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基于R的竞争风险模型的列线图

作者:科研猫 | 西红柿 责编:科研猫 | 馋猫 背景 将竞争风险模型的cmprsk包加载到R中,使用cuminc()函数和crr()函数可以进行考虑竞争风险事件生存数据的单变量分析和多变量分析。...以往推文我们已经详细描述了基于R语言的实现方法,这里不再赘述。那么,您如何看待竞争风险模型呢?如何绘制竞争风险模型的列线图?在这里,我们演示如何绘制基于R的列线图。...主要原因是,如果哑变量出现在列线图中,结果将难以解释清楚。 因此,应避免在列线图中使用哑变量。 regplot包中的regplot()函数可以绘制更多美观的列线图。...mstate包中crprep()函数的主要功能是创建此加权数据集,如下面的R代码所示。然后,我们可以使用coxph()函数拟合加权数据集的竞争风险模型,再将其给regplot()函数以绘制列线图。...R中的riskRegression包可以对基于竞争风险模型构建的预测模型进行进一步评估,例如计算C指数和绘制校准曲线等。

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【Python】基于多列组合删除数据框中的重复值

本文介绍一句语句解决多列组合删除数据框中重复值的问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3列的数据框,希望根据列name1和name2组合(在两行中顺序不一样)消除重复项。...import numpy as np #导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 df =...如需数据实现本文代码,请到公众号中回复:“基于多列删重”,可免费获取。 得到结果: ?...从上图可以看出用set替换frozense会报不可哈希的错误。 三、把代码推广到多列 解决多列组合删除数据框中重复值的问题,只要把代码中取两列的代码变成多列即可。...numpy as np #导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 name = pd.read_csv

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    R中的sweep函数

    函数的用途 base包中的sweep函数是处理统计量的工具,一般可以结合apply()函数来使用。...函数的参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理的原数据集 MARGIN:对行或列,或者数列的其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体的例子来看 #创建一个4行3列的矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行的均值 #方法一,通过rowMeans函数来计算每一行的均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一行的均值,MARGIN=1,对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行列都减去这一列的均值...#方法一,通过colMeans函数来计算每一列的均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二,通过apply函数来计算每一列的均值,MARGIN=2,对列做操作 sweep(M,2,

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    R中的替换函数gsub

    R中gsub替换函数的参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...vector举例如下: > x R Tutorial","PHP Tutorial", "HTML Tutorial") > gsub("Tutorial","Examples",x) #将...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他的一些例子来灵活使用这个函数,结合正则表达式。...,我们知道组织病理分期分成stage I,stage II,stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组,并转换成因子 我们使用gsub函数...,并转换成因子 我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾的A,B或者C等字母,例如Stage IIIA,Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage

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    MySQL索引中的前缀索引和多列索引

    正确地创建和使用索引是实现高性能查询的基础,本文笔者介绍MySQL中的前缀索引和多列索引。...,因为MySQL无法解析id + 1 = 19298这个方程式进行等价转换,另外使用索引时还需注意字段类型的问题,如果字段类型不一致,同样需要进行索引列的计算,导致索引失效,例如 explain select...第二行进行了全表扫描 前缀索引 如果索引列的值过长,可以仅对前面N个字符建立索引,从而提高索引效率,但会降低索引的选择性。...前缀字符个数 区分度 3 0.0546 4 0.3171 5 0.8190 6 0.9808 7 0.9977 8 0.9982 9 0.9996 10 0.9998 多列索引 MySQL支持“索引合并...); Using where 复制代码 如果是在AND操作中,说明有必要建立多列联合索引,如果是OR操作,会耗费大量CPU和内存资源在缓存、排序与合并上。

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    Power Query中批量处理列的函数详解

    ; 第2参数是需要改变的列及操作(正常情况是由列名和操作函数组成,也可以是空列表); 第3参是去除第2参数中指定后剩余的列所需要进行处理的函数; 第4参数是找不到第2参数指定的列标题时是忽略处理(1)还是返回错误处理...---- 例1: 此函数的必要参数只有2个,所以我们先用最基础的2个参数来进行操作。 ? 如果要把成绩统一减10分的话,那就在第2参数这里使用列名和对应的操作函数即可。...例3 第3个参数是一个函数,是在第2参数指定列以外表格中的所有列需要进行的操作。 在前面的操作中,成绩列和学科列都有了操作,那剩余其他列(姓名列)也需要进行操作,那就要使用到第3参数了。...如果第2参数的中的学科写错或者定义了其他未在操作表中的列名,则可以通过第4参数来控制返回。...因为指定的列里有 “班级”,但是在原来的表格中不存在,所以会产生错误,但是第4参数有指定1,也就是忽略错误,最终返回的结果如图所示。除了找到的成绩列表外,其余的列数据都在后面添加了个“A”。 ?

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    R中的stack和unstack函数

    我们用R做数据处理的时候,经常要对数据的格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样的功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠,就像下面这张图展示的这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样的功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框的第二列的分组信息,将第一列的数据划分到各个组,是一个去堆叠的过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体的例子 例如现在我们手上有一个数据框,里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 中的内容,第一列是重量,第二列是不同的处理方式...,后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实的应用案例,敬请期待。

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    R中的grep和grepl函数

    在日常数据分析的过程中,我们经常需要在一个字符串或者字符串向量中查找是否包含我们要找的东西,或者向量中那几个元素包含我们要查找的内容。...这个时候我们会用到R中最常用的两个函数,grep和grepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的,在linux中模式匹配也用grep这个函数,前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grep和grepl这两个函数的用法。 这两个函数最大的区别在于grep返回找到的位置,grepl返回是否包含要查找的内容。接下来我们结合具体的例子来讲解。...☞讨论学习R的grepl函数 参考资料: ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习R的grepl函数

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    使用VBA删除工作表多列中的重复行

    标签:VBA 自Excel 2010发布以来,已经具备删除工作表中重复行的功能,如下图1所示,即功能区“数据”选项卡“数据工具——删除重复值”。...图1 使用VBA,可以自动执行这样的操作,删除工作表所有数据列中的重复行,或者指定列的重复行。 下面的Excel VBA代码,用于删除特定工作表所有列中的所有重复行。...如果只想删除指定列(例如第1、2、3列)中的重复项,那么可以使用下面的代码: Sub DeDupeColSpecific() Cells.RemoveDuplicates Columns:=Array...(1, 2, 3), Header:=xlYes End Sub 可以修改代码中代表列的数字,以删除你想要的列中的重复行。...注:本文学习整理自thesmallman.com,略有修改,供有兴趣的朋友参考。

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    五大方法添加条件列-python类比excel中的lookup

    40,100) for i in range(60)]).reshape(20,3),columns=["语文","数学","英语"]) df['总成绩'] = df.sum(axis=1) df 添加一列条件列...这个函数依次接受三个参数:条件;如果条件为真,分配给新列的值;如果条件为假,分配给新列的值 # np.where(condition, value if condition is true, value...-np.select # 方法四 np.select # np.select()的函数,给它提供两个参数:一个条件,另一个对应的等级列表。...# 在conditions列表中的第一个条件得到满足,values列表中的第一个值将作为新特征中该样本的值,以此类推 df6 = df.copy() conditions = [ (df6['...,是进行分组的依据, 如果填入整数n,则表示将x中的数值分成等宽的n份(即每一组内的最大值与最小值之差约相等); 如果是标量序列,序列中的数值表示用来分档的分界值 如果是间隔索引,“ bins”的间隔索引必须不重叠

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    Excel公式技巧:基于单列中的多个条件求和

    标签:Excel公式,SUMPRODUCT函数 基于列中的条件求和通常使用SUMIF函数或者SUMIFS函数,特别是涉及到多条件求和时。然而,随着条件的增多,公式将会变得很长,难以理解。...而使用SUMPRODUCT函数,可以判断同一列中的多个条件且公式简洁。 如下图1所示的示例。...*($C$2:$C$12)) 公式中,使用加号(+)来连接条件,表明满足这两个条件之一。...也可以使用下面更简洁的公式: =SUMPRODUCT(($A$2:$A$12="东区")*(($B$2:$B$12={"超市1","超市2"}))*($C$2:$C$12)) 公式中,使用了花括号,允许在其中放置多个条件...,因此,如果需要满足的条件更多的话,就可以通过逗号分隔符将它们放置在花括号中,公式更简洁。

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    巧用R中的各种排名窗口函数

    函数对比 SQL中窗口函数语句中over语句中两个关键词:partition by和order by,R语言中也有与之一一对应的函数: ?...1 row_number函数 R语言中的row_number函数与sql中的row_number函数相同,对group_by后面字段进行分组,按照order_by后面字段排序,生成一个连续不重复的编码...2 min_rank函数 R语言中的min_rank函数与sql中的rank函数相同,row_number函数对order_by后面字段相同的记录编码是不同的,min_rank就是解决这个问题,对相同的记录编码相同...同样得到与sql中相同的输出结果: ? 4 ntile函数 R语言中的ntile函数与sql中的ntile函数相同,把每一组分成几块,块数由参数n决定: ?...总结 简单介绍R语言中4个排名窗口函数,函数名几乎与sql中的4个排名窗口函数一样(除了min_rank与rank),但R语言的排名窗口函数的输出结果与sql中的输出结果有点不同:R语言的数据结果不改变原来的数据顺序

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    Python基于Excel多列数据绘制动态长度的折线图

    本文介绍基于Python语言,读取Excel表格数据,并基于给定的行数范围内的指定列数据,绘制多条曲线图,并动态调整图片长度的方法。   首先,我们来明确一下本文的需求。...现有一个.csv格式的Excel表格文件,其第一列为表示时间的数据,而靠后的几列,也就是下图中紫色区域内的列,则是表示对应日期的属性的数据;如下图所示。   ...我们现在希望,对于给定的行数起始值与结束值(已知这个起始值与结束值对应的第一列数据,肯定是一个完整的时间循环),基于表格中后面带有数据的几列(也就是上图中紫色区域内的数据),绘制曲线图;并且由于这几列数据所表示的含义不同...,希望用不同颜色、不同线型来表示每一列的数据。...首先,通过plt.figure(figsize = ((idx_end - idx_start) * 0.45, 5))动态设置图片尺寸,使用plt.plot()函数绘制每个指标的预测值和实际值;同时,

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    Python基于Excel多列长度不定的数据怎么绘制折线图?

    本文介绍基于Python语言,读取Excel表格数据,并基于给定的行数范围内的指定列数据,绘制多条曲线图,并动态调整图片长度的方法。  首先,我们来明确一下本文的需求。...现有一个.csv格式的Excel表格文件,其第一列为表示时间的数据,而靠后的几列,也就是下图中紫色区域内的列,则是表示对应日期的属性的数据;如下图所示。  ...我们现在希望,对于给定的行数起始值与结束值(已知这个起始值与结束值对应的第一列数据,肯定是一个完整的时间循环),基于表格中后面带有数据的几列(也就是上图中紫色区域内的数据),绘制曲线图;并且由于这几列数据所表示的含义不同...,希望用不同颜色、不同线型来表示每一列的数据。...首先,通过plt.figure(figsize = ((idx_end - idx_start) * 0.45, 5))动态设置图片尺寸,使用plt.plot()函数绘制每个指标的预测值和实际值;同时,

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