File "***.py", line 590, in request
r = self.session.get(url, headers=extra_headers)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/
浏览 0提问于2015-01-30得票数 8
2回答
我一直在尝试使用Python和requests登录这个网站的https://app.drillinginfo.com/gallery/，但是我无法管理会话。我不能使用Selenium，所以我需要在requests或urllib中有一个方法。有谁可以帮我？ 下面是我之前使用的代码： import requests
r = requests.Session()
payload = {'username':'password'}
r.post('https://app.drillinginfo.com/gallery/', data = payloa
浏览 19提问于2021-02-01得票数 0
我正在尝试使用python/urllib2向coverity web api发送SOAP xml请求(我无法安装新的python模块，所以我的选择仅限于urllib2)。
下面是我的代码：
def getDateTime():
t = datetime.now()
return t.strftime('%Y-%m-%dT%H:%M:%S.%fZ')
def coverityRequest():
dateAndTime = getDateTime()
username = 'usernamestr'
password = &#
浏览 1提问于2015-10-01得票数 1
我有一个python脚本，它使用python尝试在请求跟踪器(，RT)中创建票证，并且我可以让它与队列、主题和状态字段一起工作。但是，我尝试将“设备或区域”字段添加到我的有效负载中，它给出了错误：
Traceback (most recent call last):
File "resttest.py", line 23, in <module>
response = resource.post(path='ticket/new', payload=content)
File "build\bdist.win32\egg\rt
浏览 2提问于2013-07-29得票数 1
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我正在用学习Python，第三。在第67页，下面是这样一个示例代码
import re
NAME = r'(?P<NAME>[a-zA-Z_][a-zA-Z_0-9]*)'
NUM = r'(?P<NUM>\d+)'
PLUS = r'(?P<PLUS>\+)'
TIMES = r'(?P<TIMES>\*)'
EQ = r'(?P<EQ>=)'
WS = r'(?P<WS>\s+)'
master_pat = re.c
浏览 8提问于2016-05-06得票数 6
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我在使用rpy2将Python语言中的pandas DataFrame转换为R对象时遇到了问题。
新的pandas版本0.8.0 (几周前发布)具有将pandas DataFrames转换为R DataFrames的功能。问题出在转换我的pandas DataFrame的第一列时，它由python datetime对象组成(按时间序列连续)。转换为R dataframe将返回日期和时间的向量，而不是我认为称为"POSIXct“对象的R StrVector类型对象的向量。
我知道将返回类型的字符串转换为POSIXct的命令，使用命令"as.POSIXct('yyyy-mm
浏览 6提问于2012-07-17得票数 7
回答已采纳
有没有办法用一批项目对DynamoDB表执行update_item()？或者在Python中有什么解决方法吗？ response = table.update_item(
Key={
'ReleaseNumber': releaseNumber,
'Timestamp': result[0]['Timestamp']
},
UpdateExpression="set Sanity = :r",
ExpressionAttributeValues={
浏览 5提问于2021-06-24得票数 0
我正在尝试复制命令
ssh -L8080:127.0.0.1:80 example.com
和
ssh -R8080:127.0.0.1:80 example.com
使用python库sshtunnel ()。
所以我想出了一个相当于
ssh -L8080:127.0.0.1:80 example.com
成为
server = SSHTunnelForwarder(
'example.com',
ssh_username="username",
ssh_password="password",
remote_bind_address=(&#
浏览 30提问于2018-09-03得票数 2
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