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关于分子力场中键能项和角能项的思考

而势能表达式前的系数 \frac{1}{2} 主要是为了使得力的形式符合胡克定律,更方便理解,但实际上很多力场中把这个系数融入到了参数 k_b 中,且 k_b>0 。...再计算 k_b(\textbf{r}_B-\textbf{r}_A) 再计算 k_bb(\textbf{r}_B-\textbf{r}_A) ,一共是 6P 次乘法运算。...如果我们选择用CPU上(如果选择用GPU计算,那么评估标准会有所不同)的Python来计算一个bond force的话,那么就可能有这么几种思路: 用现有的自动微分框架,只需要实现一个bond_energy...的计算函数,就可以自动求得每个原子上的力; 用for循环来实现一个bond_force函数,使得计算满足最低的复杂度要求; 用Python的向量化运算来实现一个vector_bond_force函数,可以直接调用比较成熟的...总结概要 本文介绍了在分子力场中经常有可能被使用到的键长和键角项的谐振势模型,并且分别从自动微分的Python代码实现以及解析形式的矢量化编程形式给出了初步的实现方案。

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    【Python】Python 包 ① ( Python 包引入 | Python 包概念 | Python 包结构 | 创建 Python 包 | 导入 Python 包 )

    一、Python 包简介 1、Python 包引入 之前 介绍了 Python 模块 , 每个 Python 源码文件 , 都可以定义为一个 Python 模块 ; 如果 定义的 Python 源码模块很多..., 有几百上千个 , 则会出现管理繁琐 , 混乱的问题 ; 这里引入 新的代码结构 " Python 包 " ; 2、Python 包概念 Python 包 概念 : 包是 Python 模块 Module...的扩展 , 将若干 相关的 Module 模块 组织起来 形成一个 Python 包 , 可以更好地 组织 和 管理 Python 代码 ; 在 Python 包中 可以 定义 变量 / 函数 / 类..., 可以 更好地 组织 和 管理 Python 代码 ; 除了 自定义 Python 包之外 , Python 还提供了 Python 标准库 和 其他人编写的第三方 Python 包 来扩展 Python...包 右键点击 PyCharm 中的 Python 工程根目录 , 选择 " New / Python Package " 选项 , 输入 Python 包名称 , 然后点击回车 , 创建 Python

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    【Python】1“Hello,Python!”

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    Python基础-初识Python

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