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    NC单细胞文章复现(七):Gene expression signatures(2)

    我们今天继续探索这3个gene signatures,首先看它在不同clusters的细胞之间的表达分布。...可以看到这3个gene signatures没有重叠的基因,并且它们来源不同,但这3个 gene signatures均在clusters 2亚群中都高表达。...今天这一部分,作者主要是想跟临床预后联系到一起,于是选取了3个有代表性的数据集gene signature,对868个上皮细胞的5个clusters进行探索,结果提示clusters2具有与其他clusters...不同的特征,接着对clusters2进行进一步探索。...结果显示高表达clusters2的肿瘤与OS显著负相关相关性。相反,但是在三个gene signatures中的预后则无统计学意义。此外,clusters1、3、4和5的基因无法预测临床结果。

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