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    Nat. Commun.| 基于多模态深度学习方法的单细胞多组学数据聚类

    本文介绍由新泽西理工学院计算机科学系的韦智通讯发表在 Nature Communications 的研究成果:单细胞多模态测序技术的发展是为了在同一细胞中同时分析不同模态的数据,它为在单细胞水平上联合分析多模态数据从而识别不同细胞类型提供了一个独特的机会。正确的聚类结果对于下游复杂生物功能研究至关重要。然而,结合不同数据源对单细胞多模态数据进行聚类分析仍然是一个统计学和计算上的挑战。为此,作者提出了一种新的多模态深度学习方法scMDC,用于单细胞多组学数据聚类分析。scMDC是一种端到端的深度模型,它可以明确地表征不同的数据源,并联合学习深度嵌入的潜在特征以进行聚类分析。大量的模拟数据和真实数据实验表明,scMDC在不同的单细胞多模态数据集上均优于现有的单细胞单模态和多模态聚类方法。此外,运行时间的线性可扩展性使scMDC成为分析大型多模态数据集的有效方法。

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