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1
回答
multiprocessing.Pool
和
slurm
、
、
[tot_process,len(files)])) as pool: rt = pool.map(line_count,files) 其中,tot_process是我从运行Python代码的
slurm
在
slurm
脚本中,我有以下标头: #!
浏览 20
提问于2020-09-24
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3
回答
在
slurm
上使用python的多进程
、
、
我正在尝试在
slurm
上运行一些并行代码,其中不同的进程不需要通信。我天真地使用了python的
slurm
包。但是,我似乎只使用了一个节点上的cpu。python代码如下所示 print("Hello World") pool =
multiprocessing.Pool
浏览 1
提问于2016-10-11
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1
回答
python多处理的
SLURM
给出了不一致的结果
、
、
、
我们有一个4*64内核的小型HPC,它安装了
SLURM
。'].split('(')[0]) * int(os.environ['
SLURM
_JOB_NUM_NODES'])list(p.imap_unordered(func, [i for i in range(n_procs*2)]))#!%j.out # STDOUT #SBATCH
浏览 7
提问于2016-10-03
得票数 1
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1
回答
在
Slurm
中使用Python多处理,并且我需要哪种ntasks或ncpus组合?
、
、
、
、
我试图在
slurm
集群上运行python脚本,并且使用python的内置multiprocessing模块。我使用的设置非常简单,为了测试目的,示例如下:Out[2]: 5 output = threads.map我想知道的是,如何在
slurm
中分配正确的cpu/任务数量,以便按预期工作。以下是
slurm
批处理脚本的相关部分:正
浏览 0
提问于2017-03-28
得票数 7
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1
回答
Python多处理:查找核心ID
、
、
我正在使用
SLURM
在集群上测试Python的multiprocessing模块。我想绝对确保我的每个任务都像我想要的那样在不同的cpu核心上运行。由于配置
SLURM
的可能性很多,这一点并不明显。import multiprocessing print "Hello World" jobs = []range(10): j
浏览 7
提问于2019-06-03
得票数 3
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1
回答
集群上的
SLURM
和
Python多处理池
、
、
、
remove_duplicates_in_scraped_data.py.的Python程序这个程序是在单个节点(node=1xraspberry pi)上执行的,程序内部有一个多处理循环部分,看起来类似于: pool =
multiprocessing.Pool
我想利用
SLURM
集群的所有16个线程,但我似乎无法让它工作。我确信集群已经被正确配置,因为它可以在集群的所有16个线程中使用
SLURM
运行所有多处理示例(例如计算pi位数)。1 picluster* idle 4 4:1:1 1
浏览 0
提问于2021-06-14
得票数 4
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1
回答
slurm
批处理队列任务,但不执行
、
我在AWS集群上使用
slurm
,并编写了一个执行脚本,该脚本似乎不起作用。如果我单独运行这个脚本,它就运行得很好。但是,在使用sbatch运行时,它不起作用。我使用以下代码调用sbatch: do sudo /opt/
slurm
/bin/sbatch ./
slurm
_script.sh $sample; done 脚本
slurm
_script.sh包含一个非常长的生物信息学管道。当
浏览 0
提问于2019-01-24
得票数 0
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1
回答
忽略
slurm
输出
和
错误标志。
、
我目前正在我的项目中使用
slurm
,并试图运行一个非常简单的hello world作业。我希望将我的stdout
和
错误重定向到特定位置的特定文件。因此,我使用了以下命令:sudo su -c 'sbatch /home/
slurm
/job.script --error=/home/
slurm
/job%j.out --output=/home/
slurm
/job%j.out'
slurm</
浏览 2
提问于2021-10-29
得票数 1
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1
回答
如何在不同的组中访问同一主机的组变量?
、
、
这是我的ansible库存文件:
slurm
-gpu-0 ansible_host=192.168.0.24 ansible_connection=local
slurm
-gpu-1allow_accounts=['whitelist=['
slurm<
浏览 4
提问于2020-05-15
得票数 1
2
回答
Slurm
的srun比mpirun慢
、
Process Manager: pmiTopology libraries available: hwloc Resource management kernels available: user
slurm
浏览 18
提问于2015-08-06
得票数 2
1
回答
如何使用HPC集群上的python分配的所有节点
、
、
、
、
我有一个安装了
SLURM
的HPC集群。我可以为自己正确地分配节点
和
核心。我希望能够使用所有分配的核心,而不管它们在哪个节点。正如我在这个线程中所看到的,这不能用multiprocessing来实现。我的脚本看起来如下(过于简化的版本): #lots of computing parallel_pool =
multiprocessing.Pool
这个脚本非常好,但是,正如我前面提到的,多处理对我来说不是一个好工具,因为即使
SLURM
为我分
浏览 3
提问于2016-12-01
得票数 0
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1
回答
如何将sbatch与
SLURM
和
makefile一起使用?
、
、
、
、
我正在尝试向
SLURM
提交批处理作业,但我一直收到JobState=FAILED Reason=NonZeroExitCode。我可以在普通的g++上很好地编译
和
运行代码,但我必须使用
SLURM
来完成学校的作业。我认为我正在正确地运行它们,并且我得到了一个来自根的令人讨厌的-gram,告诉我停止在登录节点上运行脚本。下面是我的批处理文件
和
Makefile: #!
浏览 0
提问于2014-09-30
得票数 2
1
回答
如何使
SLURM
使用gres.conf
我使用
SLURM
分配作业,并且我有一个名为“卡片”的通用资源。在
slurm
.conf中有一行:在节点配置行中不包含此资源。所有节点都可以访问
slurm
.conf
和
gres.conf。我试着运行scontrol reconfigure并重新启动
SLURM
守护进程--这没有帮助。
浏览 8
提问于2021-12-14
得票数 0
1
回答
如何强迫用户在
slurm
中的某个目录中提交作业
我试图设置
SLURM
,使
SLURM
接受在某个目录中提交的作业,否则拒绝该作业。要激活prolog脚本,我已经将
slurm
.conf设置为:/etc/
slurm
/prolog
浏览 0
提问于2019-05-04
得票数 1
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1
回答
充分利用
SLURM
上的所有CPU
、
、
、
、
我想在群集上运行作业。在不同的节点上有不同数量的CPU,我不知道哪些节点将分配给我。什么是适当的选项,以便作业可以在所有节点上创建与CPU一样多的任务?#SBATCH -N 4
浏览 29
提问于2019-08-13
得票数 3
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1
回答
在
SLURM
中运行一个大MPI作业后的顺序任务
、
、
我有一个
slurm
作业,我使用批处理脚本启动它,例如: #!
浏览 2
提问于2017-09-10
得票数 2
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1
回答
SLURM
_ARRAY_TASK_ID为空
、
我是
SLURM
和
云计算方面的新手。这是bash代码。EF=$((${
SLURM
_ARRAY_TASK_ID}*10+10)) ./var/spool/<em
浏览 5
提问于2018-10-10
得票数 1
2
回答
配置
SLURM
,使其需要用户指定--account
、
、
、
我正在尝试弄清楚如何配置
SLURM
,以便用户在使用
SLURM
命令(salloc、sbatch、srun)时需要指定--account。实际上,我想禁用默认帐户行为。
浏览 0
提问于2014-09-05
得票数 1
1
回答
Slurm
新工作节点
、
、
作业将使用
Slurm
分发到各个节点。两个问题: 是否为
Slurm
工作人员设置了一个代理或类似的代理,以便节点自动向头节点注册?可以在运行时更改
Slurm
配置文件吗?
浏览 6
提问于2022-03-21
得票数 0
1
回答
SLURM
/sbatch:传递数组ID作为可执行文件的输入参数
、
、
、
、
我是
SLURM
的新手,我尝试做一些非常自然的事情:我有一个编译过的C程序off.exe,它以一个变量作为输入,我想并行运行它几次,每个程序都有一个不同的输入参数值。
浏览 0
提问于2021-05-17
得票数 0
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