我的需求是： 我有10个基因组，然后又12个转录组数据，然后将这个12个基因组数据分别比对到这个10个基因组，每个基因组得到12个bam文件，然后将每个基因组的12个bam文件合并 ，最终得到10个合并的...bam文件 前面比对的步骤没有遇到问题 SAMPLES, = glob_wildcards("../.....""" samtools merge -@ {threads} {output} {input.bams} """ 这样写的问题是合并的时候每个基因组对应的是...120个bam文件 然后换成下面的写法 rule samtools_merge: input: bams = expand(rules.samtools_sort.output.bam...、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记！
/etc/group 文件 与用户账户类似，组的信息也保存在系统的一个文件中，在/etc/group文件中包含了系统上用到的每个组的信息。如下： ?...组名 组密码 GID 组成员 wheel组 在Linux中wheel就是类似于一个管理员的组。通常在Linux下即使我们有了管理员，也不推荐用root用户登录。...指定用户除登录组之外所属的一个或多个附加组 -k 必须和-m一起使用，将/etc/skel目录的内容复制到用户的HOME目录 -m...一个用户可以隶属于多个附加组。但是一个用户只能有一个基本组。 理解文件权限 除了用户有权限之外，文件也是有权限的！ls 命令可以用来查看Linux系统上文件、目录和设备的权限 如: ls -l ?...，给的权限就会越大 Linux 文件系统 Linux在路径名中不使用驱动器盘符。
场景：例如给多个日志文件设置为""，给多个文件设置内容，echo 内容|tee 目录+文件，rm -rf 日志文件要重启，置空比较好，怎么要这么多字，140个，难受啊大家别慌，等我凑字，哈哈哈怎么要这么多
Linux系统中的用户是分角色的，用户的角色是由UID和GID来识别的（也就是说系统识别的是用户的UID、GID，而非用户用户名），有个UID是唯一的（系统中唯一如同身份证一样）用来标识系统的用户账号（...用户名） 1、 系统管理员root的UDI/GID都为0 2、 普通用户（管理员添加），默认它的UID\GID是从500--65535，权限很小，只能操作自己的家目录中文件及子目录（注：nobady
文章目录 概述 通常写法 快捷写法 概述 在学习 Linux 的过程中，对于新手而言总是会使用几个命令来完成一个简单的任务。对正在熟悉使用终端的人这是很容易理解的行为。...在本篇中，我们会用一个简单的方法在 Linux 中用一个命令来将目录复制到多个文件夹中。...---- 通常写法 在 Linux 中，cp 命令常被用于从一个文件夹中复制文件到另一个文件夹中，最简单的语法如下： # cp [options….] source(s) destination 看下下面的命令...，通常你会使用两个不同的命令来将相同的文件复制到不同的文件夹中： # cp -v /home/xgj/bin/sys_info.sh /home/xgj/test # cp -v /home/xgj/bin.../sys_info.sh /home/xgj/tmp 快捷写法 假设你想要复制一个特定文件到 5 个或者更多的文件夹中，这意味着你需要输入 5 次或者更多的cp命令么？
MultiTail是一个开源的ncurses的实用工具，可用于在一个窗口或单一外壳，显示实时一样的尾巴命令，该命令拆分控制台为更多子窗口的日志文件的最后几行（很像显示多个日志文件到标准输出屏幕命令 ）。...他和tail的区别就是他会在控制台中打开多个窗口，这样可以同时监控多个日志。...安装命令 > sudo apt install multitail Centos安装 > yum install multitail -y 上下展示 监控两个日志文件，窗口上下 > multitail...-s 2 /var/log/nginx/access.log /var/log/nginx/error.log 进入 multitail 之后，有一些交互式命令 h 来打开帮助 使用 b 来选择打开的文件...，使用上下键选择文件，一旦选择文件 multitail 会显示文件最后 100 行，使用 jk 移动光标，或者 gg/G 来快速移动到文件顶部或者最后，q 退出 a 用来添加另外的监控日志文件
MultiTail是一个开源的ncurses的实用工具，可用于在一个窗口或单一外壳，显示实时一样的尾巴命令，该命令拆分控制台为更多子窗口的日志文件的最后几行（很像显示多个日志文件到标准输出屏幕命令 ）。...他和tail的区别就是他会在控制台中打开多个窗口，这样可以同时监控多个日志。...安装命令 > sudo apt install multitail Centos安装 > yum install multitail -y 上下展示 监控两个日志文件，窗口上下 > multitail...s 2 /var/log/nginx/access.log /var/log/nginx/error.log 进入 multitail 之后，有一些交互式命令 h 来打开帮助 使用 b 来选择打开的文件...，使用上下键选择文件，一旦选择文件 multitail 会显示文件最后 100 行，使用 jk 移动光标，或者 gg/G 来快速移动到文件顶部或者最后，q 退出 a 用来添加另外的监控日志文件
MultiTail是一个开源的ncurses的实用工具，可用于在一个窗口或单一外壳，显示实时一样的尾巴命令，该命令拆分控制台为更多子窗口的日志文件的最后几行（很像显示多个日志文件到标准输出屏幕命令 ）。...他和tail的区别就是他会在控制台中打开多个窗口，这样可以同时监控多个日志。...安装命令 > sudo apt install multitail Centos安装 > yum install multitail -y 上下展示 监控两个日志文件，窗口上下 > multitail...，使用上下键选择文件，一旦选择文件 multitail 会显示文件最后 100 行，使用 jk 移动光标，或者 gg/G 来快速移动到文件顶部或者最后，q 退出 a 用来添加另外的监控日志文件 原文链接...:https://rumenz.com/rumenbiji/linux-multitail.html
打开多个文件： 1.vim还没有启动的时候： 在终端里输入 vim file1 file2 ... filen便可以打开所有想要打开的文件 2.vim已经启动 输入 :open file...2. vim +n 文档名 打开文档后，定位第n行 3. vim ，进入vim界面之后使用命令 :e 文档名 打开文档，此方式可以在编辑一个文档的同时打开另外一个文档 同时显示多个文件...—上一个文件 对于用(v)split在多个窗格中打开的文件，这种方法只会在当前窗格中切换不同的文件。...注意，该方法只能用于同时打开多个文档。 :e 文档名 这是在进入vim后，不离开 vim 的情形下打开其他文档。...(file) 多文件切换 通过vim打开多个文件（可以通过ctags或者cscope） ":ls"查看当前打开的buffer（文件） ":b num"切换文件（其中num为buffer list中的编号
用户组 在linux中的每个用户必须属于一个组，不能独立于组外。...在linux中每个文件有所有者、所在组、其它组的概念 所有者 所在组 其它组 改变用户所在的组 所有者 一般为文件的创建者，谁创建了该文件，就天然的成为该文件的所有者 用ls ‐ahl命令可以看到文件的所有者...也可以使用chown 用户名 文件名来修改文件的所有者 文件所在组 当某个用户创建了一个文件后，这个文件的所在组就是该用户所在的组 用ls ‐ahl命令可以看到文件的所有组 也可以使用chgrp 组名...【参考】 groupadd 组名，在linux中添加组 vi /etc/group，查看linux中所有组信息，可以看可以编辑 cat /etc/group，查看linux中所有组信息，只可以看不可以编辑...useradd ‐g 组名 用户名，创建用户的同时指定将该用户分配到哪个组下 vi /etc/passwd，查看linux中所有用户信息，可以看可以编辑 cat /etc/passwd，查看linux
ls |xargs -i tar zcvf {}.tar.gz {} 比如，现在我要将某个目录下的所有文件全部分别压缩，注意是分别压缩。...例： a/ 目录下有三个文件 1.txt ，2.txt ，3.txt 要达到的效果是批量压缩为： 1.txt.tar.gz 2.txt.tar.gz 3.txt.tar.gz 示例： root@
在Linux中，我们可以从命令行或桌面文件管理器创建一个新文件。 对于定期使用Linux的任何人来说，知道如何创建新文件都是一项重要技能。...在本教程中，我们将向您展示使用命令行在Linux中快速创建新文件的各种方法。 在你开始之前 要创建一个新文件，您需要对父目录具有写权限。否则，您将收到一个权限被拒绝的错误。...要一次创建多个文件，请指定文件名，并用空格分隔： touch file1.txt file2.txt file3.txt Copy 使用重定向运算符创建文件 重定向允许您捕获命令的输出，并将其作为输入发送到另一个命令或文件...要创建一个空的零长度文件，只需在重定向操作符之前指定要创建的文件名即可： > file1.txt Copy 这是在Linux中创建新文件的最短命令。...以下命令将创建一个名为1G.test1GB 的新文件： fallocate -l 1G 1G.test Copy 结论 在本教程中，您学习了如何使用各种命令和重定向从命令行在Linux中创建新文件。
Linux系统文件属性之用户、组、权限 Linux系统中的用户是分角色的，用户的角色是由UID和GID来识别的（也就是说系统是识别的是用户的UID、GID，而非用户用户名），一个UID是唯一（系统中唯一如同身份证一样...文件的用户与用户组 1、超级管理员的UID=0,GID=0，也可以这么说系统只要是识别出某个用户的UID\GID都为0时，那么这个用户系统就认为是超级管理员 2、普通用户（管理员添加的），默认它的UID...rw-------. 1 root root 1660 Aug 7 18:01 anaconda-ks.cfg 这个 rw------- 就表示这个文件的权限信息，三位为一组，分别是用户权限（文件所有者...）、所属组权限、其它用户的权限 一：普通文件的权限 1、r 读取文件内容 2、w新增、修改文件内容，但删除的权限是受父目录的权限控制的，与文件本身权限无关 ?...由此可以看出并不是具有对文件的写权限就可以删除文件 3、x执行权限（文件本身要可执行且普通用户要有文件的读权限，root用户不需要读权限也可以执行)，可执行文件：*.sh/*.py/*.perl等 ?
文件 asciiReplaceScriptSimple.sh 替换结束,耗时:0s 文件 asciiTest1.log 替换开始.......文件 asciiTest1.log 替换结束,耗时:0s 文件 asciiTest2.log 替换开始.......文件 asciiTest2.log 替换结束,耗时:0s 文件 asciiTest.log 替换开始.......文件 asciiTest.log 替换结束,耗时:0s 文件 xiaoxu.sh 替换开始.......文件 xiaoxu.sh 替换结束,耗时:0s 全部文件转换结束...... 脚本总耗时:0s 开始单个文件替换脚本 #!
自制Linux首先得满足一定的条件，除了物理主机的配置外，我们还需要准备一块干净的磁盘。...:3 0 27.8G 0 part / sdb 8:16 0 10G 0 disk sr0 11:0 1 1024M 0 rom 这里的sdb即用于自制目标Linux.../dev/sdb2 66 917 6843690 83 Linux Command (m for help): w The partition...[root@Centos6 ~]# mkfs.ext4 /dev/sdb2 mke2fs 1.41.12 (17-May-2010) Filesystem label= OS type: Linux Block...不出意外，你应该能看到和笔者一样的界面，这也意味着你制作好了属于自己的Linux系统。 ? ? 6. 怎么样，是不是很开心(～￣▽￣)～ ----
本文将介绍Linux系统中用户、用户组及文件权限的常用知识。...默认情况下，用户自己创建的文件对应的拥有者就是用户本身。 所属群组【group】 文件和文件目录的所有者所在的用户组。同一个用户可以加入多个用户组，同一个用户组可以拥有多个用户。...其他人【other】 不属于拥有者、所属群组的第三方人员。...第3栏：拥有者，显示出拥有者的账号 第4栏：用户组，显示出拥有者加入的用户组的名称，在Linux系统中同1个账号可以加入1个或多个用户组中。...实例分析 假设用户test1、test2隶属于用户组group1，用户test3隶属于用户组group3，有3个文件或目录，权限设置如下 -rw-r--r-- 1 test1 group1
使用命令为chown和chgrp 更改文件所属用户 chown -R 用户名 文件夹名 chown 用户名 文件名 改文件所属用户组 chgrp -R 用户名 文件夹名 chgrp 用户名 文件名
以centos为例 Passwd文件存储当前系统所有用户，而组文件/etc/group记录 一个用户可以属于多个组，查看用户所属的组，gourps + 用户名 更改文件拥有者 (chown ) [root...@linux ~]# chown 账号名称 文件或目录 改变文件的用户组用命令 chgrp [root@linux ~]# chgrp 组名 文件或目录 此外还可以通过chown命令 同时修改用户和组...， chown 所有者，所属组 文件\目录名 覆盖目录权限 对于目录权限修改之后，默认只是修改当前级别的权限。...如果子目录也要递归需要加R参数 Chown -R : 进行递归,连同子目录下的所有文件、目录
在正常调用过程中，难免需要对多个文件夹下的多个文件进行读取，然而之前只是明确了spark具备读取多个文件的能力。...针对多个文件夹下的多个文件，以前的做法是先进行文件夹的遍历，然后再进行各个文件夹目录的读取。 今天在做测试的时候，居然发现spark原生就支持这样的能力。 原理也非常简单，就是textFile功能。...编写这样的代码，读取上次输出的多个结果，由于RDD保存结果都是保存为一个文件夹。而多个相关联RDD的结果就是多个文件夹。... val alldata = sc.textFile("data/Flag/*/part-*") println(alldata.count()) 经过测试，可以实现对多个相关联
linux下修改文件所属用户组和修改文件权限的方法 修改文件所属用户组的命令是chown，这个命令的格式是 chown [-R] username filename chown [...-R] username:group filename 第一个是修改文件所属的的用户，第二个修改文件所属用户组,-R属性为可选属性，意思是递归修改，也就是把文件下所有文件，包括子目录一起修改，...2.修改文件权限的命令是chmod，这个命令的格式是有两种设置方法有数字法与文字法i，数字法 就是用数字来代替rwx，r、w、x分别对应4、2、1，这个命令的格式为 chmod [-R] xyz...如想设置.bashrc文件的权限为owner为rwx，group权限为无，others权限为无，则命令如下 chmod 700 .bashrc
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