ggplot2 scale_x_discrete会导致x轴消失吗？ - 腾讯云开发者社区

文章/答案/技术大牛

发布

这个方法无需旋转就可使得横轴坐标不重叠！

坐标轴重叠是常见的绘图问题，常规的解决方式是增加图形的宽度、降低字体大小、坐标轴文字旋转。还有 2 个新的方式，自动错位排列和隐藏重叠坐标轴。...library(ggplot2) df <- data.frame(Gene=paste0("Gene_",1:9), TPM=1:9) ggplot(data=df, aes(x=Gene, y=...# 2行交替 ggplot(data=df, aes(x=Gene, y=TPM))+ geom_col() + scale_x_discrete(guide = guide_axis(n.dodge...(n.dodge=3)) 隐藏重叠的坐标轴标记 ggplot(data=df, aes(x=Gene, y=TPM))+ geom_col() + scale_x_discrete(guide...= guide_axis(check.overlap = T)) 旋转角度这个方法的好处是会自动寻找合适的hjust和vjust值，使得旋转后文字更好看。

4811 0

「R」ggplot2 去掉坐标留余

ggplot2 在绘图的时候，会在数据的边界部分进行留余操作（base plot 也会这么做），这样使得数据不会落到坐标轴的边界甚至超出边界，大多数情况这是好的。...但较真的我们往往在绘图时想要去掉这个留余，我在之前的文章《分析与可视化ROC——plotROC、pROC》就用到过，用来去掉连续数值轴的留白。 ? ?...离散轴也是可以去掉这个留白的，这类问题其实都需要修改 ggplot2 的标尺，即以scales_开头的函数。通过上面的代码我们可以进行类推，下面使用 ggplot2 提供的示例数据看一个例子。...可以看到上面的图像是有留白的，下面尝试去掉它： > d + scale_x_discrete(expand = c(0, 0)) + scale_y_discrete(expand = c(0, 0))...这种易理解、易使用的特性是和 ggplot2 的语法和良好 API 分不开的。

1.4K3 0

您找到你想要的搜索结果了吗？

是的

没有找到

R语言ggplot2作图离散变量更改坐标轴范围

(ggplot2) library(see) ggplot(data=df,aes(x=gene_name,y=variable))+ geom_tile(aes(fill=value))+ scale_fill_social_c...() image.png 增加y轴的上下空白 ggplot(data=df,aes(x=gene_name,y=variable))+ geom_tile(aes(fill=value))+...value))+ scale_fill_social_c()+ scale_y_discrete(expand=expansion(mult=c(1,0))) image.png 如果是要更改x轴左右的间距把...scale_y_discrete()换成scale_x_discrete()就可以了这个有啥用，其中一个用途是画环状热图的时候可以增加中间的空白区域比如默认环状热图 ggplot(data=df,aes...coord_polar()+ scale_fill_social_c()+ theme_void()+ scale_y_discrete(expand=expansion(mult=c(1,0)))+ scale_x_discrete

3.3K4 0

R语言ggplot2科研数据数据可视化实用手册~第八章热图（heatmap）

和宽格式数据，ggplot2作图的输入数据都是长格式数据，长格式数据如下，一列x，一列y，还有一个数据宽格式数据截图如下这个长宽格式转化是ggplot2作图必须理解的一个概念 R语言里提供了长宽格式数据互相转化的函数...6 这个是最基本的长宽格式数据转换，如果数据集有很多列，有时候转换会相对比较复杂，这里就不做介绍，因为我也搞不懂有时候 8.2 ggplot2热图以下介绍ggplot2做热图的代码都是假设已经拿到了长格式数据...=dat01,aes(x=gene_name,y=Sample))+ geom_tile(aes(fill=expr_value),color=NA) 热图经常遇到的操作是调整坐标轴的顺序，这个可以通过赋予因子水平来实现...，y轴左右，x轴是上下 library(readxl)dat01scale_x_discrete(position

3.6K2 0

R-sysfonts+showtext包 -告别windows字体添加的烦恼

(limits = c("A","B","C","D","E")) + # X轴坐标名称 theme(axis.text.x = element_text(size = 10, color = "...) + # 条形图的位置，柱子宽度 scale_fill_hue(labels = c("组一","组二")) + scale_x_discrete(limits = c("A","B",..."C","D","E")) + # X轴刻度名称 theme(axis.text.x = element_text(size = 10, color = "black", face = "bold...或者也可以： showtext_auto() # 全局自动使用 library(ggplot2) ggplot(Bar,aes(x = group,y = value,fill = Cohort))...(limits = c("A","B","C","D","E")) + # X轴刻度名称 theme(axis.text.x = element_text(size = 10, color = "

6.7K2 0

「R」cowplot（二）改变轴位置

从ggplot2的2.2.0版本开始，它本身就支持图形的第二个轴。因此，cowplot的函数switch_axis_position()已经过时了。下面是一些可以用ggplot2实现的例子。...if (packageVersion("ggplot2")>"2.1.0") p1 + theme_bw() + scale_x_continuous(sec.axis = dup_axis())...if (packageVersion("ggplot2")>"2.1.0") p1 + scale_x_continuous(sec.axis = dup_axis()) + scale_y_continuous...only works for ggplot2 2.2.0 or later if (packageVersion("ggplot2")>"2.1.0"){ ggplot(mtcars2, aes(x...= element_text(angle = 90, vjust=0.5, hjust=0)) + scale_x_discrete(position = "top") } ?

1K1 0

R中优雅的处理长标签文本

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝在使用ggplot2包绘制图形时，若轴文本标签过长则非常难受需要经过处理才能完美的嵌合图形。...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(patchwork) 创建数据 df <- tibble( x = c("This is a *very &……longggggg...super * duper long label", "Yet ANOTHER incredibly long long long long label"), y = c(10, 20, 30) ) 使用scale_x_discrete...❝这种方法直接在坐标轴设置中处理长标签，优点是代码更简洁，无需修改原始数据。...❞ p1 x, y)) + geom_col() + scale_x_discrete(labels = scales :: label_wrap(15)) 案例2

1.4K1 0

一个通路居然在上下调基因集里面都富集到了

identity", width=0.8) + scale_fill_gradient(low="#3685af",high="#af4236",guide = FALSE) + scale_x_discrete...) library(ggsci) df[df$group %in% "down",]$pvalue <- df[df$group %in% "down",]$pvalue*-1 # 调整y轴 df[duplicated...# 设置因子 df$pathway <- factor(df$pathway,levels = df[order(df$pvalue,decreasing = T),"pathway"]) # 更改y轴坐标...pathway,y=pvalue, fill=factor(group)))+geom_bar(stat="identity")+coord_flip( )+ scale_x_discrete(...发起一个讨论这样的在上下调基因集里面都富集到了的通路，大家会如何解释？另外，广大的粉丝朋友们是不是可以推陈出新，给出来其它解决方案？

2.7K3 0

ggplot2画KEGG富集柱形图

后面我觉得还是自己用ggplot2画吧，反正这个包里面一键绘图也是根据ggplot2来的。...#加载ggplot2包 library(ggplot2) #一键清除 rm(list=ls()) #读取功能富集结 kegg <- read.csv("KEGG-enrich.csv",stringsAsFactors...Description,y=count,fill=padj)) #coord_flip()颠倒坐标轴 p1 <- p + geom_bar(stat="identity") + coord_flip(...gray'), axis.text.y=element_text(color="black",size=12)) #ylim(0,30) 更改横坐标的范围这里坐标轴颠倒了...，虽然看起来是x轴，但其实是y轴 p3 <- p2 + ylim(0,30) + scale_fill_gradient(low="red",high="blue") p4 scale_x_discrete

6.4K3 0

跟着Cell学作图：R语言ggplot2做蜂群图的简单小例子

github.com/liushanlin/rhinoceros-comparative-genome 今天的推文我们来重复一下论文中的 Figure3A image.png 论文里提供的代码是使用ggplot2...对Y坐标轴进行一些设置 plota = plot + scale_y_continuous(limits = c(0,0.01), name = "heterozygosity...0.0001,0.0001), labels = scales::percent) + labs(fill="",shape="") plota image.png 对X坐标轴进行一些设置和手动更改填充颜色...plotb = plota + scale_fill_manual(values = c("#E69F00", "#999999"))+ scale_x_discrete(name =...大家有知道的吗？欢迎留言指出！

1.9K3 0

ggplot2包图形参数(坐标轴、分面、配色)整理

本文根据《R数据可视化手册》整理ggplot2包的图形参数（图形外观、注解、图例、坐标轴、分面、配色）。...调整参数limits可以设定x轴范围 scale_y_continuous(limits=c(0, 10)) # 设定范围0-10，x轴同理注意：ggplot2包有两种设置值域的方式，第一种是修改标度...scale_x_discrete(limits=c("trt1","ctrl","trt2")) 如忽略因子中某些类别，则输入：limits=c("trt1","ctrl") 反转因子顺序 scale_x_discrete...轴标签，但是会留出空间，表示存在空白文本 # 以上y轴同 4.7.2 修改坐标轴标签文本 xlab() # 修改x轴标签文本 ylab() # 修改y轴标签文本 labs(x = "x轴标签", y...= "y轴标签") scale_x_continuous(name="x轴标签") # scale_y_continuous()、scale_x_discrete()也适用 4.7.3 修改坐标轴标签外观

13.2K4 1

R语言ggplot2包画曼哈顿图的一个简单小例子

但是如果有数据的话我们自己也可以用ggplot2来做。做曼哈顿图的数据通常是以下这种格式 ?...使用ggplot2画图 library(ggplot2) ggplot(pig60K,aes(x=Chromosome,y=trait1))+ geom_jitter() ?...image.png 这个时候还有一个问题是X轴不是按照1,2,3这样依次排下来的，我们可以通过更改因子水平来给X轴重新排序 df$Chromosome<-factor(df$Chromosome,...hjust=1))+ scale_y_continuous(expand = c(0,0), limits = c(0,10))+ scale_x_discrete...image.png 今天内容的视频版也欢迎大家到B站关注我同名小明的数据分析笔记本，会时不时的更新一些R语言做数据处理和数据可视化的视频，点击阅读原文直达。

2.3K3 0

R语言ggplot2画带有空白格的热图简单小例子

画热图 library(ggplot2) ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+ geom_tile(aes(fill=value),color="black")+ theme...接下来是美化调整一下y轴的的顺序 df1$A<-factor(df1$A,levels = rev(df$A)) ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+ geom_tile...scale_fill_manual(values = c("white","red","red2","red4"))+ theme(panel.background = element_blank()) 将X轴放到顶部...= c("white","orangered","red2","red4"))+ scale_x_discrete(position = "top")+ theme(panel.background...(values = c("white","orangered","red2","red4"))+ scale_x_discrete(position = "top")+ theme(panel.background

3.7K1 0

ggplot2|详解八大基本绘图要素

#使用diamonds的数据子集作为绘图数据，克拉(carat)数为X轴变量，价格(price)为Y轴变量。...2 坐标轴标尺修改（x , y）本部分主要是对坐标轴做如下改变，更改坐标轴名称更改x轴上标数的位置和内容显示对一个轴做统计变换只展示一个区域内的点更改刻度标签的位置实现上面的这些可以使用scale_x...# 横坐标是离散变量，纵坐标是连续变量 p <- ggplot(mtcars, aes(factor(cyl), mpg)) + geom_point() # 更改坐标轴名称 p + scale_x_discrete...("cyl") # 更改横轴标度 p + scale_x_discrete(labels = c("4"="a","6"="b","8"="c")) # 指定横轴顺序以及展示部分 p + scale_x_discrete...#每个分面单独的坐标刻度，单独对x轴设置 #scales参数fixed表示固定坐标轴刻度，free表示反馈坐标轴刻度，也可以单独设置成free_x或free_y p+facet_wrap(~cyl,scales

8.3K1 0

ggplot2分组条形图饼图箱线图

") p + scale_x_discrete(limits=x$X) p + scale_x_discrete(limits=x$X) + scale_fill_brewer(palette = 1...,type = 'seq') p + scale_x_discrete(limits=x$X) + scale_fill_brewer(palette = 2,type = 'seq') p + scale_x_discrete...(limits=x$X) + scale_fill_brewer(palette = 2,type = 'div') p + scale_x_discrete(limits=x$X) + scale_fill_brewer...') p + scale_x_discrete(limits=x$X) + scale_fill_brewer(palette = 'Set2',type = 'div') p + scale_x_discrete...写在最后：有时间我们会努力更新的。

1K1 0

分组、离断式坐标轴

ggplot2已经非常好用了，但是大家对美的追求是永无止境的，比如对于坐标轴，有人可能更喜欢base r那种，base r的很多默认图形，坐标轴都是分离的，比如这种： barplot(c(20,30,40,50,60...x轴和y轴分开/离断式坐标轴 ggprism实现 ggh4x实现双坐标轴嵌套坐标轴 x轴和y轴分开/离断式坐标轴 ggprism实现先介绍基于ggprism的实现方式，这个包原本是用于模仿Graphpad...（05） library(ggprism) library(ggplot2) library(patchwork) 其中prism_offset可以实现x轴和y轴分开；通过prism_bracket...x轴分开 p2 scale_x_discrete(guide = "prism_bracket") p1 + p2 plot of chunk unnamed-chunk-3 ggprism...unnamed-chunk-5 双坐标轴众所周知，ggplot2现在默认支持双坐标轴了，ggh4x为第2条坐标轴添加了更多自定义选项。

1.7K2 0

可视化—KEGGGO分析结果气泡图美化

以小鼠基因为例1.KEGGlibrary(org.Mm.eg.db)library(clusterProfiler)library(ggplot2)library(stringr)length(target_gene...axis.title.x = element_text(size = 10, color = "darkgreen"), # x轴标题颜色 axis.text.x = element_text...(size = 12, color = "black"), # x轴标签颜色 axis.text.y = element_text(size = 12, color = "black"), # y...(size = 10, color = "brown") # 图例标签颜色 ) + scale_x_discrete(labels = function(dat) str_wrap(dat, width...GeneRatio", title = "GO Enrichment", fill = bquote("-"~Log[10]~"(Pvalue)"), size = "Gene Count") + scale_x_discrete

8521 0

ggplot2优雅绘制热图添加双箭头注释

❝本节来介绍如何使用「ggplot2」来绘制热图并添加双向箭头添加注释，下面小编通过一个案例来进行展示，图形仅供展示用，希望各位观众老爷能够喜欢。。...labs(x=NULL,y=NULL)+ # 移除x和y轴标签 scale_y_discrete(expand=c(0,0),position="right")+ # 设置y轴 scale_x_discrete...(expand=c(0,0))+ # 设置x轴 scale_fill_gradient2(mid="#FBFEF9",low="#0C6291",high="#A63446") + # 设置填充颜色...coord_cartesian(clip = "off") + # 再次关闭坐标轴裁剪（可能是重复的步骤） theme_test()+ # 使用theme_test主题 theme(axis.text.x...=element_text(color="black",size=8,face="bold",angle = 90,vjust=0.5), # 自定义x轴文本 axis.text.y=

9283 0

ggplot2散点图直方图条形图

Size vs Gene Number",x="Genome Size",y="Genes") ggplot2 绘制基因组大小与基因数目相关性图二、直方图 x x=chr,y=length)) + geom_bar(stat = 'identity')+ scale_x_discrete(limits=x$chr[1:24]) x %>% dplyr:...:slice(1:24) %>% ggplot(aes(x=chr,y=length,fill=chr)) + geom_bar(stat = 'identity')+ scale_x_discrete...x=chr,y=length)) + geom_bar(stat = 'identity')+ scale_x_discrete(limits=x$chr[1:24]) + coord_flip()...guides(fill='none') ggplot2 绘制人染色体长度分布图写在最后：有时间我们会努力更新的。

6922 0

R语言ggplot2画右三角方块热图的简单小例子

library(readxl) df5<-read_excel("Cor/exampledf.xlsx", sheet = "Sheet5") df5 library(ggplot2...,variable.name="y") %>% na.omit() -> dftmp 自定义x，y轴的顺序，通过改变因子水平来实现 dftmp$xx,...= element_blank())+ scale_x_discrete(position = "top")+ scale_y_discrete(position = "right")+...starshape=16)+ theme_minimal()+ theme(panel.grid = element_blank())+ scale_x_discrete(position...image.png 今天的次条推文还是广告，这篇推文的示例数据和代码会放到次条推文的留言区

3.7K3 0

点击加载更多

这个方法无需旋转就可使得横轴坐标不重叠！

「R」ggplot2 去掉坐标留余

R语言ggplot2作图离散变量更改坐标轴范围

R语言ggplot2科研数据数据可视化实用手册~第八章热图（heatmap）

R-sysfonts+showtext包 -告别windows字体添加的烦恼

「R」cowplot（二）改变轴位置

R中优雅的处理长标签文本

一个通路居然在上下调基因集里面都富集到了

ggplot2画KEGG富集柱形图

跟着Cell学作图：R语言ggplot2做蜂群图的简单小例子

ggplot2包图形参数(坐标轴、分面、配色)整理

R语言ggplot2包画曼哈顿图的一个简单小例子

R语言ggplot2画带有空白格的热图简单小例子

ggplot2|详解八大基本绘图要素

ggplot2分组条形图饼图箱线图

分组、离断式坐标轴

可视化—KEGGGO分析结果气泡图美化

ggplot2优雅绘制热图添加双箭头注释

ggplot2散点图直方图条形图

R语言ggplot2画右三角方块热图的简单小例子

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

社区

活动

圈层

关于

腾讯云开发者

热门产品

热门推荐

更多推荐