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我如何在Python中进行分层聚类(在本例中是针对基因表达数据)，以显示基因表达值矩阵和树状图？我的意思是像下面这样的例子：
如何在Python中使用numpy/scipy或其他工具执行此操作？编辑:很多人建议使用聚类包，但我仍然不确定如何绘制上面在Python中链接的图像。例如，我如何使用Matplotlib将树状图<
浏览 0提问于2010-06-05得票数 3
请让我知道如何使用企业架构7.5创建一个uml图以及它的源代码(.py格式)的等效文档
请帮我找到解决方案，我已经阅读了这个网站上与我的主题相关的问题的解决方案，但都是徒劳的
浏览 0提问于2009-12-26得票数 2
我正在维护一个Python程序，并且正在努力理解各个类之间的关系。我认为查看类如何交互的图表会很有帮助。
有哪些可用的选项可以让我这样做？
浏览 4提问于2010-06-04得票数 9
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是否有任何应用程序可以从python3源生成类似以下链接的内容(我不关心表示形式，而是完美的内容)
浏览 0提问于2016-04-06得票数 17
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代码是用Python编写的，但我认为我的问题或解决方案应该是通用的。我不介意手工绘制它，因为它对我来说的价值是围绕可视化的可扩展性。
浏览 0提问于2010-12-14得票数 0
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python中的谱聚类图
、、、、
我想使用谱聚类在python中对图进行聚类。
这两种方法都提到，它们可以用于图表，但没有提供具体的说明。。
浏览 9提问于2017-09-16得票数 33
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在Python中绘制聚类图
、、、、
我已经有了一种聚类我的图的方法，所以聚类的过程不是这里的问题。我想做的是，一旦我们对所有节点进行聚类-在Python中绘制聚类图，如下所示：我研究了networkx、igraph和graph-tool，但它们似乎完成了聚类，而不是绘图。我应该使用什么库来绘制已经聚集的图，这将最小化交叉链接的数量，有什么想法和主张吗？
浏览 6提问于2013-05-22得票数 6
我使用pyreverse从python代码创建类图，结果图如下：可以看出，有些类是不相关的。我想让下面的子图彼此排列，这样我就可以在文档中包含图像。
浏览 6提问于2018-10-10得票数 1
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我正在寻找可以帮助恢复C++代码的python模块。我有一个很大的代码库，我想做一些分析。最终，我想拿出一个软件的图形地图。做这项工作最好的工具是什么，最好是python？
浏览 1提问于2010-08-04得票数 0
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我正在尝试为我的Python项目生成Doxygen文档。Doxygen似乎没有提供包括关联在内的项目的整体类图。它只显示单个文件的继承。有没有办法在doxygen中生成一个整体的类图？ 非常感谢!
浏览 53提问于2021-08-30得票数 0
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我有一个用java和jhipster实现的电报聊天机器人，这个API是：。有什么办法吗？
浏览 3提问于2021-09-28得票数 1
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在Python中，如何将树状图绘制在值矩阵的顶部，并适当地重新排序以反映聚类？下面是一个示例：
在这方面的任何帮助都将非常感谢。
浏览 5提问于2010-06-06得票数 51
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我有一个包装tensorflow图的类。
在我的文档中，我创建了我的类，并在其中构造了tensorflow图。can't pickle class tensorflow.python.util.xxx。我想这是一个已知的问题。我如何定制我的类来方便地转储和加载它？或者我可以pickle python session或tensorflow session？
浏览 2提问于2017-09-19得票数 0
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我想设计一个复杂的软件，但后来用Python (/Django)进行开发。出于这个原因，我想使用uml设计器来创建类图。但MS、Dia和yEd都没有python/django类导出。
浏览 0提问于2014-09-24得票数 0
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给定python中的任意有向图DG，是否可以优雅地使其成为无向图？(这都是关于networkx库的)。
我试图计算一些统计数据，如平均聚类、三角形数等等。然而，这些都是为无向图定义的，所以我想知道把有向图转换成无向图是否很简单。
浏览 5提问于2016-03-30得票数 0
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我尝试了如下所示的流图，但是我得到了下面的错误，无法运行它。可能是什么原因？谢谢。Executing: /usr/bin/python3 -u /home/nomo/fft.py
File "/home/nomo
浏览 10提问于2022-05-25得票数 0
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如果我用c++编写了一个图，并且想要在c++代码中运行它(不是用python!)自动分化会起作用吗？
让我们假设图中的每个op都有一个梯度实现。
浏览 2提问于2018-06-28得票数 2
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4回答
我已经实现了一个算法来解决图中的聚类问题。我使用python库"python- graph“来表示图形。现在，在我的计算的每一步(算法是迭代的)，我必须绘制树状图的一部分。实际上，该算法是分裂的，因为从原始图开始计算聚类。现在，我不知道用什么来绘制树状图(有人建议使用PIL，但我正在寻找简单的东西，我不知道如何使用PIL)……你能给我一些建议，并告诉我如何用它来进行绘图吗？注意:我读了其他问题，但似乎所有问题都使用了自动计算集群的方法……这不是我想要的:我需要
浏览 5提问于2011-06-26得票数 8
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