首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

grepl和group_by使用dplyr在R中进行总结

在 R 中,dplyr 包提供了强大的数据操作功能,其中 greplgroup_by 是常用的操作。grepl 用于在字符串中进行模式匹配,而 group_by 用于对数据进行分组,以便后续的汇总操作。

以下是如何使用 greplgroup_by 结合 dplyr 包来进行数据总结的详细示例。

安装和加载 dplyr

首先,确保你已经安装并加载了 dplyr 包:

代码语言:javascript
复制
install.packages("dplyr")
library(dplyr)

示例数据集

我们将使用内置的 mtcars 数据集进行示例。假设我们想要根据汽车型号(car names)中是否包含特定模式来分组,并对每组进行总结。

代码语言:javascript
复制
# 加载数据集
data("mtcars")

# 添加汽车型号作为一列
mtcars$car <- rownames(mtcars)

使用 grepl 进行模式匹配

假设我们想要根据汽车型号中是否包含 "Merc" 进行分组,并计算每组的平均马力(hp)。

使用 greplmutate 添加匹配列

首先,我们使用 greplmutate 添加一个新的列,指示汽车型号中是否包含 "Merc"。

代码语言:javascript
复制
mtcars <- mtcars %>%
  mutate(is_merc = grepl("Merc", car))

使用 group_bysummarize 进行分组和总结

接下来,我们使用 group_bysummarize 对数据进行分组,并计算每组的平均马力。

代码语言:javascript
复制
summary <- mtcars %>%
  group_by(is_merc) %>%
  summarize(
    avg_hp = mean(hp, na.rm = TRUE),
    count = n()
  )

完整示例代码

以下是完整的示例代码:

代码语言:javascript
复制
# 加载 dplyr 包
library(dplyr)

# 加载数据集
data("mtcars")

# 添加汽车型号作为一列
mtcars$car <- rownames(mtcars)

# 使用 grepl 和 mutate 添加匹配列
mtcars <- mtcars %>%
  mutate(is_merc = grepl("Merc", car))

# 使用 group_by 和 summarize 进行分组和总结
summary <- mtcars %>%
  group_by(is_merc) %>%
  summarize(
    avg_hp = mean(hp, na.rm = TRUE),
    count = n()
  )

# 打印总结结果
print(summary)

结果解释

运行上述代码后,你将得到一个数据框 summary,其中包含两列:

  • is_merc:指示汽车型号中是否包含 "Merc"(TRUEFALSE)。
  • avg_hp:每组的平均马力。
  • count:每组的汽车数量。

例如,结果可能如下所示:

代码语言:javascript
复制
# A tibble: 2 × 3
  is_merc avg_hp count
  <lgl>    <dbl> <int>
1 FALSE     146.    29
2 TRUE      123.     3

这表示在 mtcars 数据集中,包含 "Merc" 的汽车的平均马力为 123,而不包含 "Merc" 的汽车的平均马力为 146。

总结

通过结合使用 greplgroup_by,你可以在 dplyr 中轻松地对数据进行模式匹配、分组和总结。这种方法非常适用于需要根据字符串模式进行分组和汇总的场景。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

GMSB文章九:微生物的相关关系组间波动

secom_linear 函数可以评估不同分组(例如,健康组与疾病组)微生物分类群之间的线性相关性,帮助研究者理解不同分类群如何相互作用以及它们不同状态下的相互关系。...不同分组之间,微生物分类群的相互关系表现出显著的波动性。这种波动性反映了微生物群落结构不同环境或条件下的动态变化,是评估微生物群落稳定性功能多样性的关键指标。...通过定量分析这些波动,研究者可以深入理解微生物群落如何响应外部扰动,以及它们不同生态位的作用相互依赖性。...,用于微生物组数据中进行线性相关性的稀疏估计。...Nonlinear correlationssecom_linear 函数是 ANCOMBC 包的一个函数,用于微生物组数据中进行线性相关性的稀疏估计。

9110
  • R语言】dplyr对数据分组取各组前几行

    所以画图的时候,也需要区分这三类。下面这张表就是GO富集分析得到的结果,我们可以根据ONTOLOGY这一列来分组,就可以得到BP,CCMF三个组。...("dplyr") #加载dplyr包 library(dplyr) 我们先来看看直接head的效果 #直接head,结果不对 GO_result %>% group_by(ONTOLOGY) %>...% head(n = 5) 虽然,我们使用group_by进行了分组,但是head并没有应用到三个分组上面,而是直接应用到了整个数据框上,事与愿违。...,三类都有 方法二、使用top_n #使用top_n r2=GO_result %>% group_by(ONTOLOGY) %>% top_n(n=-5,wt=p.adjust) r2 这里可以使用...方法三、使用slice_head #使用slice_head r3=GO_result %>% group_by(ONTOLOGY) %>% slice_head(n=5) r3 方法四、使用slice_min

    1.8K21

    懒癌必备-dplyrdata.table让你的数据分析事半功倍

    接下来,我就为大家分享几个我工作当中最常用来做数据分析用到的包,dplyrdata.table,我保证你get到这两个包后,就再也不想用R里面自带的基础包函数进行数据分析了!!...(贼笑中) dplyrR语言中最为重要的包(之一)! 它可以让数据分析功能更加强大,代码更加简洁。你可以随心所欲的操作它,使用它获取你想要的数据,而且它的语法非常简单,非常直白。...找到合适的packages并学习使用它,绝对会让我们数据分析工作事半功倍! 我们有没有发现dylyr包函数使用的一些规律? 有的!...以上这段代码我们使用group_bysummarise的结合实现了对数据集分组分析,并进行统计量计算的一个功能。...作为课代表的我来帮大家简单的总结一下: 我们都知道R有个令人诟病的缺点就是跑起来耗内存,data.table相对于dplyr 更快、更节省内存了!

    2.4K70

    生信代码:数据处理( tidyverse包)

    大家在学习R语言的时候,大多参考《R语言实战》这本书,但这本书年代过于久远(中文第二版是2016年),主要着力点也是R base上,R语言可视化的ggplot2包也只是简要介绍,而对于tidyverse...Rstudio中加载tidyverse包,可以看到该包下有8个子包,著名的ggplot2包即是其中的一个子集,我们先着重讲一下数据处理有关的包——dplyr包。...)——汇总数据 而这些函数都可以与group_by结合,分组对原数据框进行处理。...,需要保存下来 5 arrange() R base包涉及到排序的包括 sort(),rank(),order(),而在dplyr与排序相关的是arrange()包,默认是从高到低进行排序,如果变换排序顺序则可以使用...,再对score进行排序 6 group_by() group_by可以对原数据框进行分组计算,例如对于我们本文中的数据框,我们如果对个人或者科目感兴趣的话,可以使用group_by(name或者type

    2K10

    Linux 如何使用 HAProxy、Nginx Keepalived 进行负载均衡?

    现代网络应用,负载均衡是提高性能可靠性的关键因素之一。通过将请求分发到多个服务器上,负载均衡可以确保请求被合理地处理,并避免单点故障。... Linux 环境下,常用的负载均衡解决方案包括 HAProxy、Nginx Keepalived。本文将详细介绍如何使用这三个工具 Linux 实现负载均衡。1....结论使用 HAProxy、Nginx Keepalived 可以 Linux 环境实现高效的负载均衡解决方案。...本文中,我们详细介绍了 Linux 中使用 HAProxy、Nginx Keepalived 进行负载均衡的步骤配置。...在实践,要密切监控负载均衡器后端服务器的性能指标,定期进行性能调优监控,以保持系统的稳定高效运行。同时,确保服务器和服务的安全配置,以防止潜在的安全威胁。

    2.1K00

    🤩 hdWGCNA | 单细胞数据怎么做WGCNA呢!?(三)(pseudobulk data)

    如果说你的数据量非常大,如果还用之前的方法,运行起来会非常慢,这个时候如果使用pseudobulk的话,就会显著加速啦。⏩ 当然啦,优点远不止这些,后面再慢慢介绍吧。...hdWGCNA(Optional) 如果你只想对其中一种细胞进行WGCNA,那就运行下面的代码,标注一下你要的细胞就行了。...astrocytes # cur_group <- 'ASC' # # # subset the matrix for just this cell type # cur_cpm <- cpm[grepl...并可视化 接下来,我们单细胞水平上计算模块特征基因(ME)基于特征基因的连通性(kMEs)。...::group_by(module) %>% dplyr::summarise(UMAP1 = mean(UMAP1), UMAP2 = mean(UMAP2)) p <- p + geom_label

    27200

    Day6-学习笔记(2024年2月3日)

    学习RR包是多个函数的集合,具有详细的说明示例,学习生信R语言必学的原因是丰富的图表biocductor的各种生信分析R包,包的使用是一通百通的,以dplyr为例,讲解一下R包一、安装和加载R包1...3.加载R包library()require(),两个函数均可。使用一个包,是需要先安装再加载,才能使用包里的函数。...")library(dplyr)示例数据直接使用内置数据集iris的简化版:test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]二、dplyr五个基础函数1.mutate(),新增列mutate...,结合group_by使用实用性强)summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))#计算Sepal.Length的平均值标准差先按照Species...分组,计算每组Sepal.Length的平均值标准差group_by(test, Species)summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length

    16610

    R语言】三种批量做T检验的方法

    小编也给大家总结过一些统计学相关的知识 ☞统计学数据分析方法汇总! ☞统计学知识大梳理 ☞100个统计学 & R语言学习资源网站 R语言里面也有专门做t检验的函数,t.test。...plyrreshape2 #如果没有安装plyrreshape2这两个R包,先去掉下面两行的#,运行进行安装 #BiocManager::install("plyr") #BiocManager::...for循环得到的结果是一致的 方法三、使用rstatixreshape2 #如果没有安装dplyr,rstatixreshape2这三个R包,先去掉下面三行的#,运行进行安装 #BiocManager...reshape2这三个R包 library(dplyr) library(rstatix) library(reshape2) result=melt(m6a_expr_type) %>% group_by...,计算原始p值的同时,我们还能计算校正之后的p值 #使用fdr方法对原始p值进行校正 result=melt(m6a_expr_type) %>% group_by(variable) %>%

    1.7K51

    dplyr-cli:Linux Terminal上直接执行dplyr

    熟悉R的朋友都会知道, dplyr包是对原始的数据集进行清洗、整理以及变换的有力武器之一。但是其使用会局限于你需要有打开R/R studio或者通过R脚本来执行 dplyr。...dplyr-cli设计的初衷就是让我们能够方便快速的不打开R的情况下,命令行运行 dplyr,处理csv的文件。...使用 {littler}终端的CSV文件上运行dplyr命令。...尽管R可以批处理模式下使用,但r二进制文件完全支持'shebang'样式的脚本(即在脚本的第一行中使用hash-mark-exclamation-path表达式)以及标准Unix管道。...目前的不足: 仅在 OSX YMMV的bash下测试过 每个命令的实质是单独的R运行 安装 虽然 dply-cli是可以直接在命令行中直接使用,但是其执行时候还是会依赖到R包。

    2.1K10

    R||R语言基础(三)_R

    今天继续学习R语言基础的R使用,以R包:dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”)...:102),] 这里的“,”怎么理解呢,我们上一期推文中提到,提取元素时z[x,y]指代提取z第x行,第y列,如果我们只需要提取行,则应该写作z[x,],同理,如果只需要提取列,应该写作z[,y]...group_by(test, Species) #按照Species分组 # 先按照Species分组,计算每组Sepal.Length的平均值标准差 summarise(group_by(...其核心包有ggplot、readr、tibble、purrr、 tidyr 、dplyr、ggplot、forcats stringr8个. 我们这里用的是dplyr包,因此可以使用管道。...经过这几期的R语言基础,你应该能够入门R了,渐渐的也要自己去学会看帮助文档,去搜报错,还记得怎么搜命令R包的帮助文档吗? ?

    3.4K50

    从头学R语言——DAY 3

    ("stringr")BiocManager::install("limma")加载R包library()或require()都可以library(limma)dplyrdplyr作为tidyverse...因为用ggplot等进行可视化,必须要求数据格式完全符合要求,但这种情况极其罕见,所以我们需要dplyr来转换数据。...此处先掌握dplyr的5个基本函数:mutate(),select(),filter(),arrange(),summaries();1个重要的管道工具%>%#用dplyr进行数据转换#5个核心函数test...的平均值标准差group_by(test, Species)summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)...= test2, by = 'x')列名下3或4个字母的缩写,是变量的类型:int:整数型变量dbl:双精度浮点数型变量,即实数chr:字符串dttm:日期+时间型变量lgl:逻辑型变量fct:因子,R具有固定数目的值的分类变量

    8410

    生信星球Day4 学习R

    今日学习内容:如何安装R包?...认识dplyr,函数、功能等---安装和加载R包镜像设置方法一:手动设置,Tools→Packages→Primary CRAN repository方法二:自动运行教程来自:https://www.jianshu.com.../p/861224f4251aoptions() 设置R运行过程的一些选项设置options()$repos 查看使用install.packages安装时的默认镜像options()$BioC_mirror...查看使用bioconductor的默认镜像R最重要的两个配置文件: 一是.Renviron,能够设置R的环境变量; 二是.Rprofile,如果启动时找到这个文件,那么就替我们先运行一遍(这个过程就是启动...() 按某1列或某几列对整个表格进行排序,默认从小到大,用desc()可从大到小summarise() 汇总,配合group_by()分组,可以mean()求平均值,sd()求标准差test <-

    20440

    DAY6-学习R

    安装和加载R包镜像设置使用R配置文件使用file.edit()编辑文件——输入file.edit('~/.Rprofile') options("repos" =c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn...加载 libraryrequire 使用一个R包需先安装再加载 library(dplyrdplyr五个基础函数mutate(),新增列——mutate(test, new = Sepal.Length...test的第一列第五列select(test,Sepal.Length)#筛选test名为Sepal.Length的一列按列名筛选select(test, Petal.Length, Petal.Width...)选择字符向量的列,select不能直接使用字符向量筛选,需要使用one_of函数vars <- c("Petal.Length", "Petal.Width")select(test, one_of...unique值count(test,Species)dplyr处理关系数据(将2个表进行连接)內连inner_join,取交集——inner_join(test1, test2, by = "x")左连

    23130
    领券