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我试图在Makefile中使用qsub -N "compile-$*"，但它给出了以下错误，因为在本例中，$*等于"compile-obj/linux/flow“。我使用的整个命令是：-
qsub -P bnormal -N "compile-obj/linux/flow" -cw
浏览 11提问于2012-07-06得票数 0
在slurm中，我通常在顶部指示编译器的路径。我在qsub上试过，但没成功。知道怎么让它工作吗？test_qsub.py$ cat test_qsub.py.e381299
/homes/miranda9/.profile: line 2: /opt/intel/compilers_and_libraries_2017/linux/mpi/intel64/bin/mpivars.s
浏览 10提问于2020-09-14得票数 0
我有一个python程序，它在conda环境中运行，安装在集群的特定节点中。我想把它提交给qsub，但只是需要帮助。我的剧本是：我已经试过了：
ssh **节点**‘导出SGE_ROOT=/usr/local/ run /ge2011.11；/usr/local/run/ge2011.11/bin/linux-x64/qsub script.sh’，但表示无法运行作业:拒绝:主机“*
浏览 0提问于2020-12-12得票数 0
9回答
我有一个批处理脚本，它从几个qsub作业开始，当它们都完成时，我想捕捉它们。
我不想使用-sync选项，因为我希望它们同时运行。每个作业都有一组不同的命令行参数。可以使用巴什陷阱，但我将如何与qsub？
浏览 8提问于2012-07-17得票数 41
如果我使用：putty -load session_name在机器中打开一个外壳程序，然后执行一个命令将一个作业添加到linux系统(qsub -cwd -b hostname)上的网格队列中，一切都会正常工作但是，如果我将命令添加到文本文件中，然后执行putty -load session_name -m file.txt，则会得到qsub: command not found
如果我后退并将文本文件简化为仅为命令我是linux系统的新手，这似乎是一个简单的修复方法，
浏览 0提问于2013-10-29得票数 0
2回答
在程序中，我从参数向量(**argv)读取变量，然后使用这个变量修改输出文件的名称，如*_0、*_1、*_2、.、*_n。##$ -S /bin/bashfor((i=0; i < 2; i++)); do qsub test_S17_script.sh $i/daedalus_linux_1.3_64 1 "$1"
因此，派生操作很好，并生成文件。而且，脚本可以很好地
浏览 12提问于2013-08-25得票数 0
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在Linux中，我很难从父目录提交作业。假设在我的父目录中，有1000个名为1、2、3……、1000的子目录，其中所有子目录都有一个提交脚本submit.sh。我需要对父目录中的所有脚本执行qsub操作，这样所有的计算和输出都会被转储到相应的子目录中，而不是分别访问每个子目录和qsub，这当然会花费我大量的时间。有没有办法做到这一点？
我非常感谢你的帮助。
浏览 2提问于2016-03-07得票数 0
1回答
test10
我正在使用multiple-nodes.sh运行qsub，其中我正在执行10个文件，以便它们在CPU上的不同节点(和核心)上运行。要花几个小时才能完成。然而，在multiple-nodes.sh完成执行之后，我没有看到它出现在qstat中，但当我在linux中检查top进程时，我仍然看到R脚本正在运行(command1...etc)。我认为这可能是因为linux (或者它是并行的)只有在脚本执行完成之后才会写入文件。但是这看起来真的很慢，因为从执行开始到现在已经有15个小时了，这个过程已经在
浏览 3提问于2015-08-20得票数 1
我们知道所有的节点特性都存储在server_priv/ the文件中。每次我们使用：或提交作业，因为我们可能有数百台具有linux特性的机器。我想知道扭矩如何选择正确的节点？
浏览 5提问于2015-04-13得票数 1
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1回答
我有一个shell脚本，它有一个qsub命令，后面跟着其他依赖于qsub命令输出的命令。我有一个shell脚本，它看起来像cat <some_files>我希望在脚本转到cat命令之前，qsub完成运行。我把"wait“放在qsub后面，但没有起作用。
浏览 1提问于2015-10-31得票数 1
3回答
我有一个程序通常在Linux中的conda环境中运行，因为我使用它来管理我的库，下面是说明：python hello_world.py# script.sh如何使用我的anaconda环境使用qsub运行hello_world.py？
浏览 2提问于2018-11-16得票数 7
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1回答
试图让qsub在我的集群上工作(现在是单个节点，但更多的节点正在到来)，到目前为止，尝试提交qsub的尝试正在返回。gridengine.org上的一些帖子，建议：从现在起，这似乎已经取得了进展，qsub说：但它永远悬而
浏览 0提问于2016-03-08得票数 1
2回答
in 3UTR 5UTR coding_genic genic non_synonymous reg synonymous for i in 1 2 3 qsub目标是运行"qsub“命令(将作业提交到集群计算机)，其中"compute.job”中的“compute.job”变量被替换为1、2或3，"VAR2“变量替换为由p表示的字符串之一。这个部分工作得很好： do
q
浏览 2提问于2014-02-17得票数 0
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1回答
Querydsl加入条件
、、、
QSub any = exp.sub.any(); any.selected.isTrue().and(any.sub.person.id.eq(user.getId
浏览 0提问于2018-05-18得票数 0
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4回答
我希望使用Unix命令(如sed或awk )将字符串"#DONE"附加到文本文件中未包含字符串"#DONE"的第一行末尾。例如，输入文件将类似于qsub job2.sh #DONEqsub job4.sh qsub job1.sh #DONEqsub job2.sh #DONEq
浏览 2提问于2017-12-11得票数 1
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我刚试过这个命令：并收到此错误：
我正在一个计算集群上运行这个程序，该集群通常可以很好地实现qsub .csh文件。
浏览 5提问于2012-12-11得票数 2
我一直在用在Sun GridEngine集群上提交任务，但现在发现自己使用的是命名不那么方便的数据集(也是超大型的)。我可以把所有的东西都预处理成json，但是如果有办法只处理qsub -all_contents_of_directory，那将是最理想的。
我是索尔吗？我是不是应该直接转到有问题的目录，找到。-exec 'qsub setupscript.sh {}'？
浏览 0提问于2011-09-02得票数 1
3回答
在任务完成之前创建qsub块吗？
、、、、
shell()函数执行当前工作目录中的命令，阻塞直到该命令运行完毕，并返回该命令发送到标准输出的数据。这在单台多核机器上运行良好。我想修改驱动程序以将qsub作业提交给大型计算集群，以获得更多的并行性。
有没有办法让qsub命令将其结果输出到标准输出中，而不是输出到文件和块中，直到作业完成？
浏览 2提问于2011-05-13得票数 7
"Linux服务器“for i in *.sh; do echo "bash $i ZMV" | qsub -N ZMV -t 1-7 -cwd -l h_vmem=2G; done在“正常”情况下(没有-t)，我使用-hold_jid，但在这种情况下，我不知道该怎么办。
浏览 1提问于2018-03-09得票数 0
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