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Linuxjoin命令介绍

Linux中有关join的命令;join命令作用:将Linux中的两个文本按照一定的规则进行连接。...类似于MySQL中的连接语句 (内连接、左连接、右连接)语法介绍join [选项] 文件1 文件2常用选项包括:-a 文件编号:将文件编号指定的文件中没有匹配的行也输出。...join实战:注意:在Linux中使用join连接首先要对匹配的字段进行排序,否则可能会出现错误内连接 cat 1.txt1 a4 b3 c5 dcat 2.txt1 y9 f5 m// 第一个字段进行内连接...1 1.txt > 3.txtsort -k 1 2.txt > 4.txtcat 3.txt1 a3 c4 b5 dcat 4.txt1 y5 m9 f//左连接 (相当于MySQL中的left join...-v 1 -1 1 -2 1 3.txt 4.txt3 c4 b//未匹配到数据('-v 2'表示输出第2个文件中未匹配到数据)join -v 1 -1 1 -2 1 3.txt 4.txt9 f

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    Linux】学习笔记(十三) Linux 文本处理 tr,col,join,paste

    3. join 命令 内容合并 将两个文件中包含相同内容的那一行合并在一起。...join [option]... file1 file2 常用的选项有: 选项 说明 -t 指定分隔符,默认为空格 -i 忽略大小写的差异 -1 指明第一个文件要用哪个字段来对比,默认对比第一个字段 -...指明第二个文件要用哪个字段来对比,默认对比第一个字段 $ cd /home/shiyanlou # 创建两个文件 $ echo '1 hello' > file1 $ echo '1 shiyanlou' > file2 $ join...file1 file2 # 将/etc/passwd与/etc/shadow两个文件合并,指定以':'作为分隔符 $ sudo join -t':' /etc/passwd /etc/shadow #...将/etc/passwd与/etc/group两个文件合并,指定以':'作为分隔符, 分别比对第4和第3个字段 $ sudo join -t':' -1 4 /etc/passwd -2 3 /etc

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    linux系统使用join命令连接两个文件

    join的连接操作简言之就是将两个具有相同域的纪录给挑选出来,再将这些纪录所有的域放到一行。 注意:join在对两个文件进行连接时,两个文件必须都是按照连接域排好序的,按其他域排序是无效的。...显示第一个文件没有共同域的纪录,-v2显示第二个文件中没有共同域的纪录 -1或-2 -1用来设置文件1连接的域,-2用来设置文件2连接的域 参考实例 将两个文件的具有共同域的纪录连接在一起: [root@linux...B wang:21:women:jiangsu C zhang:22:men:anhui D liu:23:women:Shanghai E chen:23:women:Hefei [root@linux...:22:men:anhui:pingpong D liu:23:women:Shanghai:chess -a1还显示第一个文件中没有共同域的纪录,-a2则显示第二个: [root@linux ~]#...:22:men:anhui:pingpong D liu:23:women:Shanghai:chess E chen:23:women:Hefei [root@linux ~]# join -t:

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    linux split join paste uniq tee sort 工作中文本操作常用方法

    https://blog.csdn.net/haluoluo211/article/details/77800208 本文主要是linux文本常见命令,主要内容如下: split命令将文件按指定行数...;grep -c "" $f;done xaa 10 xab 10 xac 10 xad 2 当然也可以使用awk将文件名按照参数传递统计(google-> awk count file line/ linux.../paste将多个文件按照列合并 ---- paste将文件按照列合并(google->linux merge files by column),例如: #文件file1, file2内容如下 cat...join -1 2 -2 1 wine.txt reviews.txt # 报错如下: #join: wine.txt:3: is not sorted: Red Beaunes France #join...上面很多命令是实践中常用的总结,部分来源与google搜索,以及 http://www.thegeekstuff.com/category/sed/ 这位大神的bolg google -> linux

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    Linux系统入门系列之四:工具命令

    在上一篇文章Linux系统入门系列之三:初识Bash中,我带大家初步认识了Bash这个Linux系统中的Shell,并学习了使用vim编辑、处理文本信息。...使用示例如下: ⑷整合切割命令:join,paste,split 命令join可以将具有相同数据的两个文件整合到一起,命令paste将两个文件的行并列并以tab分隔,命令split可以将大文件根据大小或行数切割成小文件以便于复制...使用规则如下: join -ti12 file1 file2 命令join可以处理文件内容并转换为标准输出,其中-t后面跟分隔符,默认是空格或tab,-i忽略大小写,-1后面跟数字,也即第一个文件以一行的第几个字段为关键字...split可以直接切割文件数据,其中-b后面加要切割成的文件大小,可以直接写字节数或者加k、m单位,-l后面加要切割成的文件行数,sfile为小文件前导名,命令会自动加后缀区分,使用示例如下: 往期Linux...系统入门系列文章: Linux系统入门系列之一 Linux系统入门系列之二 Linux系统入门系列之三:初识BASH

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    如何获得一个 iPhone X 一样炫酷的罗马计数法出生年份

    记数时采用一种特别的乘法组合原则,将十、百、千、万作为单位词,对十以上的数目还多用文并写 古希腊记数法:古希腊最早的数码发现于克里特岛是公元前1500年左右泥板上使用的象形文字记数法,记数靠重复排列...如:II表示十进制数2,ⅩⅩⅩ表示十进制数30 不同的数字并列,右边的小于左边的表示相加。...如:Ⅵ表示十进制数6,LX表示十进制数60 不同的数字并列,左边的小于右边的表示右边的减去左边的 比如1829,记成MDCCCXXIX, 分解下来就是: 千位:M;百位:DCCC;十位:XX;个位:...roman: prev.roman + Array( //拼接字符串 Math.floor(rmdr / num) + 1 ).join

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    统信UOS主创张磊:为什么我们和 openEuler 一拍即

    统信软件有限公司高级副总经理 张磊 1集众人智,国产操作系统 UOS 诞生 2004 年,一群爱好 Linux 操作系统的技术人自发在网上讨论和交流 Linux 相关知识,出于对国内 Linux 发行版功能的不满...虽然在社区运营伊始也听到了诸如“Linux 换皮”、“骗钱”等声音,但整个团队默默把这些声音消化了,以实际行动回答了各种质疑,最终还给社区的是目前唯一在国际 Linux 发行版排行榜中,位于前十的中国团队研发的产品...统信软件成立不久,就遇到了 2019 年底开源的 openEuler,双方一拍即。...,已经与上述两者并列国际前列。...整个社区的开发者数量、代码行数、提交的 PR 数都超出了我们最初的想象,而且目前整个社区的 SIG 组已经有 80 多个,这种 SIG 组的方式非常特别,可以让用户迅速找到感兴趣的组织,并和一群志同道的人共同讨论技术

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    新特性解读 | MySQL 8.0:explain analyze 分析 SQL 执行过程

    WHERE id < 10); *************************** 1. row *************************** -> Nested loop inner join...WHERE id < 10)\G *************************** 1. row *************************** -> Nested loop inner join...阅读顺序 从右到左:没有遇到并列的迭代器之前,都是从右边开始执行; 从上到下:遇到并列的迭代器,都是上边的先开始执行 上述示例阅读顺序如下图(注意最好不要\G输出,否则第一行的缩进不准确),SQL 的执行顺序为...: 使用 Nested loop inner join 算法; t2 先取数据(Index range scan)、筛选(Filter)、物化成临时表(Materialize),作为驱动表; 将驱动表数据带入到...loops 因为这里使用了 Nested loop inner join 算法,按照阅读顺序,t2 是驱动表,先进行查询被物化成临时表;t1 表做为被驱动表,循环查询的次数是 9 次,即 loops=9

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    跟着Nature ecology and evolution学python:vcf文件转换成fasta文件

    abc是一个文件夹,需要在当前目录下存在 这里会遇到报错NameError: name 'dict_run' is not defined 这里的dict_run是使用global定义到函数里的一个变量,linux...系统下就没有这个问题,windows学习通下的python是3.8.3,linux系统下的python版本是3.9.1 遇到的问题二 使用脚本的时候linux系统下不知道为啥用tab键不能补全文件名,...暂时不知道是什么原因 遇到的问题三 脚本里定义了每种基因型对应的碱基序列 image.png 这里非纯的位点定义为M R W这些是为啥,暂时想不明白 这个脚本有局限是,他定义了vcf文件的基因型...ddd.txt','eee.txt'] with Pool(3) as p: p.map(make_new_file,aa) p.close() p.join

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    软件成分析和SBOM的联合防御

    SBOM 管理的作用:增强透明度 SBOM 管理提供了应用程序中每个软件组件的详细清单,包括开源和专有元素,并列出了所有软件包、库和 依赖项,从而提供前所未有的透明度了解软件的构成。...规性和风险评估: 它支持严格遵守法规和标准,极大地简化了 全面风险评估 和确保法规规的过程。...SBOM 管理不仅增强了软件系统的透明度和安全性,还确保了组织能够维持高标准的规性。...简化合规性:SBOM 提供了监管规所需的必要文档,而 SCA 支持风险管理,共同促进了更简单的规流程。...这种双重策略不仅有助于识别和解决风险,还确保了规性和许可的全面文档。 SCA 和 SBOM 管理的协作使开发团队能够交付安全、规且强大的软件,防止潜在漏洞,并确保实现最高的安全标准。

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    凭IF吃烧烤打折,学Chris生信教程也打折~“没有什么是IF不能解决的,如果有,那就发高点!”

    特别说明,如果是并列第一的要除以并列的人数。比如2个并列,每人那么就打(10-IF)%/2。特别提示,只奖励第一或者并列第一作者,通讯不奖励。因为通讯得到的奖励太多了。这里是个真正做实验的人的福利。...课程目录: 1、Linux命令与服务器将不是学习生信的障碍——如何建立适合转录组分析的便宜云服务器。 2、如何高速下载SRA数据(RNA-seq原始数据)。 3、这些数据能用吗?...5、相关Linux批量处理数据命令介绍。 6、DEseq2统计分析差异基因。 7、测序数据怎样进行GSEA分析。 8、热图与火山图,GO与KEGG的可视化。

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