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沙龙
3
回答
熊猫管道中的分配
、
Gene stable ID Gene name Gene type
miRBase
accession
miRBase
ID "Gene stable ID": "ENSG", "
miRBase
accession": "
浏览 9
提问于2017-06-19
得票数 14
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1
回答
在用R进行数据分析的同时,如何从芯片中选择人miRNA呢?
、
、
、
我对R很陌生,我想从三个组的数据集中分析miRNA表达式。有人能帮帮我吗。提前感谢
浏览 4
提问于2012-02-26
得票数 2
1
回答
尝试使用BLAST在本地重现
mirbase
结果
我正试图在我的电脑上本地复制我使用BLAST在他们的网站上运行
mirbase
得到的东西。“搜索序列”选项是:成熟的miRNA,我已经下载到我的计算机上,并使用以下命令将其作为BLAST数据库:.in /home/marianoavino/Downloads/mature.fa -dbtype 'nucl' -out /home/marianoavino/Downloads/mature然后在
mirbase
在
mirbase
上,在分析结束时,它们
浏览 3
提问于2017-11-20
得票数 0
2
回答
unix模式匹配与捕获
、
、
、
、
我有这样的档案:A1-2362643_1_MIMAT0000732_
MirBase
_miR-378_microRNA_1_21-A1-2362643_1_ENSG00000222328
浏览 0
提问于2014-12-30
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1
回答
如何读取R中的gz文件并将输出转换为合适的数据帧
这是我尝试过的: File_URL <- gzcon(url(paste('ftp://
mirbase
.org/pub/
mirbase
/CURRENT/miRNA.dat.gz'))) DATA_mir
浏览 11
提问于2020-06-25
得票数 0
2
回答
使用bash脚本从在线数据库下载文件
、
、
、
、
我想从一个在线数据库下载一些文件,但它不允许我一次下载所有的文件。相反,它提供下载搜索关键字的文件。因为我有20000多个关键词,这对我来说是不可行的。例如,我想从下载有关miRNA相互作用的全部信息,但它不提供一次下载所有这些信息的选项。我想知道,我如何通过编写一些脚本来下载它。有人能帮我吗?
浏览 6
提问于2014-02-11
得票数 2
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4
回答
删除列1和2中具有相同字符串的行。
、
、
0wheat_tae-miR164 Maize_
miRBase
_zma-miR164awheat_tae-miR444a wheat_tae-miR444a 100.00 21 0wheat_tae-miR164 Maize_
miRBase
_zma-miR164a
浏览 5
提问于2014-11-24
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2
回答
miRNA目标富集
、
、
、
我已经查看了Bioconductor软件包("
mirbase
.db“等),但我找不到一个可以做到这一点的。
浏览 3
提问于2013-12-11
得票数 3
1
回答
处理解析文件中的数据时遇到问题
基本上,它应该从
mirbase
miRNAs中提取计数,这些
mirbase
miRNAs是由mirdeep和未检测到的miRNAs检测到的,而不是stat表和新奇部分。
浏览 2
提问于2010-12-23
得票数 0
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1
回答
Perl将多个网页并行化
、
、
consv",'consv'); $browser->tick("indel",'indel'); $browser->tick('gad','gad'); $browser->tick(
浏览 1
提问于2013-04-25
得票数 0
1
回答
为什么在处理R中的数据后,我得到的是数字而不是名字?
我的数据集的某些部分:3 IRF5 NM_001098630我的代码:new.tars[,1] <- do.call(c,ind.mirs) new.tars[,2] <- rep(tars.hsa.
miRBase
浏览 5
提问于2014-05-12
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1
回答
for循环的更快的处理替代方案
、
、
end_position = c(68L, 122971793L, 34088355L, 148548901L), description = c("", "", "xtr-mir-144 [Source:
miRBase
浏览 7
提问于2022-09-08
得票数 2
1
回答
MySQL中左连接的时间问题
transcript_features_premirna_homology.hit, transcript_features_premirna_homology.evalue, transcript_features_premirna_homology.
mirbase</e
浏览 0
提问于2014-07-04
得票数 0
2
回答
以迭代方式将特定行从CSV文件复制到新文件
我有一个很大的以制表符分隔的csv文件,格式如下: #
mirbase
_acc mirna_name gene_id gene_symbol transcript_id ext_transcript_id
浏览 2
提问于2012-07-21
得票数 3
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1
回答
炼金术onMouseOver不管用
、
、
、
、
我正在使用alchemy.js来显示一个图表。问题是我无法显示图形节点的"onMouseOver“标题。在控制台中有一些错误。这里的产出:在这里,代码:<head></head><div class="alchemy" id="alchemy" styl
浏览 2
提问于2017-07-20
得票数 0
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2
回答
使用Splinter在网站中填充textarea中的表或值列表
、
、
1)browser.find_by_xpath(xpath).click() # select
miRBase
浏览 0
提问于2019-05-30
得票数 0
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2
回答
使用R下载和提取.gz数据文件
、
、
、
我已经尝试通过适应这个来解决我的问题。但是,对于我想要使用的URL或文件,我会得到以下错误。Content type 'application/x-gzip' length 65933953 bytes (62.9 Mb)downloaded 62.9 Mb Error in open.conn
浏览 4
提问于2015-03-11
得票数 8
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1
回答
python和shell for loop组合的外部行为
、
、
ENSG00000273874 homo_sapiens_GRCh84_BC.sorted.miRNA.GTF Mock_24_1 Mock_24_1.fastq mature.fa mature.fa.gz
miRBase
.gff
浏览 1
提问于2016-07-15
得票数 0
1
回答
R中的RNA Seq -如何匹配CSV表和元数据之间的ncol和nrow编号?
、
、
.$
miRBase
build ID : chr NA ..$ Genome : chr
浏览 8
提问于2020-08-25
得票数 0
2
回答
如何在R中计数已处理和未处理
、
我正试图再次学习R,并试图在生物导体气道数据集中计算使用dex“治疗”和“未治疗”的基因总数。()。airway$dex=='trted'而且不起作用。
浏览 4
提问于2021-11-27
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