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    slurm学习笔记(一)

    slurm学习笔记(一) 官网: https://slurm.schedmd.com/ 一、slurm简介 Slurm (Simple Linux Utility for Resource Management...,https://slurm.schedmd.com/)是一种可用于大型计算节点集群的高度可伸缩和容错的集群管理器和作业调度系统,超级计算系统可利用Slurm进行资源和作业管理,以避免相互干扰,提高运行效率...二、slurm的三种作业模式 1....实时分配模式作业(采用salloc命令提交): 分配作业模式类似于交互式作业模式和批处理作业模式的融合。 用户需指定所需要的资源条件,向资源管理器提出作业的资源分配请求。...scontrol:显示或设定Slurm作业、队列、节点等状态。 sinfo:显示队列或节点状态。 squeue:显示队列中的作业及作业步状态。

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    Docker 快速部署 Slurm 集群

    加之,这个项目采用了数据库,而且只适用于单机上部署 Slurm 集群,和本人的诉求有些不一致。所以也排除了这种方法。   ...本人目前的条件和需求如下: 拥有若干台服务器的非 root 权限用户账号和 Docker 运行权限; 服务器之间共用了同一个 NAS 服务器; 想要在这些服务器上搭建一个可用的高性能 Slurm 集群。...如图所示,对于 Slurm 集群来说最重要的其实是 6817 和 6818 两个端口的通信。图中的数据库的目的是为了保证 Slurm 节点的用户名一致,事实上可以想到别的办法来替代它。...(上图引用自 https://github.com/SciDAS/slurm-in-docker ) 安装配置   Slurm 集群的节点之间通过 6817 和 6818 两个端口进行通信,其基础的配置就是...munge key 和 slurm.conf 两个文件一致,相互之间互信。

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    slurm--核算和资源限制

    概览 Slurm可以被配置为收集每个作业和作业步骤执行的核算信息。核算记录可以被写入一个简单的文本文件或一个数据库。目前正在执行的作业和已经终止的作业的信息都是可用的。...与这些插件相关的Slurm配置参数(在slurm.conf中)包括: AccountingStorageType控制如何记录详细的作业和作业步骤信息。...将数据直接从Slurm中存储到数据库中似乎很有吸引力,但它不仅需要为Slurm控制守护进程(slurmctld)提供用户名和密码数据,还需要为需要访问数据的用户命令(sacct、sreport和sacctmgr...在Slurm和SlurmDBD配置文件(分别为slurm.conf和slurmdbd.conf,更多细节将在下面提供)中需要本地域套接字的路径名。...在你授予mysql中的用户 "slurm "权限后,你可以启动SlurmDBD和其他Slurm守护程序。

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    【科研利器】slurm作业调度系统(二)

    前面我们对slurm作业调度系统进行了一个简单的介绍【科研利器】slurm作业调度系统(一),今天我们继续对如何用slurm提交批处理任务以及使用 sinfo、squeue、scontrol命令查询作业信息进行具体的介绍...其中我们需要关注的主要是 state 和 partition ,若 state 中显示 idle 表示节点处于空闲状态,可接收新的作业;显示 allocated 表示节点已经分配了一个或者多个作业且所有核心用满...脚本 在slurm作业调度系统下,主要支持两种作业形式:提交交互式任务和提交批处理任务。...实际在每个节点上分配的 CPU 数量由 --ntasks-per-node 和 --cpus-per-task 参数共同决定,等于两者乘积之和。...3 提交任务 将slurm脚本编写完毕并上传超算后(或直接在超算编辑),进入 slurm脚本的目录,使用如下命令完成脚本(test.slurm)的提交。

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    slurm--大型集群管理指南

    目前由Slurm管理的大型系统包括天河二号(位于中国国防科技大学,拥有16000个计算节点和310万个内核)和Sequoia(位于劳伦斯-利弗莫尔国家实验室的IBM Bluegene/Q,拥有98304...Slurm在更大数量级的系统上的运行已经通过仿真验证。在这种规模下获得最佳性能确实需要一些调整,本文件应该有助于让你有一个好的开始。对Slurm的工作知识应该被认为是本资料的先决条件。...节点配置 虽然Slurm可以跟踪每个计算节点上实际发现的内存和磁盘空间的数量,并将其用于调度目的,但这需要额外的开销。...虽然Slurm可以很容易地处理一个异构的集群,但使用slurm.conf中最少的行数来配置节点,既可以使管理更容易,也可以使性能更好。...其他 Slurm在slurmd守护进程之间使用分层通信,以增加并行性和提高性能。TreeWidth配置参数控制消息的扇出。

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    【科研利器】slurm作业调度系统(一)

    常见的超级计算机作业调度系统有SLURM和Torque PBS,但我自己在实际应用过程中常见到的是slurm,以下就slurm作业调度系统进行一些简单的介绍!...SLURM 是其中一个优秀的开源作业调度系统,和 Torque PBS 相比,SLURM 集成度更高,对 GPU 和 MIC 等加速设备支持更好。...首先我们需要编写一个slurm脚本,假设命令为test.slurm。 #!...之后有 # 开头的若干行表示 SLURM 作业的设置区域,它告诉工作站运行任务的详细设定:它被提交到 cpu 分区当中,申请 1 个节点的 1 个 核心,限制任务最大运行时间是五分钟,将标准输出和标准错误放在...系统默认会将标准输出文件和标准错误文件复制到调用 sbatch 的目录下。默认的文件名是 slurm-.out,其中 JOBID 是作业号。

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    【科研利器】slurm作业调度系统(三)

    今天呢,我们主要就作业脚本中两个非常重要的概念 Partition和 QoS 进行介绍,并给出一些实用技巧。”...举个例子来理解,如下表所示,我们有两个分区:cpu 分区和 gpu 分区。他们各自的资源配置不同,有的有 cpu 节点,有的有 gpu 节点。...最后一点,关注该分区节点的状态,在有多个分区的配置满足任务需求的时候,当然选择那个排队少的分区啦(关于如何查看节点状态,可见【科研利器】slurm作业调度系统(二))。...由于可修改的属性非常多,我们可以借助 slurm 自动补全功能来查看可修改的内容。这只需要我们在输入完 JOBID 后空一格并敲两下 TAB 键。...参考资料: https://bicmr.pku.edu.cn/~wenzw/pages/slurm.html#partition

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    【科研利器】slurm作业调度系统(五)

    上一期我们给出了一些在slurm作业系统中常见的报错提示的含义及解决方法。今天我们主要来看看如何在超算中配置运行环境。”...所需软件的安装在这里不做具体介绍,文章主要针对如何调用超算中的软件来选择最合适的编程环境和运行环境做一些分享。...那我们通过 slurm 脚本提交任务时,会分配到不同的计算节点上,并非我们的个人账户所在的节点。...对于这种情况,方便的做法是直接将 module 命令这一行写在slurm脚本中,随着它的运行自动在分配到的节点中加载所需 module 。 #!...掌握了以上内容以后,我们就可以在同一软件的不同版本之间切换,也可以在同一功能的不同软件之间切换,以此来选择最合适的编程环境和运行环境啦。

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    【科研利器】slurm作业调度系统(四)

    上一期我们介绍了作业脚本中两个非常重要的概念Partition 和 QoS 进行介绍,并给出一些实用技巧。今天呢,我们给出一些在slurm作业系统中常见的报错提示的含义及解决方法。”...前面的教程【科研利器】slurm作业调度系统(一)中我们说过,超算集群上不只有我们在使用,还有很多的用户同时也在提交作业、运行程序。而超算上的计算资源却是有限的。...如果遇到了作业被提交但一直没能运行的情况,可以通过 squeue 命令来查看作业状态(该命令有很多可选参数,能帮助我们更快的掌握想知道的信息,详见【科研利器】slurm作业调度系统(二))。...其中的加粗部分表示异常原因,用户需要修改 slurm 脚本或联系管理员。这里需要注意的是,用户申请的资源超过当前 QoS 限制时,slurm作业调度系统会直接拒绝该任务。...参考资料: https://hpc.pku.edu.cn/_book/guide/slurm/sbatch.html

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    CONQUEST 编译安装指南 Slurm 篇

    我们常见的集群作业管理系统有 PBS、LSF 和 Slurm等。其中,笔者在超算中心、研究所高性能计算集群中接触比较多的就是 PBS 作业管理系统。...为了又想在 Ubuntu 上用 OpenPBS 熟悉的方式,又想安装简单一点,笔者尝试了一种曲线实现的方式——安装 Slurm 和 PBS 工具。...这样一来,表面上我们仍然可以使用 PBS 中常用的脚本文件和相关命令,而实际上管理和执行任务的作业管理系统则是 Slurm。...),或 Slurm,是一个用于 Linux 和 Unix 内核系统的免费、开源的任务调度工具,被世界范围内的超级计算机和计算机群广泛采用。...Ubuntu 上安装   安装 Munge、Slurm 和 PBS 工具,并清理、新建和赋权 slurm 所需文件夹。

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