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1
回答
使用循环将数据输入到sqlite3
数据库
时出错
、
、
我已经使用DB浏览器创建了一个
数据库
,我想把我从
PubMed
得到的所有研究结果放到
数据库
中,包括标题和文章,我可以把它们拿出来,但当我把它们输入到
数据库
中时,我总是出错。import PubMedLookupimport sqlite3 email= 'litsunchak@gmail.com' url = 'http://ww
浏览 0
提问于2020-10-07
得票数 0
4
回答
MySQL帮助,使用where子句的重复条目
我的
数据库
中有两个表:ID
pubmed
_ID1 22test2看起来像这样:Hello 22当我使用以下select语句时: from test1, test2 我得到了: ID
pubmed
浏览 0
提问于2010-07-12
得票数 0
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2
回答
在使用Biopython时: NameError:名称'
pubmed
_id‘没有定义,尽管之前已经定义了它?
、
、
、
、
= record1.get("IdList") print("Plant: {} Disease: {} PubmedID: DOI:".format(plant, disease)) handle2 = Entrez.esummary(db="pmc", id
浏览 26
提问于2020-02-28
得票数 0
2
回答
不能使用post请求继续下一页
、
、
、
GENERALRequest URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
pubmed
%222015%22%5BDate%20-%20Publication%5D%20%3A%20%223000%22%5BDate%20-%20Publication%5D;id=reldata:db=
pubmed
from urllib.parse import urljoin from bs4 import
浏览 0
提问于2018-06-29
得票数 9
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1
回答
Power中表中值的出现
、
、
我得到了
PubMed
的文章,我使用Power来可视化每个作者写了多少篇文章,每一篇文章都是由许多作者写的,如图中所示--这是我在power bi中的表结构。
浏览 2
提问于2021-06-17
得票数 0
1
回答
rails在循环中更改布尔值。
、
、
下面是我使用的方法: nih_pub = NihPublication.where(user: current_user).all
pubmed
_pub.each {|
pubmed
| if nih.pubyear ==
pubmed
.publication_year and nih.pmid ==
pubmed
浏览 3
提问于2016-05-11
得票数 0
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1
回答
neo4j CYPHER --动态创建列表或映射集
、
、
、
、
要将XML数据导入neo4j
数据库
,我首先将该XML解析为python字典,然后使用CYPHER查询:UNWIND
pubmed
_article
浏览 0
提问于2018-06-17
得票数 0
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2
回答
Python:有没有一种方法可以从在线
数据库
的搜索结果页面上的每个href链接中的文章中抓取摘要文本?
、
当我在一个在线
数据库
(
pubmed
-一个科学文章
数据库
)的搜索栏中输入搜索词时,我得到了一个指向搜索结果文章的链接列表。我知道我可以像下面这样抓取url-data:import bs4 index_url]')] ['/
pubmed
&
浏览 18
提问于2017-01-03
得票数 0
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1
回答
URLError:<urlopen错误未知url类型:
pubmed
>
、
、
print ('*',s) 上面的代码适用于RSS feed - http://feeds.bbci.co.uk/news/rss.xml,但给出了适用于RSS feed - https://
pubmed
.ncbi.nlm.nih.govlimit=15&utm_campaign=
pubmed
-2&fc=20200625034601的错误 错误是: URLError: <urlopen error unknown url type:
pubmed</
浏览 17
提问于2020-06-25
得票数 0
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2
回答
R包RISmed:使用EUtilsget或汇总函数的不同结果
、
<- "Valproic+acid|Valproate[Title/Abstract]+ALDH5A1[Title/Abstract]"EUtilsGet(r, db= "
pubmed
")你对这种行为有什么想法或解释吗?将被丢弃,尽管它经常列在
数据库
中。
浏览 12
提问于2015-10-07
得票数 1
2
回答
使用preg_replace获取URL前的正斜杠
、
使用preg_replace获取URL前的正斜杠preg_match('/<div class="rprt">(.*)<\/div>/',$contentss,$ma
浏览 4
提问于2013-06-07
得票数 0
回答已采纳
2
回答
XPath提取属性内的值
、
、
这是到目前为止我的HTML代码: <td nowrap="x">Citation(s)</td> <span class="
pubmed
_id" id="26472973"> <a href="/
pubmed
/26472973">26472973<
浏览 0
提问于2018-11-08
得票数 0
3
回答
Python,在已知字符串下面的行上搜索文本?
、
、
、
、
这个网页包含描述使用基因组数据的项目的信息,我想提取所有
PUBMED
ID (来自这个项目的出版物的唯一ID号)。每个
PUBMED
ID是一个8位数字。我尝试过两种不同的方法来提取
PUBMED
ID,但这两种方法都存在问题。我不能在这里使用这两种方法,因为这个页面上除了
PUBMED
ID之外还有多个文本段具有相同的xml标记(<id>),而且如果我不知道文本是什么,我显然无法使用文本搜索
PUBMED
ID!', text, flags = 0)这给出了这样的输
浏览 1
提问于2016-12-06
得票数 1
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1
回答
网络搜索pubmeds 2.,3.,4...页面
、
、
、
所有其他关于网络抓取和
PubMed
的帖子都是关于不同的事情。我的代码:from bs4 import BeautifulSoup 'name': "EntrezSystem2.PEntrez.
PubMed
.
Pubmed
_ResultsPanel.
Pubmed
_Pager.Page"><< First</a><a name="EntrezSystem
浏览 3
提问于2019-07-13
得票数 1
1
回答
Entrez和SeqIO“在句柄中没有发现记录”
、
、
." # My e-mail address data1 = handle1.read()handle2 = Entrez.efetch(db="
pubmed
", id=pmid_list_2011, rettype="gb", retmode=
浏览 1
提问于2016-04-19
得票数 0
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1
回答
使用Python查询
PubMed
-如何获取从查询到Pandas DataFrame的所有文章详细信息并在CSV中导出它们
、
、
、
我需要以下文章的细节:
pubmed
_id,标题,关键词,期刊,摘要,结论,方法,结果,版权,doi,publication_date,authors
浏览 1
提问于2019-07-16
得票数 3
回答已采纳
2
回答
是否有任何方法获取给定的公共ids列表的摘要?
、
db=
pubmed
&id=**17284678,9997**&retmode=text&rettype=xml abstract_dict={"pmid1":"abstract1
浏览 5
提问于2017-11-29
得票数 4
回答已采纳
1
回答
保存/访问类方法中的字段(Django)
为初学者的问题和/或愚蠢道歉--我边走边学……我正在尝试传递一个用户输入的
PubMed
文章的url来访问该文章的元数据。我正在使用下面的代码,但是我不能访问“Entry”模型中save方法的任何内容。models.pyfrom django.contrib.auth.models import User email = "david.hallsworth@hotmail.c
浏览 8
提问于2019-07-27
得票数 1
回答已采纳
1
回答
行尾附加逗号,导致read.csv和read.table出错
、
、
我的工作是做以下工作:colnames(pmr) <- c(colnames
浏览 0
提问于2018-06-22
得票数 4
回答已采纳
3
回答
Pubmed
eutils搜索的排序选项?
、
、
我使用BioPython通过eutils API查询
Pubmed
数据库
。esearch端点有一个排序选项,但是API文档没有列出这个值的所有选项。示例呼叫: sortsort_method工作的值 但是,我不知道如何指定默认的排序
浏览 4
提问于2015-11-21
得票数 4
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